miRNA可调控基因活性，广泛参与机体生理过程，与各类疾病密切相关。然而，遗传差异如何影响大脑内miRNA的表达水平并诱发脑部疾病，目前尚不明确。研究miRNA相关的遗传位点，有助于解析脑部疾病的发病机制，提升远距离基因靶点的筛选效率，验证miRNA和下游蛋白的真实调控关系，进一步完善基因调控网络。由于miRNA存在细胞特异性，人类功能性miRNA缺乏统一的标准清单。

本研究基于老年人前额叶皮层样本，系统绘制大脑miRNA遗传调控图谱。采用两套数据库交叉验证，分析miRNA与宿主基因、下游蛋白的关联以及调控模式的组织差异。结合16 种精神、神经退行性疾病遗传数据，筛选出脑病关键miRNA，阐明大脑miRNA的遗传调控规律，挖掘脑病候选靶点，并构建公开可用的大脑miRNA遗传调控数据集。  
1. 样本采集与miRNA测序；
2. 双数据库并行注释miRNA；
3. 鉴定 miR-QTL，绘制调控图谱；
4. 解析多层级基因调控关系；
5. 分析调控位点分布与特异性；
6. 整合脑病遗传数据筛选靶点；
7. 汇总成果，构建共享数据集。  
miRNA片段小、丰度低、范围窄，建库过程中易混入引物二聚体与rRNA、tRNA、mRNA等非特异性扩增片段，严重干扰 miRNA 表达定量与测序后分析。本研究在建库完成后，采用 Sage Science 公司的 Pippin Prep 全自动 DNA 片段筛选系统对 miRNA 文库精准分选，有效剔除引物二聚体、长短杂片段等无效产物，提升 miRNA 文库纯度和有效测序数据占比。

传统磁珠片段筛选无法控制回收范围，手工切胶回收步骤复杂、时间长且效率低。相比之下，Pippin Prep 全自动切胶仪筛选精度高、片段区间精准可控，全程无人工操作误差。对743个大批量、低丰度脑 miRNA建库样本，该设备保证了批次稳定性和数据重复性，可1.5小时内完成回收，满足后续 miR-QTL 机制解析的高质量测序数据要求。  
1. 人脑miRNA存在广泛且特异的遗传调控；
2. miR-QTL具有固定基因组分布与独立调控特征；
3. 内含miRNA与宿主基因遗传调控相对独立；
4. miRNA可远距离反式调控下游蛋白表达；
5. miR-QTL调控具有脑功能区及细胞特异性；
6. miRNA遗传调控关联脑疾病且兼具保守与特异性。
 
原文链接：https://www.nature.com/articles/s43587-024-00778-x
厂家介绍：
Sage Science 公司位于美国马萨诸塞州，2010年成立，专注于核酸领域的样品制备，在2万篇文献中得到应用，包括众多Nature、 Science、 Cell系列的文章，是DNA片段筛选回收领域的行业金标准。
* 全自动回收：采用双通道电泳回收专利技术，回收过程全自动运行；
* 精准回收：精确度高达93-99%，远高于手工切胶和DNA片段分选磁珠的方法
* 微量回收：低起始量，低至ng级，控制时间回收，不直接检测样品
* 高回收率：50-80%的高回收得率
* 省时间：5分钟的手工操作时间，无需额外制胶和切胶
* 全自动完成DNA片段分选, 软件中自由选择需要筛选的片段范围，免去了切胶纯化的繁琐步骤，比核酸片段筛选磁珠更加精准可控；
* 用于DNA常规分子生物学，精准彻底地去除PCR引物二聚体、非特异性片段等，去除酶切产物中非目标DNA条带；
* 用于小片段DNA筛选回收（DNA Size Selection），如small RNA文库回收、cfDNA／ctDNA循环血游离DNA／循环血肿瘤DNA测序文库、ddRAD-SEQ双酶切简化基因组测序文库、16S文库微生物测序文库回收等、ChIP-seq文库、MeDIP-seq / hMeDIP-seq甲基化DNA免疫沉淀片段测序文库、ATAC-seq转座酶可及染色质高通量测序文库、遗传病 panel 扩增子文库等各种复杂样本的处理，提高测序数据质量；
* 低起始量样品的精准浓缩回收：血浆/血清cfDNA/ctDNA，微量细胞/单细胞，空气/冰川/岩石样本，低丰度病原体等；
* 降解样本的精准浓缩回收：FFPE（石蜡切片）、古DNA、腐烂样本、RNA样本等；
* 背景极高的复杂样品的精准筛选回收：废水、土壤、腐殖质、粪便、肠道内容物、痰液，脓液、临床拭子、血液、脑脊液、共生微生物、食品微生物等。
 
环亚生物：为科研提供 “全链条”支持
环亚生物科技（APG BIO）作为美国Sage Science公司DNA片段回收系列产品在中国区的独家代理商，为国内二代测序、三代测序用户提供测序样品前处理、质控的整体解决方案：组织研磨仪、单细胞悬液制备仪、细胞破碎仪、超声聚焦打断仪、全自动DNA片段分选回收仪、核酸片段分析仪、脉冲场电泳仪、全自动建库仪、荧光计、超微量分光光度计等。