可进行天然药物及仿生药物,大规模分子相互作用研究如:
1. 对蛋白质、核酸、小分子、天然产物研究相互作用进行亲和力、动力学的全面分析,如:Ka、Kd、KD、ΔG等等;
2. 筛选能和靶蛋白结合的活性分子,分子对接、虚拟筛选、AI+筛选等;
3. ABPP(Activity-Based Protein Profiling)钓靶技术,药靶筛选药物分子;
4. 复合物的结构和组装顺序的分析。
5.天然产物药物配伍、方证、循证医学为基础的药效及精准医学研究。
不同的分子互作技术各有特点,选择合适的技术取决于研究的具体需求和条件。
SPR:基于芯片表面(PH,分子量,电荷,离子浓度,温度)等离子共振强度表示信号高低,灵敏度较高。
BLI:和spr类似,基于光波干涉形成信号,相对适合大分子蛋白检测。
MST:需要标记荧光分子如CY5,蛋白聚集、构象大小影响大,适合小分子至离子。
ITC:基于互作过程吸放热提供热力学参数(如ΔH、ΔS、ΔG)适合构象稳和小分子。
互作检测范围包括:
蛋白-蛋白、抗体-抗原、蛋白-小分子、抗体-多肽、蛋白-DNA、DNA-DNA、蛋白-纳米材料等分子间相互作用力检测;除了蛋白、抗体外,细胞裂解液、细菌等也可结合垂钓质谱等技术鉴定调控蛋白;也可在药物筛选、医疗诊断、食品检测、血液标志物检测等领域有广泛应用。
注意:样品溶液中如含有NaN3、咪唑、蔗糖、DTT 等物质,需提前告知;如采用氨基偶联的方式检测,蛋白缓冲液中不能含有伯氨基的成分,如Tris 缓冲液。
SPR 检测服务需经评估后确定对应的方案和价格。
分子对接(molecular docking)是依据配体与受体作用的“锁-钥原理” (lock&key principle),模拟配体与受体分子相互作用的一种技术方法。分子识别的过程,主要包括静电、氢键、疏水、范德华力等。分子互联为广大客户提供基于AI技术的虚拟筛选、分子对接服务、分子互作湿试实验验证服务,预测药物分子能否结合蛋白质分子、结合的方式、位置和稳定性等信息。内容涵盖受体准备(去水、加氢、优化结构和能量最小化)、活性位点发现、蛋白柔性构象探索、配体构象数据库准备、对接计算结果分析评价、小分子化合物库制备、药效团建模及筛选、人工经验筛选等等。
分子对接应用:
1、配体和受体作用方式和结合构象;
2、筛选与靶点结合的先导化合物,化合物排序;
3、作用机理拓扑网络组构建;
我们目前可以为您提供以下交付内容:
蛋白/抗原/抗体—分子间亲和力定性报告(定性分析),亲和力测定报告(定量分析);结合常数(Ka)、解离常数(Kd)和 亲和常数(KD); 亲和力强弱排序;方证配伍研究报告。
周期:2-3周。