分子与细胞

DIA定量蛋白组学服务

基本信息
服务名称：
DIA定量蛋白组学服务
英文名称：
参考报价：
服务商：
上海鹿明生物科技有限公司
总点击数：
250
更新日期：
2024-07-08
服务类别：
分子与细胞
服务详情

数据非依赖采集（data independent acquisition，DIA）是近年来受瞩目的质谱采集技术之一，是定量蛋白质组学新发展。相比于DDA的优势在于高效测定复杂样品中丰度极低的蛋白分子，极大地提高了定量分析的可信度。其原理是在质谱数据采集时，高速、循环的将每个采集窗口内的所有母离子及其子离子碎裂后进行全扫描，而非根据母离子信号强度筛选后进行二级碎片再扫描。因此DIA具有高通量、高分辨率、高可重现性、定量准确等优点，而且样本无需分级上机，极大的缩短了每个样品的检测时间，适合大样本量的蛋白质组研究。但由于DIA获得的是几乎没有丢失的所有离子信息，数据量及其复杂性大大增加，数据分析难度加大。

目前主流的数据分析是基于 DDA/DIA 构建的谱库和实验产生的 数据对样品中的蛋白质进行鉴定和定量。公共的谱库可以从各大蛋白质组研究数据平台下载，但对于一些特异性的样本，为了有更好的鉴定结果，还需要通过实验样本建立DDA参考数据库。

实验原理
提取的蛋白酶解之后，利用液质联用技术对肽段进行质谱分析，通过比较不同样品中相应肽段的信号强度，从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。每条肽段的丰度（量）与其在质谱中的峰面积或信号强度成正比；而不同样品的同一条肽段在LC上的保留时间（retention time， RT）是一致的，因此，可以通过对比谱图库中的信息，再整合到相应蛋白，实现对蛋白质在不同样本中的相对表达水平的定量分析[1, 2]。

 

技术优势

重现性好：采集所有离子及碎片谱图，不丢失信息

选择性好：基于碎片离子（即母子离子对）定量，与 SRM/MRM 相当

准确度高：循环时间固定，扫描点数均匀，定量准确度高

通量高：同时监测所有目标蛋白/ 化合物，通量无上限

时效性强：对于易降解样品可以即刻采集，获得数据后再深入挖掘

数据易追溯：即使目前的水平无法发现某些蛋白/化合物，未来可以回溯

 

 

 

 

 

 

应用领域

 

临床疾病标志物的筛选

作用机制研究

药物作用靶点研究

疾病的分子分型等

 

公司简介
上海鹿明生物科技有限公司（“鹿明生物”），是上海欧易生物医学科技有限公司旗下从事蛋白组及代谢组质谱检测业务的专业质谱组学服务公司。以“鹿明质谱”服务品牌，携手母公司，实现了中心法则上、中、下游多层组学的串联，从基因组、转录组、表观组、微生物组，到蛋白组、代谢组，一起为客户提供全面的创新多组学技术服务。 经过多年发展，鹿明生物建立起了4D-DIA/LFQ/PRM、iTRAQ/TMT、DIA、PRM、修饰蛋白组等蛋白组学技术平台，空间代谢组学、全谱代谢组、靶向代谢组、拟靶向代谢组、脂质组、精准靶向等代谢组学技术平台，以及相应的大数据整合分析平台。通过持续的设备引进、技术开发、流程优化、人才汇聚、管理提升，建立起了成熟的质量标准、严格的质控体系以及科学的服务流程，广泛服务生命科学基础研究、疾病标志物发掘、疾病分型诊断、精准用药、药代药动、药物表征等多个领域。
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