超声打断是最常见的DNA片段化方式，超声波产生的剪切力能够将溶液中的DNA片段进行剪切。

常用的超声波打断仪分为接触式和非接触式，其中接触式打断仪价格较低，但是需要将超声波探头插入到样本中进行打断，容易造成打断不均匀，样本损失以及交叉污染等问题。非接触式打断仪不需要将探头插入到样品中，因此可以有效的避免上述问题。

非接触式的打断仪以Covaris超声波破碎系统最为常用，配合专门的Covaris打断管，可以将DNA精确打断成目标大小。超声打断会使得DNA的末端产生寡核苷酸突出，这些末端突出需要通过末端修复过程将其补平，之后才能进行加A和加接头等后续步骤。

在使用该系统打断之前，总会遇到各种层出不穷的问题，今天我们列举最常见的5个问题进行解答。

1 使用Covaris 超声打断仪能获得哪些范围内的DNA片段？
Covaris仪器能够提供可调节的DNA片段大小，范围从150bp至5000bp。采用AFA能量进行随机剪切，可生成呈对数正态分布的DNA片段图谱。可根据仪器型号以及打断管规格选择程序。

2 除了磷酸二酯键外，使用Covaris仪对样本进行处理的过程中，是否有其他键被断裂？
迄今为止，尚未有研究能够证明超声会对DNA分子内部化学键的影响。从数以亿计的碱基序列中获得的间接证据在很大程度上表明，仅会断裂磷酸二酯键。

3 在进行DNA超声打断时，建议使用哪种缓冲液？
推荐使用 Tris-EDTA pH 8.0 缓冲液（TE），它能确保在处理不同大小的DNA片段时都能获得一致的结果。

4 打断管内部有一根纤维，这根纤维有什么用途？处理过程中这根纤维会污染样本？
管内的纤维具备双重功能。首先，它为惯性空化提供成核位点。空化是指液体中气泡急剧坍缩，产生微射流从而裂解DNA的过程。其次，它能在处理过程中实现样品的高效混合。这种声学纤维在装入试管前已通过制造工艺彻底清洁，确保无任何有机污染物残留。

5 为什么在进行DNA打断时总是结果不一致不稳定？
结果不一致可能由多种因素引起，但以下几点是首先需要检查的重要事项：

1. 样品体积： 每种耗材均针对特定样品体积进行了优化，以确保最佳性能。例如，过大的顶空可能导致试管内偶尔形成气隙，从而破坏DNA持续稳定地片段化至目标尺寸范围。

2. 水位： 水位对于DNA片段化至关重要。水不仅能使声能从换能器耦合至试管中，还在处理过程中保持样品处于适宜温度、以及最小化可能导致玻璃试管破裂的振动方面起着重要作用。每台仪器和耗材都有具体的应遵循水位要求。

3. 水浴温度： 水温应严格控制并与应用相匹配。较高的温度会减弱样品流体中声学空穴坍塌的力度，导致平均片段大小向更大尺寸偏移，因此DNA片段化过程中的水浴温度应严格控制。

4. 水的脱气水平： 对于S、E和LE系列仪器，水浴中脱气不足可能导致声学耦合效率降低，从而改变平均片段大小。系统脱气泵应在进行AFA处理前和处理过程中提前运行。在处理开始前，水浴应至少脱气30分钟至1小时，直至能够在SonoLab软件中无错误地勾选"degas"指示器。

5. 水纯度： 藻类及颗粒物等杂质可能会散射高频聚焦声束，导致平均片段大小向更大尺寸偏移。水浴用水应为纯净蒸馏水或去离子水，每日更换或使用Covaris水循环处理系统进行清洁。

麦伯超声打断管

麦伯50μl超声打断管/  130μL超声打断管，是Covaris系列超声波剪切仪适配样品管。利用声波自动聚焦AFA技术，机械剪切DNA/RNA，所得片段DNA无热损伤无偏好，片段化范围150bp-1.5kb，具有高度的可重复性，适用于测序建库等核酸片段化过程。

即将上线更多规格超声打断管(8联管/96孔板)，敬请期待!