GraphPad Prism作图入门实操教程、美化技巧和统计避坑指南
2026-02-09 来源:本站 点击次数:56核心痛点：只会用Excel绘制土气柱状图，统计方法选择混乱（分不清T检验与ANOVA的适用场景），且因未展示原始数据点频繁遭审稿人质疑。
今日目标：吃透统计方法选择逻辑，熟练运用Prism制作一张符合SCI标准、带原始数据点的散点柱状图。
统计方法选对才有效：T-test vs ANOVA
两组比较：Student's t-test（T 检验）
三组及以上比较：One-way ANOVA（单因素方差分析）
双变量比较：Two-way ANOVA（双因素方差分析）
原文点击：GraphPad Prism作图入门+统计避坑指南
这是科研新手最易踩的逻辑坑 —— 统计方法选错，再小的 P 值也毫无意义。
适用场景：仅 Control 组 vs 处理组两组对比
✅ 非配对 T 检验（Unpaired t-test）：最常用，两组样品完全独立（如两笼实验鼠）
✅ 配对 T 检验（Paired t-test）：同一组样品处理前后对比（如病人服药前 vs 服药后）
✅ 非配对 T 检验（Unpaired t-test）：最常用，两组样品完全独立（如两笼实验鼠）
✅ 配对 T 检验（Paired t-test）：同一组样品处理前后对比（如病人服药前 vs 服药后）
三组及以上比较：One-way ANOVA（单因素方差分析）
适用场景：多组对比（如 Control 组 vs 药物低浓度组 vs 药物高浓度组）
❌ 严重误区：多次做 T 检验两两对比（A-B、A-C、B-C），会成倍增加假阳性（Type I Error）概率
✅ 正确做法：直接用 One-way ANOVA，后续两两比较在 Post-hoc test（事后多重比较）中完成，常用 Tukey 或 Bonferroni 法
❌ 严重误区：多次做 T 检验两两对比（A-B、A-C、B-C），会成倍增加假阳性（Type I Error）概率
✅ 正确做法：直接用 One-way ANOVA，后续两两比较在 Post-hoc test（事后多重比较）中完成，常用 Tukey 或 Bonferroni 法
适用场景：存在两个研究变量（如 “时间：24h/48h”+“药物：Control/Drug”）
研究目的：既验证药物的有效性，也分析药物效果是否随时间产生变化
研究目的：既验证药物的有效性，也分析药物效果是否随时间产生变化
P 值的真相：读懂 “显著性” 到底是什么
显著性星级判定标准
在图中标注 P<0.05（*）时，你真的懂它的含义吗？
核心结论：P<0.05 绝不代表 “研究假设 95% 成立”
通俗解读：假设研究对象无实际差异（无效假设 H₀成立，如药物完全无效），仅因随机误差得出当前实验差异数据的概率＜5%。
核心结论：P<0.05 绝不代表 “研究假设 95% 成立”
通俗解读：假设研究对象无实际差异（无效假设 H₀成立，如药物完全无效），仅因随机误差得出当前实验差异数据的概率＜5%。
P>0.05P > 0.05P>0.05 (ns): Not Significant，无差异
P<0.05P < 0.05P<0.05 (*): 差异显著
P<0.01P < 0.01P<0.01 (**): 差异极显著
P<0.001P < 0.001P<0.001 (***): 差异极极显著（审稿人更认可的强显著性）
P<0.05P < 0.05P<0.05 (*): 差异显著
P<0.01P < 0.01P<0.01 (**): 差异极显著
P<0.001P < 0.001P<0.001 (***): 差异极极显著（审稿人更认可的强显著性）
实操教程：用 Prism 绘制 SCI 标准柱状图
Step 1 新建数据表格
Step 2 录入实验数据
Step 3 选择 SCI 标准图型
Step 4 一键完成统计分析
Prism 自动生成统计结果表，查看P value summary行，带星号即表示组间存在统计学差异。
美化技巧：告别 Prism 默认配色，打造 SCI 级图表质感
字体统一：选对字体 + 规范字号
误差线：选对类型 + 标注清晰
配色：拒绝艳俗，选经典款
精简布局：去繁就简
