微生物多样性/扩增子测序
微生物扩增子测序主要通过直接扩增环境总 DNA 的特定区域,绕过微生物培养瓶颈,高效评估多样品环境微生物分布、丰度变化和群落组成情况。随着高通量测序技术的不断发展,微生物扩增子测序技术已成为环境微生物群落比较和差异分析的主流研究手段之一。
针对不同研究需求,一般选择扩增 16S 高变区来区分环境样品的细菌和古菌群落,ITS 区域扩增用以评估真菌群落,原生动物等为主的真核微生物群落研究可通过 18S 高变区测序来实现 。此外,也可通过特定的功能基因测序等来揭示特定功能相关的环境微生物群落分布。
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