单细胞转录组（scRNA‑seq）、单细胞染色质可及性测序（scATAC‑seq）、单细胞蛋白组等单细胞组学技术，已经成为解析组织细胞异质性、挖掘稀有细胞亚群、疾病细胞分子机制、药物作用细胞图谱的核心科研手段。所有单细胞测序技术的实验起点，均是高质量的单细胞悬液。样本解离制样环节如果把控不到位，会直接出现细胞活率低、大量细胞碎片、细胞团聚黏连等问题，会造成后续测序数据严重失真，直接导致整个单细胞项目失败。只有标准化组织解离‑单细胞悬液制备全流程质控体系，从源头规避制样风险，保障单细胞测序项目稳定输出可靠数据。

2、芯片落孔图：绝大多数微孔只落入单个完整细胞；极少出现团块、碎片；细胞形态完整，无大量破碎残骸。

3、质控结果：细胞活率高，团聚率低，碎片少，满足 scRNA‑seq、scATAC‑seq、单细胞蛋白组全部单细胞实验要求，可以上机。

（2）低质量单细胞悬液
1、活死荧光染色图：大量细胞碎片，细胞形态破碎，细胞黏连抱团现象明显，红色死细胞数量显著增多，细胞大小不均一。

2、芯片落孔图：大量微孔落入细胞团块、破碎细胞残骸；很多孔位同时落入多个细胞；碎片充斥大量微孔。

3、质控结果：活率差、团聚严重、碎片含量高。该类样本不建议直接上机测序。强行上机会出现有效细胞数目少、高双细胞比例、高背景噪音，最终测序数据不可靠。

重点提示：很多科研人员重视测序上机环节，却忽视前面解离制样。单细胞测序的数据上限，在组织解离制备单细胞悬液阶段就已经决定。后续测序、生信分析手段，只能做数据过滤，不能修复已经破损、死亡、抱团的细胞。