Mod Spec ®服务
Mod Spec®是一种质谱分析方法,用于测定超过80种不同组蛋白修饰的相对丰度。Mod Spec®用于研究疾病响应和药物施用引起的表观变化是个不错的选择。检测得到的大量组蛋白修饰信息可帮助研究人员确定预期的表观变化,而且还能够帮助研究人员发现意想不到的变化,这可能会为研究提供更多有用且有趣的信息。
将收集好的细胞或组织交给我们Active Motif,我们将完成组蛋白提取、上机样品的准备、利用Thermo Scientific TSQ Quantum Ultra三重四极杆质谱联用仪进行样品的质谱分析。所有样本一式三份,数据以易于理解的格式呈现。在样本提交后的4-6周内我们将为您交付数据。
样本要求:Mod spec®可检测的组蛋白修饰 | ||
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H1.4: K25UN | H1.4: K25AC | H1.4: K25ME1 |
H1.4: K25ME2 | H1.4: K25ME3 | ^H2A: K5UN |
^H2A: K5AC | ^H2A: K9UN | ^H2A: K9AC |
^H2A: K36UN | ^H2A: K36AC | ^H2A1: K13UN |
^H2A1: K13AC | ^H2A1: K15UN | ^H2A1: K15AC |
^H2A1: K15UB | ^H2A3: K13UN | ^H2A3: K13AC |
^H2A3: K15UN | ^H2A3: K15AC | ^H2A3: K15UB |
*H3R2UN: K4UN | *H3R2UN: K4AC | *H3R2UN: K4ME1 |
*H3R2UN: K4ME2 | *H3R2UN: K4ME3 | H3R2UN: Q5UN |
H3R2UN: Q5ME1 | H3: K9UN | H3: K9AC |
H3: K9ME1 | H3: K9ME2 | H3: K9ME3 |
H3: K14UN | H3: K14AC | H3: K18UN |
H3: K18AC | H3: K18ME1 | H3: Q19UN |
H3: Q19ME1 | H3: K23UN | H3: K23AC |
H3: K23ME1 | H3: R42UN | H3: R42ME2 |
H3: R49UN | H3: R49ME2 | H3: Q55UN |
H3: Q55ME1 | H3: K56UN | H3: K56AC |
H3: K56ME1 | H3: K64UN | H3: K64AC |
H3: K79UN | H3: K79AC | H3: K79ME1 |
H3: K79ME2 | H3: K79ME3 | H3: K122UN |
H3: K122AC | ♦H3.1: K27UN | ♦H3.1: K27AC |
♦H3.1: K27ME1 | ♦H3.1: K27ME2 | ♦H3.1: K27ME3 |
♦H3.1: K36UN | ♦H3.1: K36AC | ♦H3.1: K36ME1 |
♦H3.1: K36ME2 | ♦H3.1: K36ME3 | H3.3: K27UN |
H3.3: K27AC | H3.3: K27M | H3.3: K27ME1 |
H3.3: K27ME2 | H3.3: K27ME3 | H3.3: K36UN |
H3.3: K36AC | H3.3: K36ME1 | H3.3: K36ME2 |
H3.3: K36ME3 | H4: K5UN | H4: K5AC |
H4: K8UN | H4: K8AC | H4: K12UN |
H4: K12AC | H4: K16UN | H4: K16AC |
H4: K20UN | H4: K20AC | H4: K20ME1 |
H4: K20ME2 | H4: K20ME3 |
^ 多种H2A亚型可能有贡献了H2A修饰的信号
* H3R2me2和H3K4me2/3是相互排斥的修饰。H3R2甲基化阻止H3K4甲基化。因此,H3K4修饰仅在H3R2未修饰肽上呈现。有关更多信息,请参阅 Nature. 2007 Oct 18; 449(7164):933-7.
♦ H3.2可能会显示出H3.1的信号
Mod Spec ®服务数据示例
GSK126是一种阻断EZH2甲基转移酶活性的抑制剂,导致H3K27me2和H3K27me3的整体降低。A) 从Active Motif的Mod Spec®分析中可以选择H3修饰,确认H3K27甲基化显著降低,同时乙酰化和未修饰的H3K27(以黄色突出显示)增加。还检测到H3K36的变化(以红色突出显示)。B) 选择的H4修饰对GSK126处理的反应没有显示出显著的变化。
图2:Mod Spec®数据来自对照HEK293细胞和用5 mM丁酸钠(NaB)处理6小时的HEK293细胞。
NaB是一种通用的HDAC抑制剂,NaB处理可提高组蛋白乙酰化水平。左图 显示了选择乙酰化和未修饰组蛋白位点的Mod Spec®数据。处理后所有位点的乙酰化都增加。未经修饰的肽在某些位置有信号,这些位置并在NaB处理后显示相应的减少。B) 不同组蛋白残基的甲基化不受NaB处理的影响。
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