DAP-seq效应因子、转录因子、调控因子、未知蛋白结合位点
DAP-seq(体外chip-seq){可同时做RNA-seq,以及DAP-seq和RNA-seq联合分析}
DAP-seq实验步骤:载体构建-体外蛋白表达-DNA文库构建-亲和纯化-上机测序-数据分析。
ChIP-seq通常在规模上受到限制,难以进行高通量扩展。因此,只有少数转录因子可以获得结合位点信息,大量TFBS的覆盖范围仅适用于人类和一些模式生物。
DAP-seq具有与ChIP-seq同样的功能。通过体外蛋白表达技术,表达出带有标签的转录因子,和基因组DNA文库在体外进行结合,然后分离出所有与转录因子结合的DNA,再使用高通量测序,找到转录因子的结合位点。
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DAP-seq的优势
与ChIP-seq相比,DAP-seq不需要针对每个转录因子制备特异性抗体。具有快速、高通量、节约时间成本的优势,并且适用于所有的真核生物。
蓝景科信提供DAP-seq全流程技术服务+个性化数据分析,具有丰富的技术服务经验。
已经做过的材料包括:拟南芥,水稻,小麦,玉米,大豆,苜蓿,百脉根,菜心,枣,荔枝,香蕉,毛果杨,胡杨,油松
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