LabEx DSP空间转录组外包服务 原位RNA检测
近年来，随着生物技术和分析方法的不断进步，定量蛋白质和基因水平的研究在理解疾病机制和寻找治疗靶点等领域扮演着至关重要的角色。此外，深入了解组织生物学也需要考虑到空间维度的因素，因此空间分析在该领域的发展备受关注。Nature Methods杂志将空间多组学技术列为2022年最令人期待的七项技术之一，目前已有多家企业推出了空间多组学技术的商业化产品，有助于研究人员探索空间转录组的奥秘。
Nanostring GeoMx DSP技术提供结合了组织影像分析技术和高通量分子定量技术，能够在组织切片原位实现多靶标蛋白和全转录组的空间原位表达谱分析。通过捕获具有形态学背景的图像，按照组织形态、表型、单个细胞、按网格或者绘制区域轮廓，研究者可以选择感兴趣的区域进行分析。
DSP Workflow全流程
1、标记荧光抗体与待测指标共孵育：一张5μm厚度的切片同时用成像试剂（荧光标记的抗体/探针）和定量试剂（Oligo标记抗体/探针）混合杂交
2、ROI区域圈选：可以选择任何区域，任何形状和大小的ROI
3、区域划分&紫外光解DSP Barcode：每个圈选的目标区域依次被紫外光照射，并切断定量试剂上偶联的Oligo序列。在不接触样本的情况下，用微毛细管快速吸出解离的Oligo序列，使样本切片完整。
4、逐个ROI收集DSP Barcode到96孔板： Oligo标签被收集到96孔收集板中，每一个孔对应组织切片上选择的一个ROI/AOI。
5、Barcode计算、测序和数据分析：收集的Oligo利用高通量测序（NGS）或 在NanoString的nCounter平台上进行定量。
技术优势
- Proteins & RNAs 组织原位表达，从靶向蛋白到全转录组分析方案
- 兼容FFPE石蜡包埋样品，实现高靶点+高灵敏度分析
- 灵活、精准的区域(ROIs)选择和自动化富集细胞群
- 应对多种应用场景
- 预先验证的Panel&客制化方案
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服务类型 |
种属 |
Panel说明 |
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NGS平台蛋白质检测 |
人，小鼠 |
使用NGS 平台在空间水平同时分析10 到 140 个蛋白质目标。核心包含4个基础靶标和必要的阳性、阴性对照，最多可以添加14个模块。 |
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核心 |
CD45、Ki67、CD31、Beta-2microglobulin（Human）、GFP（mouse）、6 controls |
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模块 |
免疫细胞类型、IO肿瘤药物靶标、免疫激活状态、泛肿瘤、细胞死亡、MAPK信号通路、PI3K/AKT信号通路、髓系细胞、神经细胞类型、AD病理学、AD病理学拓展、PD病理学、神经胶质细胞亚型、细胞自噬 |
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人全转录组图谱(WTA) |
人 |
人全转录组图谱覆盖人的全转录组，可以在在单个组织切片中同时分析 18,000 多个基因的 RNA 表达。 |
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小鼠全转录组图谱（Mu WTA） |
小鼠 |
小鼠全转录组图谱覆盖所有小鼠品系的全转录组，可以在在单个组织切片中同时分析21,000 多个基因的 RNA 表达。 |
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癌症转录组图谱(CTA) |
人 |
癌症转录组图谱用于对肿瘤生物学、肿瘤微环境和免疫反应进行全面分析，可以在在单个组织切片中同时分析 1,800 多个基因的RNA表达。 |
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犬癌症图谱 |
犬 |
犬癌症图谱用于研究犬对癌症以及免疫生态学治疗的免疫反应,可以在单个组织切片中同时分析1,962多个基因的 RNA 表达。 |
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空间多组学数据分析 |
不限 |
提供标准化及定制化数据分析，包括箱型图、散点图、火山图、条形图等多种展示 |
结果展示
数据分析：提供多种数据视图，包括箱型图、散点图、火山图、条形图等
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详细地址：
上海浦东新区古丹路15弄18号4楼
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