测序/合成

MassARRAY核酸质谱基因分型检测

基本信息
服务名称:
MassARRAY核酸质谱基因分型检测
英文名称:
参考报价:
总点击数:
423
更新日期:
2023-04-20
服务类别:

服务详情
Agena Bioscience公司推出的MassARRAY系统是全球唯一可以直接检测核酸的桌面式质谱仪。MassARRAY系统,主要是针对检测DNA靶标数量需求在十几个到几百个位点,可实现中通量,低成本,短周期,高精准的基因分型。其实验操作和数据分析简单,目前可检测的变异类型包括:点突变、插入/缺失、拷贝数变异、基因融合、甲基化。应用范围覆盖药物基因组学、遗传性疾病、肿瘤及液体活检、传染性疾病等各个领域。
 

MassARRAY系统检测原理

MassARRAY系统检测基因分型的核心原理是多重PCR+单碱基延伸+质谱飞行检测,最终由于不同碱基的分子质量差,导致其在质谱飞行的过程中,分子质量大的飞行速度慢,最后根据出峰的位置,判断碱基类型。

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图片1-1

通过多重PCR,扩增出含有检测靶标的DNA序列,目前我们一个孔可以做到40重PCR反应,即在一个孔里,我们可以检测40个靶标位点。

通过iPLEX技术进行单碱基延伸,针对某一个检测靶标,由于我们的延伸引物序列是一样的,所以针对该检测靶标,只有延伸的末端目标碱基一个碱基的差异。后续我们就是根据末端目标碱基的质量差来进行基因分型的。

图片1-2

将单碱基延伸后的产物进行纯化,然后移到SpectroCHIP芯片上,进行质谱检测。打质谱的原理如下图所示,DNA被激光照射带正电,在检测的真空管中飞行,飞行速度与各个延伸产物的质量成反比,最后通过出峰的位置,判定碱基类型,从而实现基因分型。
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MassARRAY系统检测结果

MassARRAY系统的检测结果会给出直接的峰图,一目了然的判定检测靶标的基因型,结果精确,稳定。如下图所示,杂合SNP由于G,T碱基的质量差,会产生两个峰,而纯合的SNP,就只有一个峰。我们根据不同碱基的质量差,来判定该峰的碱基类型。

SNP

MassARRAY系统主要应用领域
领域

MassARRY核酸质谱送样要求

SNP检测:样本浓度为10ng/ul, 样本体积 准备至少5 ul,
A260:280在1.8-2.0,A260:A230  2.0-2.5

公司简介
云准医药科技(上海)有限公司(以下简称:云准)英文名:AccuraMed,用精准和医药相结合。云准成立于2016年,是一家专注于组织生物学标记物检测分析、肿瘤创新药物靶点发现及临床病理免疫诊疗检测方案开发的高科技公司。针对当前热点的肿瘤免疫相关研究致力于为客户提供先进的肿瘤组织免疫微环境分析解决方案。目前我们公司代理Akoya的产品(CODEX平台和Phenoptics平台),并基于此可以提供肿瘤免疫微环境检测相关技术服务。此外云准科技还可以为您提供单细胞+空间多组学技术服务,全方位解析生命的奥秘。云准科技拥有显微切割平台及Thunder活细胞成像平台,为您提供专业的显微切割和Thunder活细胞成像服务。此外我们公司还有配备了3i显微镜成像系统,可以为您提供Marianas LightSheet 成像技术服务和Cleared Tissue LightSheet组织透明化成像服务。此外我们还引进了Agena核酸质谱进行基因分型的检测服务。未来,云准将以创新为驱动力,继续对产品进行深度整合与开发,推动肿瘤免疫、创新免疫疗法和病理诊断技术的突破性发展,必将为肿瘤的诊断和治疗带来革命性变化。

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