利用MALDI-TOF微生物质谱技术推进传染病检测
2021-05-13 来源:本站 点击次数:2313利用MALDI-TOF微生物质谱技术推进传染病检测
作者：Ike Northern，CompuNet临床实验室传染病检测与免疫学主任
全世界每年有20%的死亡与败血症有关，影响人口达4700万～5000万。¹ 对败血症的早期识别与适当治疗，可有效改善患者预后。败血症治疗每延迟一小时，患者的存活率就会降低7.6%。2
治疗败血症的标准程序从使用广谱抗菌药物开始，但是，在不了解微生物特性的情况下，治疗的效果十分有限，并有可能给患者带来不利的健康影响。很多曾经很容易通过新型抗生素治疗的疾病，现在又重新出现了耐药性。
利用MALDI-TOF技术进行快速微生物鉴定
CompuNet临床实验室可提供包括败血症检测在内的先进诊断服务。该实验室使用布鲁克的基质辅助激光解吸/电离飞行时间（MALDI-TOF）微生物质谱仪来生成质谱图，供鉴定微生物的“蛋白指纹图谱”之用，从而显著提高通量。
CompuNet还采用布鲁克的MALDI Sepsityper® Kit 50（仅供研究用，即RUO），它可以直接从阳性血液培养物（PBC）中快速鉴定微生物。采用MALDI Sepsityper Kit 50从PBC中进行鉴定比传统的表型与生化方法要快得多。
患者可以更快转到靶向治疗，除了尽量减少长期接受潜在的过度治疗之外，从广谱抗菌药物迅速降级为靶向型抗菌药物的另一项优势是，降低产生多药耐药微生物的风险，这与世界卫生组织（WHO）的全球耐药行动计划相一致，3
CompuNet使用MALDI Biotyper进行MALDI Sepsityper Kit 50验证研究，并对82%的样本进行了鉴定，医生能比之前提前至少48小时优化患者治疗（表1）。CompuNet还计划采用新近获FDA批准的MBT Sepsityper Kit US IVD，对阳性血培养中的400多种微生物进行快速、经济的鉴定。
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种水平
74/106 = 70% |
属水平
13/106 = 12% | ||||||
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金黄色葡萄球菌 |
17 |
屎肠球菌 |
2 |
摩根摩根菌 |
1 |
凝固酶阴性葡萄球菌 |
3 |
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头状葡萄球菌 |
2 |
咽峡炎链球菌 |
1 |
铜绿假单胞菌 |
3 |
α-链球菌 |
1 |
|
表皮葡萄球菌 |
8 |
A群链球菌 |
1 |
普通变形杆菌 |
1 |
β-链球菌 |
1 |
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溶血性链球菌 |
2 |
B群链球菌 |
1 |
粘质沙雷菌 |
2 |
芽孢杆菌属 |
3 |
|
人葡萄球球菌 |
2 |
阴沟肠杆菌 |
1 |
白色念珠菌 |
1 |
棒杆菌属 |
3 |
|
藤黄微球菌 |
3 |
大肠杆菌 |
18 |
|
|
肠杆菌属 |
1 |
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粪链球菌 |
4 |
肺炎克雷伯菌 |
5 |
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拟杆菌属 |
1 |
表1：CompuNet MALDI Sepsityper Kit 50验证
鉴定微生物总数 – 87/106（82%）
用户长期受益
与通过多重PCR检测进行PBC常规测试相比，使用MALDI-Sepsityper作为筛选手段是更为经济高效的选择，可以帮助确定该下一步该做哪些检查。布鲁克未来开发的目标包括增加耐药标志物，以帮助应对耐多药微生物 （如产肺炎克雷伯菌碳青霉烯（KPC）、MRSA（耐甲氧西林金黄色葡萄球菌）、脆弱拟杆菌阳性菌株、伊丽莎白菌属以及嵌合体分枝杆菌），并进一步扩大微生物鉴定能力。
有关布鲁克 MALDI Sepsityper Kit 50的更多信息，请登录：https://www.bruker.com/products/mass-spectrometry-and-separations/ivd-ce-certified-maldi-biotyper/mbt-sepsityper-ivd-kit.html.
Bruker MALDI Sepsityper Kit 50仅供研究使用（RUO）。
*CompuNet临床实验室从布鲁克购买MALDI Sepsityper Kit 50（RUO）
*CompuNet临床实验室开发并验证了自己的内部分析方法，用于临床诊断
*Sepsityper分析按照内部制定的方案仅在实验室内使用。
关于作者
Ike Northern自1989年起在俄亥俄州代顿市的Compunet临床实验室工作，并担任传染病检测主管。
参考文献
¹ World Sepsis Day (2021) https://www.worldsepsisday.org/sepsis
2Kumar A, Roberts D, Wood KE, Light B, ParrilloJE, Sharma S, Suppes R, Feinstein D, ZanottiS, Taiberg L, Gurka D, Kumar A and Cheang M:Duration of hypotension before initiation of effectiveantimicrobial therapy is the critical determinantof survival in human septic shock. Crit CareMed 2006, 34(6):1589-96, DOI:
3Global Action Plan on Antimicrobial Resistance, World Health Organization (WHO), 2015, https://www.who.int/antimicrobial-resistance/publications/global-action-plan/en/index.html
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