关于RNA降解详细介绍
2023-11-29 来源:本站 点击次数:405
RNA抽取一般使用Trizol法抽提:
Trizol是一种总RNA抽提试剂,内含异硫氰酸胍等物质,能迅速裂解细胞,抑制细胞释放出的核酸酶活性。目前常用Trizol法进行提取组织或细胞中的RNA。
Trizol作用原理:
在匀质化或溶解样品中,Trizol试剂可保持RNA的完整性,同时能破坏细胞及溶解细胞成分。加入lv仿离心后,裂解液分层成水相和有机相。RNA存在于水相中。
水相转移后,RNA通过异丙醇沉淀回收。移去水相后,用乙醇可从中间相沉淀得到DNA,加入异丙醇沉淀可从有机相得到蛋白质。
接下来了解RNA提取中RNA降解原因:
一、RNA降解原因:
1 、 新鲜细胞:
裂解液的量不足,使得裂解不充分。
2 、 新鲜组织:
某些含有内源性核酸酶的样品,很难避免RNA酶的降解,建议采用的方法为在液氮条件下将组织研碎,并且,匀浆时采用更多的裂解液。
3 、冷冻样品:
样品取材后应该迅速置于液氮中冷冻存放,然后转移到-70℃冰箱存放。如果未经液氮速冷直接转移到-70℃冰箱存放,会造成RNA缓慢降解。样品研磨后,在液氮刚刚挥发完时,将样品迅速转移到含裂解液的容器中,立即混匀匀浆。
4 、内源 RNA 酶的污染:
抑制剂失效或者用量不够,实验样品过多或者匀浆温度过高。
5 、 外源 RNA 酶的污染:
试剂、器械等实验用品应该采用DEPC 水灭菌处理。
RNA降解是非常严重的问题,在RNA提取过程中,为防止降解我们需要遵守以下4点基本规则:
二、基本规则:
1. 把所有接触RNA的塑料制品以及玻璃制品都高压灭菌。
2. 用于RNA 缓冲液的所有水都要经DEPC处理。加DEPC到终浓度0.1%,再室温放放置过夜,或者灭菌15min 。DEPC 不能用于Tris 缓冲液,因为DEPC将会降解成乙醇和二氧化碳。
3. 避免碱性缓冲液,因为RNA中的羟基对碱非常敏感。
4. 将RNA 缓冲液与其他缓冲液分开放置,避免用错或被RNases污染。