Arraystar公司环状RNA芯片--性能参数，报价/价格，图片

基本信息

产品名称：

Arraystar公司环状RNA芯片

英文名称：

Arraystar circRNA microarray

国产/进口：

进口

产地/品牌：

Arraystar/美国

型号：

Arraystar/美国

参考报价：

免费咨询800-820-5058;400-886-5058

销售商：

上海康成生物工程有限公司

总点击数：

11176

更新日期：

2019-03-04

产品类别：

生物芯片

性能参数

Arraystar公司环状RNA芯片 V2.0

circRNA介绍

区别于传统线性RNA分子，环状RNA（circRNA）是一类由特殊剪接机制形成的、具有闭合环状结构的非编码RNA，也是目前生命科学和医学领域的最新热点分子。绝大部分circRNA由基因的外显子或内含子序列转录而来，它的表达具有明显的物种保守性、组织特异性以及时序特异性等；此外，circRNA的特殊闭合环状结构对核酸外切酶不敏感，从而可以稳定存在于组织、体液等样本中，这使得circRNA作为临床biomarker具有明显优势。最新研究表明：circRNA序列上富含miRNA结合位点，可以竞争性吸附细胞浆中的miRNA，进而解除miRNA对靶mRNA的抑制作用，即circRNA可作为ceRNA调控生物学过程。与疾病关联性miRNA的相互作用说明circRNA对疾病起着非常重要的调控作用。

为了能够帮助科研工作者对circRNA进行更好地研究，美国Arraystar公司在全球首款circRNA芯片基础上迅即升级版本为V2.0，这款产品目前已经开始在市场进行推广。芯片上所有的circRNA来源于最新国际顶尖期刊并经过了严谨的实验验证，以便于研究者对不同生理和病理状态下对circRNA的表达变化进行系统的研究。此外，还对circRNA可能结合的miRNA进行预测并详细注释，非常方便客户从“miRNA sponge” 的角度研究circRNA的作用机制和生物功能。Arraystar通过预测疾病相关miRNA结合的circRNA或疾病相关的SNPs位点产生的circRNA，将疾病相关的circRNA收录在该款芯片中。芯片针对每个circRNA设计剪接位点特异性探针，即便在相应线性RNA存在的情况下也能够特异性检测circRNA。样品的RNase R预处理和随机引物反转系统确保了circRNA的高效特异性标记。此外，RNA spike-in对照的设置能可以很好地监控样品标记和芯片杂交效率。

聚焦品牌优势

l 优化的特异性标记流程

能够有效的去除线性RNA，特异性标记circRNA (图1 )

图1：circRNA标记流程：1）RNase R预处理有效地去除线性RNA；2）基于随机引物的反转标记系统有效的标记circRNA。

2 剪接位点特异性探针

即便在相应线性RNA存在的情况下也能够特异性检测circRNA（图2）

图2：Arraystar circRNA 芯片V2.0采用剪接位点特异性探针，可以做到即便在相应线性RNA存在的情况下也能够特异性检测circRNA。如上图，用于circRNA探针设计的序列对应到相应线性RNA上，就是针对外显子A的5’端和外显子B的3’端连接的序列。

3 详尽的circRNA注释信息

Arraystar miRNA靶基因预测软件对circRNA上的保守miRNA的结合位点进行了预测，并对其中匹配分值较高的位点进行了注释。客户可以很方便的从“miRNA sponge”的角度研究circRNA的作用机制和生物功能（图3）。

图3：详细的circRNA注释：1）与circRNA对应的线性mRNA信息；2）circRNA上匹配度比较好的保守miRNA的结合位点。

4 Spike-in RNA对照

在RNA样品中加入一组由ERCC (External RNA Controls Consortium)开发的外源性RNA，可以对RNA扩增，标记和芯片杂交过程中产生的实验偏差进行校正。更为准确地判定检测方法的局限性，同时增加样本间结果比较的可靠性。

