ATAC-seq分析
基本信息
服务名称：
ATAC-seq分析
英文名称：
ATAC-seq
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服务商：
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554
更新日期：
2024-12-27
服务类别：
服务详情
ATAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing）是使用高通量测序对 Tn5 转座酶可接近的核染色质区域进行测序分析的一种研究技术；该技术由美国斯坦福大学的研究人员开发，2013 年首次发表在 Nature Methods（Buenrostro et al., 2013）。通过转座酶对特定时空下开放的核染色质区域进行切割，获得在该时空下基因组中所有活跃转录的调控序列。
ATAC-seq 技术可以进行样本之间差异的染色质开放位点的比较，通常并不单独使用。作为检测表观遗传-染色质开放状态现象的方式，与样本基因表达谱紧密相连，从靶标基因的表观状态关联到表达水平，具有强大的数据挖掘作用。此外，通过关联基因组、外显子，染色质免疫共沉淀（组蛋白修饰或转录因子结合）测序信息，形成： 表观调控-基因组-基因表达的完整调控链。
技术优势： 1.常量样本至少需要5万个细胞，微量样本低至100个细胞（适用于稀有样本） 2.技术重复性好，成功率高 3.实验步骤简单，周期短 4.获得信息量大（全基因组开放染色质区域）
物种经验： 1.多物种：多种动植物、模式生物和非模式生物 2.多器官组织类型：健康器官、疾病模型组织 3.多样品类型：新鲜、冻存、固定
研究应用： 1.染色体开放性图谱绘制(所有物种适用) 2.胚胎发育表观遗传修饰(胚胎学发育研究) 3.肿瘤发生表观机制研究(肿瘤标记及病理研究) 4.疾病潜在标志物的预测(病理及生物标记) 5.肿瘤异质性或分型研究(肿瘤分型与微环境研究) 6.作物表观修饰差异研究(包括水稻、玉米、小麦等)。
ATAC-seq 技术可以进行样本之间差异的染色质开放位点的比较，通常并不单独使用。作为检测表观遗传-染色质开放状态现象的方式，与样本基因表达谱紧密相连，从靶标基因的表观状态关联到表达水平，具有强大的数据挖掘作用。此外，通过关联基因组、外显子，染色质免疫共沉淀（组蛋白修饰或转录因子结合）测序信息，形成： 表观调控-基因组-基因表达的完整调控链。
技术优势： 1.常量样本至少需要5万个细胞，微量样本低至100个细胞（适用于稀有样本） 2.技术重复性好，成功率高 3.实验步骤简单，周期短 4.获得信息量大（全基因组开放染色质区域）
物种经验： 1.多物种：多种动植物、模式生物和非模式生物 2.多器官组织类型：健康器官、疾病模型组织 3.多样品类型：新鲜、冻存、固定
研究应用： 1.染色体开放性图谱绘制(所有物种适用) 2.胚胎发育表观遗传修饰(胚胎学发育研究) 3.肿瘤发生表观机制研究(肿瘤标记及病理研究) 4.疾病潜在标志物的预测(病理及生物标记) 5.肿瘤异质性或分型研究(肿瘤分型与微环境研究) 6.作物表观修饰差异研究(包括水稻、玉米、小麦等)。
公司简介
上海海昆盟生物科技有限公司 (Coweldgen Scientific Co.，Ltd) 是一家专注于生命科学领域提供相关试剂产品和服务的生物高科技企业，坐落于上海聚科生物产业园。公司提供种类齐全的细胞系、质量稳定的细胞培养试剂产品、成熟高效的技术服务、专业周到的技术支持。本着“守正创新，科学严谨”的理念，我们以高标准塑造行业品牌，以全新视野构建现代企业，勇于探索和创新。公司业务范围涉及全国各省市自治区，与国内多家医院、高校、科研院所、生物科技公司建立了良好的合作关系，赢得了良好的市场声誉和广泛的认可，我们保证将继续为广大科研用户提供专业、高效、优质的产品及服务！
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