操作步骤:
1、准备工作
A、 玻璃匀浆器、75℅乙醇预冷 ,离心机预冷至4℃ 打开超净工作台紫外灯15分钟以上
B、 用酒精擦拭台面 EP管标记
2、匀浆处理
1、取一定量的纯化过的孢子悬浮液,12000rpm ,离心5min,弃上清
a 、或者用匀浆仪进行匀浆处理,悬浮液不经离心,直接加0.5ml Trizol reagent于冰上充分匀浆悬浮液样品体积一般不要超过Trizol体积的10%.,然后再加入0.5ml Trizol 冲洗匀浆器,转移至1.5ml EP管中
b、 直接在悬浮液中加入Trizol裂解细胞,加1ml Trizol.用取样器吹打几次.(离心取细胞,每5-10×106动物、植物和酵母细胞或每107细菌细胞加1ml Trizol。加Trizol前不要洗涤细胞,以免降解mRNA。一些酵母和细菌细胞可能需要匀浆仪处理)
2、1ml Trizol Reagent,震荡混匀
3、将匀浆样品在15-30℃放置5mim,使得核酸蛋白复合物完全分离。
4、可选步骤:4 ℃ 12 000rpm离心10min,取上清。
如果样品中含有较多蛋白、脂肪、多糖或肌肉、植物结节部分等,可离心去除。离心得到的沉淀中包括细胞外膜、多糖、高分子量DNA,上清中含有RNA。处理脂肪组织样品时,上层是大量油脂,应除去。取澄清的匀浆溶液进行下一步操作。
5、每使用1ml Trizol加0.2ml氯仿,盖好管盖,在漩涡振荡器上震荡15s,室温放置3min。如不能涡旋混匀,可手动颠倒混匀2min代替。
6、4 ℃ 12 000rpm,离心10-15min,样品会分成三层:红色的有机相,中间层和上层无色的水相,RNA主要在水相中,把水相(约600ul,约为所用Trizol试剂的60%)转移到新管中。(如要分离蛋白质和DNA,可保留黄色的有机相)
7、在得到的水相溶液中加入等体积(500ul)的异丙醇,上下颠倒混匀,-20℃ 放置20-30min。
(植物或动物组织RNA提取中,容易沉淀出大量的蛋白等污染物,导致电泳检测时看不到RNA。可以按以下步骤操作减轻污染:在上清中加入1/2体积的异丙醇,1/2体积的RNA助沉剂,然后进行以下操作。)
8、4 ℃ 12 000rpm离心10min,去上清。
(离心前RNA沉淀经常是看不见的,离心后在管侧和管底形成胶状沉淀。)
9、加入1ml 75%乙醇(DEPC水处理过的水配制)洗涤沉淀。加入后把管子敲一敲,尽量使RNA沉淀飘起来,每使用1ml Trizol至少加1ml乙醇。有时,为避免RNA被洗掉,此步可以省掉,洗涤之后可以晾干或者烤干乙醇,但是不能过于干燥,否则不易溶解。
10、4 ℃ 12 000rpm离心5min,弃上清;短暂快速离心,用移液器小心吸弃上清,注意不要吸弃沉淀。
11、室温放置晾干(不要晾得过干,RNA完全干燥后会很难溶解,大约晾干2-3min左右即可)。加入适量DEPC水(根据实验需要,可加30-100ul水)或0.5%SDS,用枪头吸打几次,充分溶解RNA。50度保温1小时。如RNA用于酶切反应,勿使用SDS溶液。RNA也可用100℅ 的去离子甲酰胺。溶解,-70℃保存。可以分装保存,防止污染,
12、取1ul+1ul buffer 电泳检测RNA完整性,稀释一定倍数,分光光度计测定纯度和浓度。
注意事项:
1. 从少量样品中提取RNA(1-10mg组织或102-104细胞) :
加800ul Trizol,样品裂解后加氯仿,分层,沉淀RNA前,加5-10ug RNase-free糖原,糖原会与RNA一同沉淀出来,糖原浓度不高于4mg/ml时不会影响反转录cDNA第一链的合成,也不影响PCR反应。
2. 匀浆后,加氯仿前,样品可在-70 ℃放置一个月以上:
RNA沉淀可以保存在75%酒精中,2-8 ℃一个星期或-20 ℃一年以上。如果要长期保存,RNA可以溶解于100%去离子甲酰胺中,-70 ℃长期保存。