5 性能保证

高灵敏度：能准确检测跨域5个数量级的低丰度RNA（图4）。

图4： Arraystar的circRNA 芯片跨越超过5个数量级的检测范围

高重复性：Arraystar circRNA 芯片实验的技术重复组之间具有很好的相关性（R²>0.9）（图5）。

图5：Arraystar circRNA 芯片的高重复性

环状RNA芯片V2.0参数

	Human	Mouse	Rat
Total Number of unique circRNAs	13,617	14,236	14,145
Probe Length	60nt	60nt	60nt
Probe Region	Circular junctions of circRNA
Probe Specificity	Transcript-specific
circRNA Enrichment	RNase R treatment
Labeling Method	Labeling by random primers
Circular RNA Sources
Salzman’s circRNAs [4]	8,529
Memczak’s circRNAs [3]	1,601	1,750
Zhang’s circRNAs [6]	93
Zhang’s circRNAs [5]	4,980
Jeck’s circRNAs [2]	3,769
Guo’s circRNAs [1]	5,536	570
You's circRNAs		13,300	12,298
Mouse circRNA orthologs			1,668
Human circRNA orthologs			179
Array Format	8 * 15K	8 * 15K	8 * 15K

参考文献

1. Guo, J. U., V. Agarwal, et al. (2014). "Expanded identification and characterization of mammalian circular RNAs." Genome Biol 15(7): 409.
2. Jeck, W. R., J. A. Sorrentino, et al. (2013). "Circular RNAs are abundant, conserved, and associated with ALU repeats." RNA 19(2): 141-157.
3. Memczak, S., M. Jens, et al. (2013). "Circular RNAs are a large class of animal RNAs with regulatory potency." Nature 495(7441): 333-338.
4. Salzman, J., R. E. Chen, et al. (2013). "Cell-type specific features of circular RNA expression." PLoS Genet 9(9): e1003777.
5. Zhang, X. O., H. B. Wang, et al. (2014). "Complementary sequence-mediated exon circularization." Cell 159(1): 134-147.
6. Zhang, Y., X. O. Zhang, et al. (2013). "Circular intronic long noncoding RNAs." Mol Cell 51(6): 792-806.

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公司简介

上海康成生物工程有限公司自2002年起专注于生物科研技术服务，是国内最早一批专业提供生命科学前沿研究技术服务的高科技企业。为进一步拓展在医学科研服务领域业务的深度和广度，向多谱领域发展，重塑品牌 Aksomics（数谱生物）。Aksomics全面整合公司在非编码RNA（lncRNA、circRNA、small RNA等）、表观遗传学、蛋白组学等检测方向的核心技术，依靠自身优秀的研发、技术、营销和服务团队，凭借国际领先的技术平台和高标准的质控体系，形成了涵盖表观基因组学、转录组学、蛋白质组学及代谢组学等各个研究领域的一站式技术平台。

【表观基因组学】 DNA甲基化芯片、DNA羟甲基化芯片、染色质免疫共沉淀芯片、DNA甲基化测序、DNA羟甲基化测序、染色质免疫共沉淀测序、MeDIP-PCR、hMeDIP-PCR、ChIP-PCR等

【转录组学】LncRNA芯片、LncPath™芯片、环状RNA芯片、T-UCR芯片、microRNA芯片、piRNA芯片、全基因组表达谱芯片、RNA测序、RNA m6A甲基化测序、small RNAs测序系列（microRNA测序、tRF&tiRNA测序、snoRNA测序、piRNA测序等）、LC-MS tRNA修饰检测、 nrStar™ ncRNA PCR芯片（tRF&tiRNA，tRNA，snoRNA，Functional LncRNA）、miRStar™癌症特异性microRNA PCR芯片、NuRNATM mRNA PCR芯片、功能分类PCR芯片、LncRNA实时定量PCR、环状RNA实时定量PCR、tRF&tiRNA实时定量PCR、microRNA实时定量PCR、mRNA实时定量PCR

【蛋白组学平台】TMT标记定量蛋白组学服务、Lable-free定量蛋白组学服务、磷酸化修饰蛋白组学服务、泛素化修饰蛋白组学服务、N-糖基化修饰蛋白组学服务、乙酰化修饰蛋白组学服务、蛋白-蛋白相互作用组学

【代谢组学】靶向代谢组学、非靶向代谢组学

【外泌体组学】外泌体转录组学、外泌体蛋白质组学、外泌体代谢组学
康成生物为Agilent、Arraystar、Exiqon、Illumina、Qiagen、Thermo Fisher等国际知名品牌提供技术服务。康成客户采用各类技术服务发表的SCI论文已超560篇。康成生物将持续聚焦生命科学发展的挑战，提供有竞争力的产品和服务，持续为客户创造最大价值。

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