1. 逆转录反应
使用Trizol法抽提细胞RNA ,RNA纯度A260/280在1 .9 -2 . 0之间 。取1ug RNA使用Thermo逆转录试剂 盒 ( 货 号 : K1622或K16225 ) , 将 试 剂 盒 中 的 Random Primer 替 换 成 Biowing® Specific Reverse Transcription Primers进行反转录反应得到cDNA。
2. qPCR反应体系及条件
2. 1 阳性对照处理
将阳性对照cDNA进行4倍、8倍的梯度稀释,每个梯度建议三重复。
2.2 阴性对照处理
将阴性对照cDNA进行4倍、8倍的梯度稀释,每个梯度建议三重复。
2.3 样本处理
将待测样本cDNA进行4倍稀释作为测试浓度,每个样本做三重复。
【基线设置】
(以ABI 7500为例)
一般默认起始和终止基线位置为3 - 15个循环,应根据内参基因和TERT基因实际扩增曲线手动将基线起始循环数调整为指数增长期之前即可。
【阈值设置】
(以ABI 7500为例)
内参阈值设定: 以阳性对照4倍稀释cDNA定内参基因扩增曲线阈值, 内参基因(Cy5)初始浓度的CT值定为17±3;
TERT阈值设定: 以阳性对照4倍稀释cDNA定TERT基因扩增曲线阈值,TERT基因(FAM)初始浓度CT值的定为25±3。
【结果判读】
1. 阳性对照4倍稀释后TERT基因Ct值在25±3 , 内参基因Ct值在17±3 ,8倍稀释后TERT基因Ct值在26±3, 内参基因Ct值在18±3 。TERT基因和内参基因之间∆CT维持在9±3,保持稳定。
2 . 阴性对照经4倍、8倍梯度稀释后,TERT基因Ct值≥35 (或检测不到) , 内参基因Ct值仍在18±3之间,判定为端粒酶活性为阴性。
3. 结果说明
若待测样本内参基因Ct值在17±3之间,TERT基因Ct值<35且扩增曲线正常,则样本端粒酶活性
为阳性。
若待测样本内参基因Ct值在17±3之间,TERT基因Ct值≥35且无明显的扩增曲线则样本无端粒酶
活性。
【说明】
1 . 待测样本cDNA 4倍稀释作为模板,三次技术重复,不设置梯度稀释; 阳性对照、 阴性对照进行4倍、8倍梯度稀释,建议分别做三重复;避免偶然误差的产生。
2. 如果阳性/阴性对照4倍稀释后内参基因Ct值>20 ,表明参考品有降解或者试剂盒扩增效率下降。
3. 如果所有样本4倍稀释后内参基因Ct值>20 ,表明试剂盒的扩增效率下降。
4. 如果阳性对照4倍稀释后TERT基因Ct值>28 ,表明TERT基因检测系统失效。