Scienion点样仪二月文献速递汇总阅读
2025-04-29 来源:本站 点击次数:414
关于 SCIENION
SCIENION是一家在超低液量喷点技术方面优越的全球性设备制造商。适合将寡核苷酸，蛋白质，抗体和聚糖等试剂装载到生物芯片或相关诊断器械上。Scienion的点样仪有着高效、精确的点样能力和解决方案，可以显著提升这项研究的实验设计和结果的可靠性，提高实验效率和数据质量，从而推动临床诊断工具的发展。
以下是SCIENION的2月出版物:
01文献链接：
https://www.nature.com/articles/s41467-024-55672-2
这篇文章主要探讨了蛋白质选择性（即蛋白质如何区分优选和非优选配体）的机制，特别是通过研究人类转录因子MAX的变异体如何影响DNA序列的特异性和选择性。研究的核心目标是揭示影响转录因子对DNA结合选择性的生物物理机制，这对预测生物功能和蛋白质工程具有重要意义。研究结果强调了构象异质性在决定序列选择性方面的重要性，并为未来的选择性蛋白质工程提供了指导。这些结果突显了构象异质性在决定序列选择性方面的重要性，并可指导未来设计选择性蛋白质的工作。
02
文献链接：
https://www.sciencedirect.com/science/article/
pii/S0144861725000438
这篇文章研究了硫酸软骨素（Chondroitin sulfate, CS）的硫酸化对其与血管内皮生长因子（VEGF-A）和成纤维生长因子2（FGF-2）结合的影响，旨在探讨CS在抗肿瘤血管生成中的作用及其机制。
通过将糖链微阵列与计算模型相结合，研究揭示了CS的结构与其与促血管生成因子相互作用之间的关系。研究结果表明，在设计抗血管生成药物时，应考虑CS的硫酸化程度和特定的硫酸化模式。总体而言，这项研究为理解CS的生物学功能提供了新的见解，并为开发更有效的抗血管生成药物提供了理论基础。
03
文献链接：
https://www.nature.com/articles/s41598-024-79472-2
这篇文章主要讨论了宫颈癌的预防、检测和诊断，特别是在资源有限的环境中面临的挑战。尽管宫颈癌可以通过筛查和治疗宫颈癌前期病变来预防，但在低收入和中等收入国家（LMICs）中，宫颈癌的负担仍然很高，部分原因是缺乏负担得起且易于使用的筛查和诊断测试。
研究还展示了该测试在细胞样本中的临床相关检测下限，并通过一项小型试点研究（n=19）验证了其临床性能，结果显示该纸基HPV E7测试在与宫颈上皮内瘤变等级2或以上（CIN2+）的组织病理学诊断相比时，准确率高达95%。文章最后提到，通过进一步的临床验证，这种检测方法可以实现高度特异性的宫颈癌前病变和癌症的床旁检测，无需仪器，价格低廉，非常适合在资源有限的环境中使用。总体而言，这项研究为宫颈癌的早期检测提供了一种创新的、可行的解决方案，旨在减少资源有限地区的疾病负担。
04
文献链接：
http://dx.doi.org/10.1101/2025.01.15.633299
注：此文献链接打开可能需连接 VPN
这篇文章主要介绍了一种新的微流控平台——SPARKfold(Simultaneous Proteolysis Assay Revealing Kinetics of Folding)，旨在解决蛋白质折叠过程中对动力学稳定性测量的挑战。文章指出，尽管蛋白质在折叠后会短暂地采样未折叠或部分未折叠的中间体，这些中间体往往容易发生不可逆的改变（如蛋白水解、聚集或后翻译修饰），并且动力学稳定性除了热力学稳定性之外，还会直接影响蛋白质的寿命、丰度以及形成替代的、可能破坏性的状态。文章展示了SPARKfold的能力和潜力，通过并行测定1,104个蛋白样本的展开速率常数。通过SPARKfold比较突变对动力学效应的影响，并结合之前发表的折叠热力学测量，研究者获取了关于折叠过渡态和路径的信息。未来的研究中，SPARKfold可以揭示驱动错误折叠和聚集的突变，并促进对在恶劣环境中工业应用的动力学超稳定变体的理性设计。
05
文献下载链接：
https://www.preprints.org/frontend/
manuscript/fd888694ef578dab428
47290d19d0dce/download_pub
这篇文章主要研究了外泌体(extracellular vesicles, EVs)在细胞受到细胞毒性环境影响时的特征，特别是在暴露于苯并芘(benzo-a-pyrene, B[a]P)这种多环芳烃下的情况。文章强调了EVs作为生物标志物在多种疾病和治疗应用中的潜力，并提供了对来自人类微血管内皮细胞(HMEC-1)产生的10K EVs的深入表征。结果表明，B[a]P暴露可能导致EV的大小增加和标记物表达的变化，指示在细胞毒性压力下EV的表型发生了转变。这项研究强调了SPRi 和 AFM 在鉴定与细胞毒性反应相关的EV标记物方面的作用，为了解 EV的异质性提供了深刻见解。
06
文献链接：
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/
2025.01.29.635407v1.abstract
这篇文章主要研究了植物细胞壁在植物免疫中的作用，特别是细胞壁衍生分子（如损伤相关分子模式，DAMPs）在免疫信号传导中的潜力。虽然已知来自同聚半乳糖醛酸（homogalacturonan）的寡聚半乳糖醛酸是重要的DAMPs，但其他细胞壁成分的免疫信号潜力仍然没有得到充分探讨。此研究还鉴定了与ARM受体相互作用和免疫激活所需的RG-I寡糖结构，并发现ARM受体在植物免疫中起到冗余作用。
本文提出的方法为发现植物中的糖类-受体配对提供了一个强大的平台，拓展了对植物免疫机制的理解。
