自2020年起,COVID-19大流行成为21世纪最严重的全球性公共卫生危机之一,它不仅导致了全球范围内的生命损失和健康问题,还引发了经济衰退、就业市场动荡、心理健康危机等。
图1 SARS-CoV-2结构
新冠病毒颗粒呈圆形或椭圆形,主要包括:刺突糖蛋白(Spike Protein, S)、核衣壳(Nucleocapsid, N)、膜糖蛋白(Membrane Glycoprotein, M)、包膜蛋白(Envelope Protein, E)和RNA基因组。膜糖蛋白和包膜蛋白,对病毒的形态功能和组装释放相关。
S蛋白、N蛋白和RBD(受体结合域)是病毒的关键组成部分,它们在病毒的感染机制、免疫反应和疫苗开发中发挥着重要作用。
图2 刺突糖蛋白结构
S蛋白由S1和S2两个亚基组成。S1亚基包含RBD,负责与宿主细胞表面的ACE2受体结合,而S2亚基则参与病毒与宿主细胞膜的融合过程。S蛋白的RBD区域决定了病毒对宿主细胞的特异性和感染力。
N蛋白以串珠的形式结合到RNA基因组上,形成螺旋对称的核衣壳结构,与病毒RNA相互作用形成核糖核蛋白复合体(RNP),是病毒的核心。在病毒的复制和转录过程中发挥重要作用,并且参与病毒的组装过程,N蛋白也是疫苗设计和药物开发的潜在靶点。
病毒进化
随着病毒序列不断发生突变,新的变体不断出现,病毒进化产生的新毒株可能具有更高的逃逸能力、传播能力或可能加重重症风险。面临这些挑战我们也必须做出快速响应,持续监测病毒变异情况以及治疗方法。
图3 新冠基因组主系进化关系示意图
KP.2
KP.2(JN.1.11.1.2)是新冠病毒奥密克戎JN.1变异株的第三代亚分支,也是JN.1变异株中具有较强传播优势的一个亚分支。KP.2的有三个新增变异位点,其中两个在S蛋白上。
KP.2拥有更高的病毒适应度,可能成为世界范围内的主要谱系。根据基因组检测数据评估发现KP.2的相对有效繁殖数Re在USA、UK和加拿大,KP.2的Re分别是JN.1的1.22倍、1.32倍和1.26倍。截止2024年4月,UK估计KP.2的变异频率已经高达20%。使用BXX1.5疫苗血清和XBB.1.5、EG.5、HK.3和JN.1突破感染患者血清进行中和滴度检测,发现KP.2的逃逸能力也远高于JN.1。WHO在5月3日将KP.2列入“需要检测的变异株”。
除KP.2外,BA.2.75、BA.4、BA.5、XBB和JN.1也是一些备受关注的变异株。BA.2.75具有多个关键的S蛋白突变,特别是受体结合域(RBD)的突变,有较高的ACE2结合亲和力;BA.4和BA.5具有高逃逸特性已成为多个国家和地区的主要流行株;XBB是新冠病毒奥密克戎变异株的一个特殊亚型,属于重组变异株,它们可能由两种或以上的病毒株的遗传物质组合而成;而JN.1是BA.2.86的新型变体,继承了BA.2.86的抗原多样性和额外的L455S突变,JN.1可通过降低与ACE2的结合来实现更高的免疫逃避能力,世卫组织也将JN.1单独列为需留意的新冠变异株。
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斯达特也一直关注病毒迭代进化,上新近40款新冠蛋白与抗体,覆盖新冠KP.2、JN.1、XXB等多种流行病株,为新冠研究提供核心原料。
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参考文献
[1] Santos I D A ,Victória Riquena Grosche, Bergamini F R G ,et al.Antivirals Against Coronaviruses: Candidate
[2] Drugs for SARS-CoV-2 Treatment?[J].Frontiers in Microbiology, 2020,
[3]Veleri S .Neurotropism of SARS-CoV-2 and neurological diseases of the central nervous system in COVID-19 patients[J].Experimental Brain Research, 2022, 240(1):9-25.
[4] Molecular epidemiology of the SARS-CoV-2 variant in China revealed a new Omicron BF.7 sub-lineage (proposed to be BF.7.14),
[5] Virological characteristics of the SARS-CoV-2 KP.2 variant
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