在药物研发的漫漫征途中,分子间相互作用的定量分析至关重要,快速寻找能够精准结合目标分子的小分子抑制剂或促进剂,一直是科学家们不懈追求的目标。传统的高通量筛选(HTS)技术虽能快速筛选大量化合物,但往往只能提供定性或半定量的结果,且存在大量假阳性和假阴性。传统定量方法(SPR, BLI, ITC)通常需要重复测量稀释系列,以便生成滴定曲线并测量平衡解离常数(Kd),但这些方法受限于它们在几十分钟范围内的中低通量能力,才可获得单个配体的解离常数。其中表面等离子共振(SPR)、生物层干涉法(BLI)虽然能够提供详细的结合亲和力和动力学信息,但基于表面的技术,需要复杂的表面化学优化,且对缓冲液兼容性和分析物的表面吸附敏感;等温滴定量热法(ITC)虽然是溶液中的技术,但需要大量的样品,对于珍贵或稀有的材料不够实用,这些限制促使科学家们寻找更高效、更通用的分析技术。如今,一种名为cSPRING(Continuous Titration Based Spectral Related Intensity Change)的新兴技术,它将FIDA(层流诱导分散分析)与光谱位移技术相结合,以在单个浓度样品中测量Kd,作为一种溶液内方法,可将样品制备时间减少8倍,并且仅需要纳克蛋白质。cSPRING可在一分钟内通过单浓度样品测量Kd,突出了其效率和筛选应用的潜力,有望对传统小分子定量筛选市场这一领域带来新的曙光。
技术原理
在深入了解 cSPRING 的优势之前,我们先来剖析两种技术——cSPRING 和 dSPRING 的实验设计和原理。在 dSPRING(离散滴定法)中,研究人员需要准备一系列不同浓度的分析物溶液,通常通过 2 倍稀释系列来实现。每个浓度点都需要单独测量,生成完整的滴定曲线。实验中,荧光标记的指示剂(如蛋白质)与不同浓度的配体混合后,通过Capflex方式进行检测。荧光信号呈高斯分布,通过双高斯拟合提取扩散系数和荧光强度,最终得到平衡解离常数(Kd)(Figure 1A)。
cSPRING(连续滴定法)技术基于FIDA(层流诱导分散分析)与光谱位移技术,通过在毛细管中自动创建连续的浓度梯度,实现对非共价相互作用的快速定量分析。具体来说,FIDA利用层流条件下荧光溶质的浓度分布,精确测定扩散系数和流体动力学半径。而cSPRING结合了FIDA和光谱位移检测,通过测量荧光团的发射光谱变化来反映分子间相互作用。实验中只需准备两个样品:一个是完全结合状态(高浓度分析物与指示剂混合),另一个是未结合状态(仅指示剂)。通过在毛细管中自动创建连续的浓度梯度,模拟传统的滴定曲线。配体在毛细管中以泰勒分散的方式形成时间依赖的浓度分布,而指示剂浓度保持恒定(Figure 1B)。
Figure 1 的展示,我们可以清晰地看到 cSPRING 和 dSPRING 在实验设计上的关键区别。dSPRING 更适合高精度的详细分析,而 cSPRING 则以其高效、快速的特点,成为高通量筛选的理想选择。
应用案例
文章中,研究人员选择了鸡卵清溶菌酶(HEWL)与三乙酰氨基葡萄糖(NAG3)作为模型体系。HEWL被标记上对环境变化敏感的Cy5荧光染料,当NAG3与HEWL结合时,荧光团的微环境发生变化,导致其发射光谱的比率变化。通过在两个光谱带(λ1=663–685 nm和λ2=685–737 nm)中测量荧光强度的比率(F2/F1),研究人员能够实时监测结合过程。
Figure 2 展示了cSPRING技术在HEWL-NAG3体系中的应用。图2A是一个dSPRING离散滴定曲线,显示了在不同NAG3浓度下,HEWL与NAG3结合的比率荧光信号变化,拟合得到的Kd值为7.2±0.7 μM,与文献报道的10 μM非常接近。图2B则展示了cSPRING实验中记录的荧光信号,通过拟合得到的Kd值为10.4±0.8 μM,与dSPRING的结果一致。图2C进一步验证了cSPRING的重复性和可靠性,三次重复实验的Kd值高度一致,平均值为10.4±0.8 μM。
为了进一步验证 cSPRING 技术的高效性和准确性,研究人员选择了牛碳酸酐酶 II(bCAII)作为模型体系。bCAII 是一种广泛研究的酶,它与多种小分子抑制剂的相互作用已被详细表征。
Figure 3 则展示了cSPRING技术在牛碳酸酐酶II(bCAII)与三种不同抑制剂(乙酰唑胺、呋塞米、4-羧基苯磺酰胺)体系中的应用。这些抑制剂的Kd值范围从20 nM到1 μM,cSPRING技术能够快速、准确地测定这些结合亲和力,并与文献报道的值高度一致。
Table 1 的数据表明,cSPRING 和 dSPRING 在测量非共价相互作用的解离常数(Kd)时具有高度一致性和可靠性。cSPRING 以其快速、高效、节省样品的特点,特别适合高通量筛选和初步评估,而 dSPRING 则适合对单个体系进行更详细的分析。这些方法与传统技术(如 SPR 和 ITC)的比较进一步验证了 cSPRING 的实用性和准确性。
为了进一步突出定量筛选能力,研究人员在更短的毛细管上进行 cSPRING 实验,且无需额外的清洗步骤,这使得单个平衡解离常数(Kd)值的测量时间缩短至 45 秒(图 4)。结果,对三种抑制剂进行三次重复测量用时不到 7 分钟,每种抑制剂仅消耗 4.2 微升指示剂溶液。
Figure 4 在更短的毛细管中进行的 cSPRING 实验,将单次测定平衡解离常数(Kd)的测量时间缩短至 45 秒。A - C 展示了三种不同抑制剂的 cSPRING 信号,以及拟合得到的平衡解离常数(Kd)和流体动力学半径。尽管结果的准确性降低,但定量读数提供了有价值的信息,并且仍与先前报道的亲和力相符。
cSPRING的优势
结论
cSPRING技术以其高效、快速、精准的特点,为非共价相互作用的定量分析提供了一种全新的解决方案。它不仅大大减少了样品准备时间和实验成本,还能够提供与传统方法相媲美的准确结果。对于药物研发中的高通量筛选和定量分析,cSPRING无疑是一个极具潜力的工具。
参考文献
Philipp Willmer et al. "Continuous Titration Based Method for Rapid In‐Solution Analysis of Non‐Covalent Interactions." Chemistry Methods 2025.