应用案例一：Binaree组织透明化技术结合三维重建血管在研究低氧条件下脑血管重塑
The Role of PRRC2B in Cerebral Vascular Remodeling Under Acute Hypoxia in Mice
 

高原暴露可导致多种认知功能障碍。脑血管系统通过减少对大脑的氧和营养供应在缺氧诱导的认知缺陷中起着不可或缺的作用。RNA N6‐甲基腺苷(m6A)易受修饰并调节基因表达以应对环境变化，包括缺氧。采用Binaree组织透明化与共聚焦成像分析发现在内皮细胞中，条件敲除PRRC2B可促进缺氧诱导的血管重塑和脑血流再分布，从而减轻缺氧诱导的认知功能下降。因此，PRRC2B作为一种新型RNA结合蛋白在缺氧诱导的血管重构过程中发挥重要作用。这些发现为缺氧诱导的认知功能下降提供了新的潜在治疗靶点。
 

研究亮点
组织透明化技术结合血管三维重建与高分辨率血管成像
Binaree技术结合三维重建，使得血管成像的分辨率大大提高，能够清晰地展示低氧条件下血管的微细结构变化，如新生血管的形成、血管分支的变化等。

动态与定量分析低氧条件下的血管反应
使用透明化和三维重建技术，能够动态观察并记录低氧环境下脑血管的重塑过程。这包括详细追踪低氧引起的血管生成、扩展、重塑和功能性改变，帮助理解这些过程的时间动态特征。

通过三维重建获得的数据，可以进行精确的定量分析，评估血管长度、分支点数量、血管密度、直径等参数的变化。这些量化数据有助于深入理解低氧条件对血管结构的具体影响。

验证PRRC2B在内皮细胞中的关键作用
验证了PRRC2B在内皮细胞迁移、血管生成和结构重塑中的关键作用。这些技术提供了直观的证据，支持PRRC2B作为潜在治疗靶点在低氧诱导认知障碍中的应用前景。

应用案例二：Binaree快速组织透明化结合大鼠MACO缺血模型

组织透明化MCAO模型大鼠脑内血管三维可视化流程

MCAO模型组织透明化大鼠脑内血管三维可视化血管重建

(A)凝集素染色的3mm厚大鼠脑切片血管三维重建图。图像由配备4倍物镜的LSMS获得。
(B)最大投影(z-stack)脑冠状切片标记线三维图像为正交视图所见xz平面。
(C-F)为(A)框状区域XY平面(成像体积为1000 μm ×1000 μm ×1000 μm)的高倍视图。
(D, F)示踪剂(C, E)示踪剂模型。
(G, J)为(A)中框框区域的三维重构图。
(H, I)显示了(G, J)随机深度的脑切片图像(相对于顶部成像面Z= 640 um)。
(K)每片3 - 4个视场的长度和血管直径量化(n=3)。
比例尺= 2mm in (A-B)， 100 μ in (G- f, H-I)， 300 μ in (G, J)。

MCAO后24小时组织透明化样本gfap相关免疫荧光强度的三维可视化和定量分析

 

(A-B)大鼠0.5 mm厚的脑切片经凝集素(A)和GFAP(B)染色后的三维重建。(C-J)显示(A和B)中框区域的高倍放大视图。损伤侧皮质血管密度较对侧减少，gfap阳性荧光强度较对侧增加。(E-F)损伤侧皮质和纹状体gfap阳性细胞的形态学变化。(G) GFAP比值图。MCAo损伤后24 h同侧与对侧皮质相关荧光强度。梗死区gfap相关荧光强度明显增加。数据以平均值表示:误差条表示平均值的标准误差。“pc0.05。比例尺A-B为1 mm, C-J为100 μm, K-N为50 μm。