SCIENION是一家在超低液量喷点技术方面优越的全球性设备制造商。适合将寡核苷酸，蛋白质，抗体和聚糖等试剂装载到生物芯片或相关诊断器械上。Scienion的点样仪有着高效、精确的点样能力和解决方案，可以显著提升这项研究的实验设计和结果的可靠性，提高实验效率和数据质量，从而推动临床诊断工具的发展。
以下是SCIENION的2月出版物:
01文献链接：
https://www.nature.com/articles/s41467-024-55672-2
这篇文章主要探讨了蛋白质选择性（即蛋白质如何区分优选和非优选配体）的机制，特别是通过研究人类转录因子MAX的变异体如何影响DNA序列的特异性和选择性。研究的核心目标是揭示影响转录因子对DNA结合选择性的生物物理机制，这对预测生物功能和蛋白质工程具有重要意义。研究结果强调了构象异质性在决定序列选择性方面的重要性，并为未来的选择性蛋白质工程提供了指导。这些结果突显了构象异质性在决定序列选择性方面的重要性，并可指导未来设计选择性蛋白质的工作。
02
文献链接：
https://www.sciencedirect.com/science/article/
pii/S0144861725000438
这篇文章研究了硫酸软骨素（Chondroitin sulfate, CS）的硫酸化对其与血管内皮生长因子（VEGF-A）和成纤维生长因子2（FGF-2）结合的影响，旨在探讨CS在抗肿瘤血管生成中的作用及其机制。
通过将糖链微阵列与计算模型相结合，研究揭示了CS的结构与其与促血管生成因子相互作用之间的关系。研究结果表明，在设计抗血管生成药物时，应考虑CS的硫酸化程度和特定的硫酸化模式。总体而言，这项研究为理解CS的生物学功能提供了新的见解，并为开发更有效的抗血管生成药物提供了理论基础。
03
文献链接：
https://www.nature.com/articles/s41598-024-79472-2
这篇文章主要讨论了宫颈癌的预防、检测和诊断，特别是在资源有限的环境中面临的挑战。尽管宫颈癌可以通过筛查和治疗宫颈癌前期病变来预防，但在低收入和中等收入国家（LMICs）中，宫颈癌的负担仍然很高，部分原因是缺乏负担得起且易于使用的筛查和诊断测试。
研究还展示了该测试在细胞样本中的临床相关检测下限，并通过一项小型试点研究（n=19）验证了其临床性能，结果显示该纸基HPV E7测试在与宫颈上皮内瘤变等级2或以上（CIN2+）的组织病理学诊断相比时，准确率高达95%。文章最后提到，通过进一步的临床验证，这种检测方法可以实现高度特异性的宫颈癌前病变和癌症的床旁检测，无需仪器，价格低廉，非常适合在资源有限的环境中使用。总体而言，这项研究为宫颈癌的早期检测提供了一种创新的、可行的解决方案，旨在减少资源有限地区的疾病负担。
04
文献链接：
http://dx.doi.org/10.1101/2025.01.15.633299
注：此文献链接打开可能需连接 VPN
这篇文章主要介绍了一种新的微流控平台——SPARKfold(Simultaneous Proteolysis Assay Revealing Kinetics of Folding)，旨在解决蛋白质折叠过程中对动力学稳定性测量的挑战。文章指出，尽管蛋白质在折叠后会短暂地采样未折叠或部分未折叠的中间体，这些中间体往往容易发生不可逆的改变（如蛋白水解、聚集或后翻译修饰），并且动力学稳定性除了热力学稳定性之外，还会直接影响蛋白质的寿命、丰度以及形成替代的、可能破坏性的状态。文章展示了SPARKfold的能力和潜力，通过并行测定1,104个蛋白样本的展开速率常数。通过SPARKfold比较突变对动力学效应的影响，并结合之前发表的折叠热力学测量，研究者获取了关于折叠过渡态和路径的信息。未来的研究中，SPARKfold可以揭示驱动错误折叠和聚集的突变，并促进对在恶劣环境中工业应用的动力学超稳定变体的理性设计。
05
文献下载链接：
https://www.preprints.org/frontend/
manuscript/fd888694ef578dab428
47290d19d0dce/download_pub
这篇文章主要研究了外泌体(extracellular vesicles, EVs)在细胞受到细胞毒性环境影响时的特征，特别是在暴露于苯并芘(benzo-a-pyrene, B[a]P)这种多环芳烃下的情况。文章强调了EVs作为生物标志物在多种疾病和治疗应用中的潜力，并提供了对来自人类微血管内皮细胞(HMEC-1)产生的10K EVs的深入表征。结果表明，B[a]P暴露可能导致EV的大小增加和标记物表达的变化，指示在细胞毒性压力下EV的表型发生了转变。这项研究强调了SPRi 和 AFM 在鉴定与细胞毒性反应相关的EV标记物方面的作用，为了解 EV的异质性提供了深刻见解。
06
文献链接：
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/
2025.01.29.635407v1.abstract
这篇文章主要研究了植物细胞壁在植物免疫中的作用，特别是细胞壁衍生分子（如损伤相关分子模式，DAMPs）在免疫信号传导中的潜力。虽然已知来自同聚半乳糖醛酸（homogalacturonan）的寡聚半乳糖醛酸是重要的DAMPs，但其他细胞壁成分的免疫信号潜力仍然没有得到充分探讨。此研究还鉴定了与ARM受体相互作用和免疫激活所需的RG-I寡糖结构，并发现ARM受体在植物免疫中起到冗余作用。
本文提出的方法为发现植物中的糖类-受体配对提供了一个强大的平台，拓展了对植物免疫机制的理解。
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