慢性丙型肝炎病毒 (HCV) 感染影响超过 5000 万人,持续肝脏炎症可引发慢性肝病、纤维化甚至肝硬化。HCV复制会导致宿主内膜系统发生显著重塑。目前抗病毒药物 (DAA)已经成为主要治疗手段,但其在细胞内的作用机制尚不明确。近期,西班牙CSIC生物技术中心与ALBA 同步加速器光源实验室的研究团队,借助低温软X射线断层扫描(CLSXT)技术、软X射线细胞结构显微镜SXT-100及透射电子显微镜(TEM)等多模态成像技术,成功探究了宿主细胞在持续复制 HCV 时对 DAA 治疗的早期反应,相关研究成果为理解 HCV 感染的细胞病理学和抗病毒治疗机制提供了全新视角。
软X射线细胞结构显微镜SXT-100
多技术联用解析病毒清除过程
研究采用HCV亚基因组复制子(HCV-SGR)细胞模型,结合多种前沿技术开展实验:
DAA 治疗快速启动病毒清除机制
1. 病毒蛋白和RNA的快速清除:如下图所示,DAA处理后,HCV蛋白NS3在24小时和48小时后分别减少了3倍和5倍;病毒RNA在24小时和48小时后分别减少了30倍和200倍。
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2. 细胞应激标志物的恢复:DAA治疗后48小时,细胞应激标志物ATF3 mRNA水平恢复正常,表明病毒诱导的应激得到缓解。
3. 细胞器的变化:如下图所示:免疫荧光共聚焦显微镜观察HCV-SGR细胞在DAA处理后不同时间点的高尔基体形态。结果显示,未处理的HCV-SGR细胞中,高尔基体呈现分散状态,而DAA处理后72小时和96小时,高尔基体恢复为紧凑的形态。
内质网(ER):HCV感染导致ER重塑,形成膜网。DAA治疗后,这种膜网结构在24小时内几乎完全消失。内溶酶体/多泡体(EL/MVB):DAA治疗后,EL/MVB结构显著增加,尤其是在24小时后,这些结构可能参与病毒机制的清除。
4. 病毒机制的清除与内溶酶体系统的关联:如下图所示:通过CLSXT和TEM观察到,DAA治疗后,病毒蛋白NS5A残余物与内溶酶体标记物共定位,表明内溶酶体系统可能在病毒机制的清除中起重要作用。
DAA治疗能够快速且有效地清除HCV复制机制,大部分病毒蛋白和RNA在治疗后的前48小时内被清除。病毒机制的清除与内溶酶体系统的激活密切相关,内溶酶体/多泡体结构在病毒清除过程中起到关键作用。干扰溶酶体功能或自噬过程并未影响DAA治疗的疗效,表明病毒机制的清除可能通过其他途径实现。
研究意义
本研究通过多模态成像技术揭示了DAA治疗后HCV复制机制的清除过程,为理解HCV感染的细胞病理学和抗病毒治疗的机制提供了新的视角。这些发现有助于进一步优化抗HCV治疗策略,并为开发新的抗病毒药物提供理论依据。同时,该研究创新性将cryo-SXT、TEM及共聚焦显微镜等多模态成像技术整合,提供从纳米到微米尺度的动态视图。
SXT-100突破传统成像局限,赋能精准研究
传统透射电子显微镜对细胞内病毒成像存在诸多局限,如化学固定、切片等操作易产生切片伪影,无法观测直径>300 nm 的大尺度病毒结构,单一切片仅能提供二维局部视图导致三维信息缺失,且分子定位能力不足难以关联活细胞标记等。而软 X 射线细胞结构显微镜 SXT-100 凭借特有技术优势,成为本研究的核心工具:
SXT100引领细胞成像新方向
软X射线细胞结构显微镜SXT100是前沿的软X射线成像设备之一,能够提供高达50 nm分辨率的三维细胞成像。该仪器采用创新的X射线源和探测器技术,能够在短时间内获取大量的高质量图像数据,为研究人员提供强大的工具来探索细胞内部的复杂结构和功能。
技术特点:
软X射线细胞结构显微镜 SXT-100
SXT-100的应用案例
酵母细胞脂噬过程研究
如下图所示,SXT成像对冷冻酵母细胞(Saccharomyces cerevisiae)进行3D成像,可以非常直观地展示脂滴(黄色)与消化液泡(棕色)的空间分布动态,揭示饥饿诱导的脂噬(lipophagy)机制。
纳米药物递送在细胞内3D成像
如下图所示,在HeLa细胞(HeLa)中,SXT-100成功追踪100 nm荧光聚苯乙烯纳米颗粒(NPs)的溶酶体共定位,可以提供荧光信息与纳米药物递送载体在细胞内的3D共定位信息,为优化药物载体设计提供结构依据。
复杂真核生物成像
如下图所示,SXT-100可以对眼虫(Euglena gracilis)的进行纳米级3D无标记成像,结合荧光标记叶绿素进行三维结构表征,可以清晰呈现鞭毛、类核体及光合膜系统等复杂真核生物内的细胞器结构,为单细胞生物功能研究提供新视角。
关于 SiriusXT Ltd
SiriusXT Ltd是成立于爱尔兰的高端设备制造厂商,主要致力于高端软X射线显微镜的研发及生产,其产品SXT-100一经推出,就受到了市场的极大关注,凭借其特殊的优势,获得 CoCID (Compact Cell-Imaging Device) 项目235万欧元资助,支持其从细胞结构成像角度助力抗病毒药物的研发。
关于Quantum Design 中国:
Quantum量子科学仪器贸易(北京)有限公司(暨Quantum Design中国子公司)成立于2004年,是美国Quantum Design公司在全世界设立的诸多子公司之一,在全权负责美国公司本部产品在中国的销售及售后技术支持的同时,还积极致力于和世界范围内物理、化学、生物领域的科学仪器制造商进行密切合作,帮助中国市场引进更多全球范围内的优质设备和技术,助力中国科学家的项目研究和发展。
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软X射线细胞结构显微镜——SXT-100
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