乐备实（上海优宁维生物科技股份有限公司旗下全资子公司），是国内专注于提供高质量蛋白检测以及组学分析服务的实验服务专家，自2018年成立以来，乐备实不断寻求突破，公司的服务技术平台已扩展到单细胞测序、空间多组学、流式检测、超敏电化学发光、Luminex多因子检测、抗体芯片、PCR Array、ELISA、Elispot、PLA蛋白互作、多色免疫组化、DSP空间多组学等30多个，建立起了一套涵盖基因、蛋白、细胞以及组织水平实验的完整检测体系。
顶刊作图新趋势：柱状图 + 原始散点，既展示均值又呈现个体数据分布，纯空心柱状图已不推荐！
打开 Prism，选择Column（列联表）（柱状图专用）
✅ 选择「Enter ... replicate values in side-by-side subcolumns」（输入原始重复数据，保留散点信息）
❌ 避免选「Enter Mean & SD」（仅适用于二次作图，会丢失个体数据）
✅ 选择「Enter ... replicate values in side-by-side subcolumns」（输入原始重复数据，保留散点信息）
❌ 避免选「Enter Mean & SD」（仅适用于二次作图，会丢失个体数据）
Step 2 录入实验数据
按组别列录入原始数据，例：
- Group A 列：Control 组原始数值
- Group B 列：Treatment 组原始数值
Step 3 选择 SCI 标准图型
左侧点击Graphs（图形），2 种可选方式（结果一致）：
- 直接选「Individual values」→「Scatter dot plot with bar」（带柱散点图，推荐）
- 选「Column bar graph」，在设置中勾选「Plot individual values」（显示个体数据）
Step 4 一键完成统计分析
点击顶部工具栏Analyze，按组别数选择统计方法：
- 两组比较→选t-test
- 三组及以上→选One-way ANOVA
Prism 自动生成统计结果表，查看P value summary行，带星号即表示组间存在统计学差异。
Prism 默认出图易显粗糙（黑框、字体杂乱），简单手动微调，就能大幅提升图表颜值，适配期刊要求！
✅ 全选文字统一改为Arial/Helvetica（国际期刊通用无衬线字体，显示清晰）
❌ 避免 Times New Roman（衬线体，小字号易模糊）
✅ 字号标准：坐标轴标题12-14pt，刻度数字10-12pt
❌ 避免 Times New Roman（衬线体，小字号易模糊）
✅ 字号标准：坐标轴标题12-14pt，刻度数字10-12pt
根据研究需求选择：Mean ± SD（展示数据分布）/ Mean ± SEM（展示数据精度）
⚠️ 务必在Figure Legend中明确标注所用误差线类型！
⚠️ 务必在Figure Legend中明确标注所用误差线类型！
❌ 非荧光实验，禁用大红大绿等高对比艳色
✅ 经典耐看：纯灰度搭配（黑 / 深灰 / 浅灰 / 白）
✅ 更优选择：Prism 自带Colors safe for colorblind（色盲友好配色，适配所有读者）
✅ 经典耐看：纯灰度搭配（黑 / 深灰 / 浅灰 / 白）
✅ 更优选择：Prism 自带Colors safe for colorblind（色盲友好配色，适配所有读者）
去掉多余的网格线（Grid lines），去掉上边框和右边框（Top and Right axis），只保留左边和下边（L形坐标轴），看起来更清爽。
乐备实（上海优宁维生物科技股份有限公司旗下全资子公司），是国内专注于提供高质量蛋白检测以及组学分析服务的实验服务专家，自2018年成立以来，乐备实不断寻求突破，公司的服务技术平台已扩展到单细胞测序、空间多组学、流式检测、超敏电化学发光、Luminex多因子检测、抗体芯片、PCR Array、ELISA、Elispot、PLA蛋白互作、多色免疫组化、DSP空间多组学等30多个，建立起了一套涵盖基因、蛋白、细胞以及组织水平实验的完整检测体系。
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