4D-乙酰化修饰及其他酰化修饰蛋白质组学
蛋白质乙酰化修饰由乙酰基转移酶和去乙酰化酶共同调节,通过感应代谢环境变化而变化,同时其常在代谢酶上发生修饰,进而调控代谢通路及代谢酶的活性,参与下游游代谢物变化。蛋白质乙酰化(acetylation)是最常见的酰化修饰类型,是指在乙酰基转移酶的催化下把乙酰基团(如乙酰辅酶A等供体)共价结合到底物蛋白质的赖氨酸残基上的过程,主要发生在蛋白质赖氨酸残基的ε-NH2位,其分子质量会相应增加42.01Da,质谱能够准确地测定分子量是否发生相应的质量偏移,实现酰化修饰肽段及位点的分析。4D-labelfree乙酰化修饰蛋白组学是基于timsTOFPro质谱仪,通过数据依赖性采集-同步累积连续碎裂(ddaPASEF)扫描模式进行乙酰化差异蛋白质组学分析。4D-labelfree修饰组,利用了离子淌度分离,能根据分子的形状、截面积属性,可有效区分修饰同分异构多肽,极大提高修饰的鉴定深度,以更少上样量、更快扫描速度,实现蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。
产品类型 | 修饰位点 | 富集方法 | 推荐建议 |
4D-labelfree乙酰化 | Lys | Acetyl-Lysine基序抗体 | 1)微量样本分析 2)高性价比分析 3)“有无差异”比较,样本间 表达模式差异较大的实验设计 |
4D-labelfree琥珀酰化 | Lys | Succinyl-Lysine基序抗体 | |
4D-labelfree丙酰化 | Lys | Propionyl-Lysine基序抗体 | |
4D-labelfree丙二酰化 | Lys | Malonyl-Lysine基序抗体 | |
4D-labelfree戊二酰化 | Lys | Glutaryl-Lysine基序抗体 |
标准数据分析内容 | |
蛋白质总鉴定数量分析 | 蛋白鉴定与定量结果统计、韦恩图分析、差异结果数量统计、火山图、聚类热图 |
蛋白质功能分析 | 亚细胞定位、结构域分析、motif分析、GO功能分析、KEGG通路分析、互作网络分析 |
质量控制分析 | 肽段相对分子质量分布、肽段序列长度分布 |
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