空间组学长期面临「不可能三角」（大视野、高分辨率、全转录组无法兼得），以及灵敏度与通量之间的矛盾。过去的技术总是在通量、灵敏度、基因覆盖之间顾此失彼。而Atera凭借全转录组覆盖、单细胞级灵敏度与高通量灵活性，彻底打破了这一困局，为空间生物学研究提供了全新的可能。


01  Atera技术亮点

• 全转录组覆盖

Atera检测基因数>18,000（覆盖绝大部分蛋白编码基因），还可额外定制1,000个基因，不再局限于靶向Panel。并且将支持更多物种的检测。

Atera官方实测数据—临床宫颈癌样本中主要细胞类型的空间定位

• 单细胞分辨率

基于原位成像及多模态细胞分割技术，像素尺寸约0.2 μm，能够实现真正的单细胞甚至亚细胞分辨率。

Atera官方实测数据—组织样本分子水平上不同的细胞状态

• 超高灵敏度

多轮独立及技术重复实验验证了Atera的高灵敏度、高特异性、低假阳性水平与高稳定性。

Atera官方实测数据—验证灵敏度、特异性与稳定性

A.多次实验运行下，组织单个细胞的转录本数量（灵敏度分析）。B. 同一组织中，Atera WTA 与 Chromium Single Cell Flex Apex单细胞技术的基因检出相关性为 r² = 0.75。C. 同一玻片上两次技术重复，细胞转录本数量相关性为 r² = 0.99。

根据10x 官方发布的数据集，对比同一块组织在Xenium v1和Atera的数据，及相同组织类型在Xenium及Atera的数据，Atera的基因中位数及中位转录本数等指标（灵敏度），提升了一个数量级以上，约15倍-20倍。超高的灵敏度可以帮助我们检测组织微环境中新的细胞状态、新的相互作用、稀有细胞类型等。

• 超大视野，高通量

捕获面积>5cm²/每张，运行最多4张/次芯片，可分析800cm²样本/年，支持：FF、FFPE、组织芯片（TMA）。

Atera更大视野芯片

• 多组学拓展

同一切片可实验RNA表达+形态学（H&E染色）检测，未来将支持空间蛋白检测。除全转录组方案外，可定制靶向Panel定制（额外加1,000基因，或自定义2,000基因Panel，自定义3,000基因Panel即将推出），适用于SNV、可变剪切、CRISPR gRNA、病原体序列等检测。

Atera将支持更多空间组学研究

 
02 Atera原位空间分析实测数据

近日，10X官方更新了Atera的实测数据。目前的2例数据检测了乳腺癌和宫颈癌的FFPE样本。从结果来看，Atera全转录组检测表现优异，灵敏度与数据产出均大幅领先于Xenium。

• 乳腺癌FFPE样本实测对比

实测样本：WTA Breast Cancer (FFPE)，Atera转录本检出与数据产出能力显著优于Xenium。

Atera官方实测数据—组织样本分子水平上不同的细胞状态

• 宫颈癌FFPE样本实测对比

实测样本：WTA Cervical Cancer (FFPE)，Atera依旧表现出高检出、高灵敏度优势。

从这两个释放的实测数据我们可以看出，相比于Xenium，Atera的全转录组分析方案可全面覆盖18000+编码基因，彻底摆脱Panel限制；其单细胞中位转录本检出量较Xenium提升8–15倍，凭借更高的检测灵敏度、更大的组织捕获面积及更强的数据产出能力，进一步助力更广泛深刻的空间转录组学研究。
 

 


03 三大空间组学平台技术对比

 · Visium HD：空间研究的“发现工具”

基于 NGS 的全转录组方案，适合低成本、大范围探索（如空间图谱构建、差异筛选），是空间发现的“第一步”。但其分辨率是“接近单细胞”（8 μm bin），对不规则或相邻细胞区分有限。

· Xenium：空间研究的“验证工具”

基于成像的靶向检测，单细胞级分辨率（0.2 μm），超高灵敏度，能检测到Visium HD“看不到”的信号。Xenium的检测结果可以与免疫组化（IHC）、高通量空间蛋白组数据直接比对，可验证关键细胞类型和信号通路。简单来说，Xenium是把Visium HD的发现拿到单细胞层面去验证、去定位、去深挖。但覆盖基因最多5,000–6,000 个，不适合无预设靶点的发现研究。

· Atera：Xenium的“全转录组升级版”

融合了成像的单细胞分辨率与全转录组覆盖（>18,000基因，可额外定制1,000 基因），单张玻片成像面积>500 mm²，一次运行最多4张玻片，通量大。

Atera填补了Visium HD和Xenium之间的空白，既能像Visium HD一样无偏发现，又能像Xenium一样看清单个细胞。