西北大学王朝晖课题组与上海交通大学陶生策课题组合作,于2020年3月11日在国际权威学术期刊《科学·进展》(Science Advances)上发表了题为“An Array of 60,000 Antibodies for Proteome-Scale Antibody Generation and Target Discovery”的研究论文。该研究成功构建了一个包含六万种抗体的高通量阵列平台,建立了覆盖蛋白质组规模的抗体资源库,为系统性蛋白质功能解析及分子靶标发现提供了重要技术支撑。此项工作标志着蛋白质组学工具开发取得了突破性进展,为后续大规模生物标志物筛选与功能研究奠定了方法学基础。

为应对这一挑战,本研究开发了一种集成62,208种单克隆抗体的超高通量抗体芯片。该平台创新性地利用抗体多特异性识别机制,实现了新抗体的高效发掘与筛选。经验证,该芯片系统可广泛应用于快速蛋白抗体制备、蛋白质组规模抗体库构建、表型相关蛋白质筛选以及肿瘤药物靶点发现等多个研究方向。
本研究所用抗体库具有高度多样性,其免疫原覆盖来自400余种物种的3,000多种蛋白质,包含超过15,000个线性表位。通过大规模小鼠免疫、骨髓瘤细胞融合及系统性筛选,最终成功建立了这一涵盖62,208种单克隆抗体的综合性资源库,为蛋白质组尺度上的系统生物学研究提供了重要的工具支持。

为进一步评估PETAL在蛋白质组水平抗体开发中的可行性,研究人员提取多种人源细胞系的膜蛋白与核蛋白组分,通过批量筛选成功获得了149个膜蛋白特异性单抗及55个核蛋白特异性单抗。经严格的特异性验证,这些抗体均可成功应用于免疫荧光(IF)、染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)等多种常用实验技术。
同时,研究团队还在超过10个不同物种(涵盖病毒、细菌、真菌、植物及动物)中成功验证了PETAL平台可用于批量开发物种特异性抗体。该结果表明,PETAL技术有望为目前缺乏高效抗体研究工具的非模式物种,提供一种规模化、系统性的抗体开发解决方案。

研究团队以“玉米籽粒发育”和“斑马鱼心脏再生”为模型,成功运用该策略鉴定出19个与玉米发育密切相关的蛋白质,以及6个与斑马鱼心脏损伤修复过程相关的蛋白质。该方法的核心优势在于,能够在一次性实验中同时实现关键靶标蛋白的鉴定与对应高质量单克隆抗体的获取,从而为后续的功能验证与机制研究提供高效、可靠的实验工具。


作为论文作者之一,上海交通大学陶生策教授指出:“抗体芯片技术虽已有一定研究基础,但既往芯片通常仅覆盖约千种抗体。本研究构建的芯片整合抗体数量达以往规模的60倍以上,这标志着该技术在应用广度与深度上取得了实质性跨越,为蛋白质组学研究和抗体药物开发提供了前所未有的工具支撑。”
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| 货号 | Panel名称 | 种属 | 检测指标 |
| LXAH015-1 | 人多能干细胞抗体芯片Panel(15因子) | Human | Sox2,E-Cadherin,hCG-α,Oct-3/4,Nanog,Alpha-Fetoprotein (AFP),GATA-4,HNF-3 beta/FoxA2,PDX-1/IPF1,SOX17,Otx2,TP63/TP73L,Goosecoid (Gsc),Snail,VEGF R2/KDR/Flk-1 |
| LXAH026-1 | 人细胞应激抗体芯片Panel(26因子) | Human | DKK-4,Bcl-2,Cytochrome C,HSP60,HSP70,IDO/IDO1,ADAMTS1,HIF-2 alpha,Phospho-p38 alpha (T180/Y182),Phospho-HSP27 (S78/S82),Phospho-p53 (S46),Carbonic Anhydrase IX,PON1,Cited-2,PON2,COX-2,PON3,Phospho-JNK Pan (T183/Y185),Thioredoxin-1,NFkappaB1,SIRT2,FABP1/L-FABP,p21/CIP1,SOD2,HIF-1 alpha,p27/Kip1 |
| LXAH032-1 | 人蛋白酶抑制剂抗体芯片Panel(32因子) | Human | Serpin E1/PAI-1,Lipocalin-2/NGAL,Cystatin C,Cystatin B,Serpin F1/PEDF,HE4/WFDC2,TIMP-4,TFPI,TIMP-3,TIMP-2,TIMP-1,APP,Lipocalin-1,Cystatin A,Testican 1/SPOCK1,RECK,Testican 2/SPOCK2,Serpin A5,Cystatin E/M,Serpin A8/AGT,TFPI-2,EMMPRIN,Serpin A9/Centerin,Fetuin B,Serpin A12,HAI-1,Serpin B5/Maspin,HAI-2,Serpin B6,Serpin B8,Trappin-2/Elafin,Latexin |