乙酰化微珠:如何成为富集乙酰化蛋白/肽段的“亲和利器”?
简述
乙酰化微珠是将高特异性抗乙酰化赖氨酸抗体共价偶联至琼脂糖凝胶基质上形成的亲和层析介质。它通过“抗体-抗原”特异性识别原理,能够从复杂生物样本(如细胞裂解液、酶解肽段混合物)中高效、快速地富集带有乙酰化修饰的蛋白质或肽段,是乙酰化蛋白质组学研究中绕不开的核心工具。
一、乙酰化微珠的设计原理:特异性“捕获”乙酰化修饰的分子基础是什么?
图 乙酰化微珠捕获乙酰化蛋白/肽段的亲和富集原理示意(图片来源:斯达特官网技术软文)
乙酰化微珠的功能建立在免疫亲和层析技术之上。其核心设计包含两个关键部分:一是作为固相载体的琼脂糖微珠,其具有良好的生物相容性、多孔性和低非特异性吸附,为亲和反应提供了理想的液相环境;二是共价偶联在微珠上的抗乙酰化赖氨酸抗体。
这类抗体经过精心设计和筛选,能够特异性识别蛋白质或肽段中赖氨酸残基上发生的乙酰化修饰(N-ε-乙酰化),而不与结构类似的丙酰化、丁酰化或其他类型的修饰(如甲基化)发生交叉反应。抗体通过稳定的酰胺键牢固地结合在琼脂糖基质上,确保了在反复洗脱过程中的稳定性和可重复使用性。
当复杂的蛋白/肽段混合物通过微珠时,只有那些携带乙酰化赖氨酸残基的分子才能被抗体“捕获”并保留在微珠上,非乙酰化的成分被洗去,目标分子就这么被留了下来。
二、乙酰化微珠助力乙酰化蛋白质组学研究的技术流程是怎样的?
乙酰化微珠的应用贯穿于乙酰化蛋白质组学研究的核心环节,其典型工作流程是这样的:先从组织或细胞样本中提取总蛋白,并进行酶解(通常使用胰蛋白酶)以获得复杂的肽段混合物。随后,将肽段混合物与乙酰化微珠共同孵育,使乙酰化肽段被微珠上的抗体特异性捕获。
经过充分洗涤去除未结合的非特异性肽段后,使用特定的洗脱液(如低pH缓冲液或含乙酰化赖氨酸的竞争性抗原)将富集在微珠上的乙酰化肽段洗脱下来。最后,将洗脱的富集产物送入液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)进行鉴定和定量分析。
这一流程能够显著降低样本复杂度,使低丰度的乙酰化肽段得以被质谱检测,从而绘制出全蛋白质组水平的乙酰化修饰谱图。
三、乙酰化微珠的技术优势如何体现在实验应用中?
与直接检测总蛋白或使用游离抗体进行免疫沉淀相比,乙酰化微珠的优势其实挺直观。一是效率高、上手快:将抗体固定在微珠上,简化了操作步骤,缩短了实验时间,且微珠易于通过离心或重力柱进行分离和洗涤,便于实现标准化和高通量操作。
二是特异性和载量都够:优质的乙酰化微珠产品,如Premium级别的抗乙酰化赖氨酸琼脂糖微珠,通过混合使用优质多克隆和单克隆抗体,结合了二者在广谱识别与特异性上的优势,能够更全面地捕获不同类型和位点的乙酰化修饰。
三是适用面宽:乙酰化微珠不仅可用于富集酶解后的肽段以进行质谱鉴定,也可用于直接免疫沉淀(IP)完整的乙酰化蛋白,以研究其相互作用或下游功能。
斯达特提供的乙酰化蛋白富集与检测工具
做乙酰化蛋白的富集和检测,工具选不对,后面的质谱数据就得打折扣。
斯达特提供两款乙酰化研究工具:
S0B0655(S-RMabMix™ Acetyllysine Rabbit mAb),一款广谱识别乙酰化赖氨酸的兔单克隆抗体混合物;以及
S0F0004(Anti-acetyllysine agarose Beads),把高特异性抗乙酰化赖氨酸抗体共价偶联到琼脂糖微珠上的亲和介质。
前者适合Western Blot、免疫沉淀(IP)等检测场景,后者更适合乙酰化肽段或蛋白的亲和富集纯化。两者搭配,从富集到检测能接得上。
| 货号 |
产品名称 |
商品参数 |
参考货期 |
规格 |
价格 |
| S0B0655 |
S-RMabMix™ Acetyllysine Rabbit mAb |
来源 : Rabbit;
标记 : Unconjugated |
请咨询客服 |
1ml / 25μl / 100μl |
询价 |
| S0F0004 |
Anti-acetyllysine agarose Beads |
|
请咨询客服 |
300μl / 1ml |
询价 |
结语
乙酰化微珠把乙酰化修饰研究和功能解析连了起来,也实实在在推动了表观遗传学与蛋白质组学往前走。有了它,在全基因组或全蛋白质组水平上系统鉴定乙酰化位点、动态变化及其调控功能,才算真正可行。接下来绕不开的问题是:富集效率与特异性之间怎么权衡,才能让低丰度位点不被漏掉?
本文由斯达特技术专家团审核发布
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