分子与细胞

动物植物基因组大小检测

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动物植物基因组大小检测
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226
更新日期:
2024-09-11
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样本峰值的荧光强度与细胞DNA含量成正比,利用已知基因组大小的样本(如番茄、小麦等做为对照,根据对照样本和待测样本荧光强度的比例关系计算出待测样本的基因组大小。
 


对动物、植物基因组大小进行预估,常用于测序过程中的基因组确认和倍性确认。

已发表项目文章:

Nature Genetics:高质量豌豆参考基因组和泛基因组解析(点击链接)

2022年9月22日,中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用创新团队联合国内外多家合作单位,成功绘制了中国豌豆主栽品种“中豌6号”的基因组高质量精细物理图谱,构建了栽培和野生豌豆泛基因组,解析了豌豆基因组进化特征、群体遗传结构,为揭示豌豆起源驯化,以及基因挖掘、种质创新、育种改良提供了宝贵资源及数据支撑。

该研究中豌豆基因组大小预估由金迪智远生物科技使用德国Sysmex Partec 流式细胞仪(倍性分析仪)完成。

以上科技服务已广泛应用于林木、农作物、花卉、草类等各种植物,以及鱼类、贝类、螃蟹等水生物和蜱虫、蜂类等昆虫分析,已成功助力科研机构实现大量倍性育种突破,其中包括单倍体水稻、多倍体水稻、单倍体玉米、小麦、月季、杨树、杜仲、柑橘、葡萄、桉树、猕猴桃、苹果、西瓜、梨、虹鳟、泥鳅、鲫鱼、鳇鱼、牡蛎、鲍鱼、半滑舌鳎等三倍体,以及单倍体柑橘,双单倍体番茄、茄子、辣椒等。更多应用请点击http://www.goldenfcm.cn/About.aspx?ClassID=19

测试样本可以是植物叶片、种子、愈伤组织、花粉、花、芽、根等,或是水生物、昆虫的各种组织,您仅需要将新鲜样本邮寄给我们,即可在一周之内得到分析结果。

金迪智远生物所采用的德国Sysmex Partec分析技术,已在国际科学界应用多年,累计发表45100余篇SCI收录论文,包括2017年先正达种业发表在Nature的玉米单倍体文章(Kelliher T, Starr D, Richbourg L, et al. MATRILINEAL, a sperm-specific phospholipase, triggers maize haploid induction[J]. Nature, 2017, 542(7639): 105-109.)等,具有广泛的认可度。德国Sysmex Partec在国内的400余家科研用户已发表近百篇SCI收录论文,以下列出部分供您参考,更多论文可按文末联系方式获取。

1. Yang T, Liu R, Luo Y, et al. Improved pea reference genome and pan-genome highlight genomic features and evolutionary characteristics[J]. Nature genetics, 2022: 1-11.

2. Zhang L, Hu J, Han X, et al. A high-quality apple genome assembly reveals the association of a retrotransposon and red fruit colour[J]. Nature communications, 2019, 10(1): 1-13.

3. Qi X, Liu J, Liu Z, et al. High-throughput haploid induction in bisexual-flower species[J]. Plant Communications, 2022: 100454.

4. Zhao Z, Gu H, Sheng X, et al. Genome-wide single-nucleotide polymorphisms discovery and high-density genetic map construction in cauliflower using specific-locus amplified fragment sequencing[J]. Frontiers in plant science, 2016, 7: 334.

5. Chen W H, Tang C Y, Lin T Y, et al. Changes in the endopolyploidy pattern of different tissues in diploid and tetraploid Phalaenopsis aphrodite subsp. formosana (Orchidaceae)[J]. Plant Science, 2011, 181(1): 31-38.

6. Liu Y, Li D, Yan L, et al. The microgeographical patterns of morphological and molecular variation of a mixed ploidy population in the species complex Actinidia chinensis[J]. PloS one, 2015, 10(2): e0117596.

更多信息可扫描二维码添加微信咨询或发邮件至techsupport@goldenfcm.com,欢迎合作!

金迪未来生物科技Ploidy Expert也是金迪智远生物科技旗下企业。
 

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公司简介
金迪智远生物科技(北京)有限公司由数位具有15年以上流式细胞术经验的技术专家创建,着力于为植物、动物育种科研机构和商业公司提供倍性分析仪器采购、实验方案、售后服务及样本测试服务等为一体的整体解决方案。 公司专业团队可为客户提供两类服务,包括动植物育种科技服务和相关科研仪器销售与技术支持。 一、科技服务: 使用德国Sysmex Partec纳米流式细胞仪为您提供动植物倍性检测、基因组大小预估、细胞周期分析技术服务,目前服务客户包括华中农业大学邓秀新院士团队、中科院水生生物研究所桂建芳院士团队、北京林业大学康向阳教授、中科院华南植物园黄宏文研究员等400余家,可进行各种植物、水生物、昆虫检测,助您实现以下几类检测分析: 1.倍性分析鉴定:精确检测该样本是单倍体、二倍体还是三倍体、四倍体等多倍体,对于种质资源、单倍体育种、多倍体育种、非整倍体鉴定具有意义。还可以快速鉴定杂交育种是否成功。 2.基因组大小预估:通过参照物种计算待测样本基因组大小,为之后的基因组测序提供关键信息。 3.细胞周期分析:可量化分析细胞周期的不同阶段,得到G1、S、G2期的细胞比例,对于研究辐射诱变育种,药物处理影响细胞周期变化具有意义。已发表文章包括水稻生长点的细胞周期分析等。 以上三种科技服务已广泛应用于林木、农作物、花卉、草类等各种植物,以及鱼类、贝类、螃蟹等水生物和蜱虫、蜂类等昆虫分析,已成功助力科研机构实现大量倍性育种突破,其中包括杨树、柑橘、葡萄、桉树、苹果、西瓜、梨、虹鳟、泥鳅、鲫鱼、牡蛎、鲍鱼、半滑舌鳎等三倍体,以及单倍体水稻、柑橘,双单倍体番茄、茄子等。 基因组大小测试服务已帮助多家科研机构实现棉花、黄瓜、铁线莲、竹类、螃蟹、湟鱼等多种样本检测,为基因组测序组装提供明确指引。 测试样本可以是植物叶片、种子、愈伤组织、花粉、花、芽、根等,或是水生物、昆虫的各种组织,您仅需要将新鲜样本邮寄给我们,即可在一周之内得到分析结果。 金迪智远生物所采用的德国Sysmex Partec分析技术,已在国际科学界应用多年,累计发表45100余篇SCI收录论文,包括2017年先正达发表在Nature的玉米单倍体文章(Kelliher T, Starr D, Richbourg L, et al. MATRILINEAL, a sperm-specific phospholipase, triggers maize haploid induction[J]. Nature, 2017, 542(7639): 105-109.)等,具有广泛的认可度。德国Sysmex Partec在国内的400余家科研用户已发表近百篇SCI收录论文。

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