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全能核酸酶的优势及在外泌体纯化中的应用

2026-07-14     来源:本站     点击次数:43

如果把外泌体比作一列装载着药物或生物信号的精美“纳米胶囊”,那么在从细胞培养上清中提取这些胶囊的过程中,最大的挑战往往不是“造胶囊”本身,而是如何清除纠缠在胶囊周围的“杂乱绳索”——来自宿主细胞的基因组DNA与RNA。这些核酸杂质不仅让溶液变得像胶水一样黏稠,还会堵塞纯化设备、影响最终产品纯度,甚至可能引发免疫原性安全隐患。在这种情况下,一名兼具高效降解DNA/RNA能力且温和不伤活性物质的“隐形功臣”——全能核酸酶,正在逐步成为外泌体工业化纯化不可或缺的核心工具。

全能核酸酶是什么
全能核酸酶,英文名Benzonase® Nuclease(常以商品名Benzonase著称),是一种来源于粘质沙雷氏菌、经基因工程改造的非特异性核酸内切酶。之所以被冠以“全能”二字,是因为它拥有独特的“广谱降解”能力:可以在宽泛的条件下同时高效降解双链、单链、线性、环状、超螺旋等各种形式的DNA与RNA,并将核酸完全降解成2-5个碱基长度的5’-单磷酸寡核苷酸。

该酶的核心优势体现在三个方面:

  • 高效性:极低浓度(1-10 U/mL)即可快速降低溶液粘度;
  • 灵活性:在pH 6-10、温度0-42°C范围内保持活性,兼容多种缓冲体系;
  • 兼容性:可在6M尿素、0.1M盐酸胍、0.4% Triton X-100、0.1% SDS等条件下正常工作。

外泌体纯化离不开全能核酸酶
外泌体是从细胞培养上清中通过分泌方式产生的纳米级(30-200nm)膜性囊泡,天然携带蛋白质、RNA等活性分子,在疾病诊断、药物递送、再生医学等领域展现出广阔的应用前景。然而,在外泌体的分离纯化过程中,细胞凋亡破裂后释放的基因组DNA/RNA会形成粘稠的网状结构,造成工艺上的多重挑战:
❌粘度飙升,处理效率降低:大量核酸分子相互缠绕,溶液变稠,导致离心时间长、过滤速度慢,工艺处理窗口被大幅压缩。
❌堵塞层析柱,纯化成本高:这些核酸极易堵塞超滤膜和层析柱介质,导致分离设备寿命缩短、更换频率增加,显著拉高了成本。
❌残留污染,影响产品安全性:宿主细胞为多为连续传代细胞,残留的宿主核酸可能存在潜在的生物安全隐患,中国药典对生物制品的宿主细胞残留DNA有明确的限量规定。

在常规方法(如超速离心、尺寸排阻层析)效果有限的情况下,全能核酸酶凭借其“一酶双杀”的高效降解能力,成为了应对上述难题的关键武器。

关键步骤与专利案例
传统外泌体纯化方案大多聚焦于物理分离方法,却往往忽略了游离核酸这一关键杂质的影响。近年来,将全能核酸酶引入外泌体生产工艺的实践日渐成熟。一项专利(CN115710572B)公开了一种外泌体的工业化制备方法,其核心步骤中明确了全能核酸酶的应用策略:

(1)细胞上清的浓缩
首先采用切向流过滤方法,使用截留分子量为100kDa~750kDa的中空纤维柱,将细胞培养上清液浓缩10-20倍。此步不仅去除了大量小分子杂质,也为后续核酸酶处理提供了目标产物浓度更高的起始物料。

(2)全能核酸酶的去核酸处理
向浓缩液中加入全能核酸酶进行去核酸处理。在此过程中,全能核酸酶高效地将浓缩液中缠绕在外泌体周围的宿主DNA/RNA彻底降解为短链寡核苷酸,从而大幅降低溶液粘度,“解锁”被核酸缠绕的外泌体颗粒。处理完成后经重悬得到粗提液。

(3)密度梯度离心与外泌体收集
对粗提液进行密度梯度离心,利用核酸已被降解、溶液粘度降低的优势,更高效地收集外泌体层。

(4)低速离心与超速离心
在离心力≤50000g的条件下对收集的外泌体层进行低速离心去除沉淀,得到初步纯化液;再进行≥100000g的超速离心,最终获得高纯度外泌体。

该专利方法获得的外泌体膜结构完整、不变形,纯度和颗粒浓度均优于现有方法,收率更高、成本更低,为以外泌体为载体的靶向药物递送研究提供了有力支撑。

从成功通过美国FDA DMF备案,到依托AI酶进化技术实现性能全面升级,合规性加持 + 技术性能护航,Pannarase全能核酸酶无疑已成为基因治疗生产值得信赖的核心工具。未来,逐典生物将继续依托重组蛋白定向改造平台与持续的技术创新,加速布局更多生物制药核心原料的国产化与国际化进程,赋能生物制药行业发展。

Pannarase全能核酸酶
高酶活性:中、高盐缓冲液条件下,酶活性高
高回收率:高盐环境下减少核酸缠绕病毒或目的蛋白,降低AAV等病毒颗粒聚集,提高目的产物回收率
高工艺简便性:下游收获或纯化无需超滤换液或透析脱盐

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