自 1995 年成立以来,Dharmacon 在生物信息学,RNA 生物学和合成化学方面的专长 , 使我们能够开发出一整套研究基因功能的产品。
Dharmacon 公司是 RNA 干扰新发现领域的早期参与者,并且在若干重要的科学发现中,以及确保沉默效率的 siRNA 试剂的商业化过程中做出了重大贡献。Dharmacon 公司保持技术进步,利用生物信息学和化学修饰提高产品性能。当今,我们研究的领域和研究工具已经扩展到支持 RNA 干扰应用的方方面面;如,siRNA,慢病毒shRNA,microRNA 研究工具,以及对基因,microRNA 和 lncodeRNA 进行功能性筛选的全基因组文库。同样,在过表达研究应用中,Dharmacon 公司收集了齐全的商业化 cDNA 和 ORF 文库。
秀丽隐杆线虫(Caenorhobditis elegans)是一种重要的生物学研究模式生物,在细胞凋亡和RNA干扰(RNAi)方面取得了重大进展。
文库种类
Dharmacon线虫资源包括多个线虫基因组文库,包括ORF文库、RNAi文库、转录因子文库和启动子文库等。
线虫(Caenorhobditis elegans)基因cDNA&ORF文库
(1) 线虫ORFs库(C.elegans ORF Collection)
秀丽隐杆线虫ORF文库是功能性秀丽线虫蛋白质组基因文库,它由一组预测的蛋白质编码开放阅读框(ORFs)组成,这些开放阅读框已克隆Gateway-供体载体中。该线虫ORF文库可用于表达约11000种线虫蛋白。通过高通量策略和大规模相互作用图谱进一步研究线虫蛋白表达,可深入了解线虫的蛋白质功能。
(2) 线虫RNAi文库(C. elegans RNAi Collection)
源于秀丽线虫ORFeome文库v1.1,秀丽线虫RNAi文库提供了11000多个RNAi克隆。这些克隆被整合到pL4440-dest-RNAi目的载体中,以大肠杆菌饲养菌株 HT115(DE3)甘油菌形式保存。在RNAi 浸润或注射,可以作为体外合成dsRNA的模板。
(3) 线虫启动子文库(C. elegans Promoter Collection)
该文库包含6000多个秀丽隐杆线虫基因的预测启动子,这些基因已被克隆到Gateway重组载体中,从而构建启动子融合结构。这种线虫“启动子组”的潜在应用包括构建启动子-GFP融合体,用于获得蛋白质表达图谱和亚细胞定位,以及芯片和酵母单杂交分析。通过启动子与线虫ORF文库结合,还可用于组织特异性RNAi、亚细胞蛋白定位和异位(ectopic)表达研究。
(4) 线虫转录因子(C. elegans Transcription Factors)
此文库包含755个线虫转录因子ORFs,约占全部预测的线虫转录因子的80%,并已克隆到Gateway兼容的Y1H“猎物”载体pDEST-AD中,可用于酵母单杂交(Y1H)和双杂交(Y2H)检测.
参考文献:
1. J. Reboul et al., C. elegans ORFeome version 1.1 experimental verification of the genome annotation and resource for proteome-scale protein expression. Nature Genetics. 34 (May 2003).
2. J. F. Rual et al., Toward Improving Caenorhabditis elegans Phenome Mapping With an ORFeome-Based RNAi Library. Genome Res. 14(10b),2162–2168 (2004).
3. D. Dupuy et al., A First Version of the Caenorhabditis elegans Promoterome. Genome Res. 14, 2169-2175 (2004)
4. Deplancke B et al., A gene-centered C. elegans protein-DNA interaction network.Cell. 125(6), 1193–1205 (2006).
5. V. Vermeirssen et al., A C. elegans transcription factor array and Steiner Triple System-based smart pools: high-performance tools for transcription regulatory network mapping. Nature Methods. 4, 659–664 (2007).
特别申明
Dharmacon提供一些由学术实验室开发的克隆资源,其中许多资源满足了其他商业实体没有提供的特别研究领域的需要。为了提供这些作为公共资源,我们依靠提供资源的学术实验室进行质量控制。
因此,这些文件按捐助机构“原样”提供的格式分发,没有额外的产品验证或保证。我们不对任何错误或性能问题负责。其他信息可以在产品手册和相关的已发表文章(如果有的话)中找到。或者,可以直接联系资源提供学术机构进行技术答疑。
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