百蓁生物全面解码猪免疫肽组研究，赋能疫苗开发和瘟病防控
2025-05-26 来源:本站 点击次数:104免疫肽组是指对有核细胞在参与抗原呈递途径中的MHC I类或II类蛋白质上呈递全部多肽的研究，对于探究了解细胞介导和体液反应中的免疫原性表位至关重要。对 I 类和 II 类免疫肽的动力学和组成的研究，不仅能够发现个性化癌症免疫疗法的靶点（例如来自肿瘤特异性突变的新抗原或肿瘤相关抗原），还有助于开发新的mRNA /多肽疫苗和免疫细胞疗法。目前，在该领域人和小鼠研究的比较多，但很少有研究涉及其他物种。
猪作为重要经济动物，常受非洲猪瘟（ASFV）、蓝耳病（PRRSV）、猪瘟（CSFV）等高致死率病毒威胁，以及细菌感染（如猪链球菌）和免疫抑制性疾病（如PCVAD）影响，导致养殖业巨额损失并引发公共卫生风险。猪免疫肽组学检测在疫苗开发和疾病防控机制研究方面具有重要的应用价值，为猪病防控和猪群健康管理提供了有力的技术支持。
此外，猪还在人类疾病健康研究中发挥着不可替代的作用，其解剖学和生理学特征与人类高度相似，是研究心血管疾病、神经系统疾病、糖尿病、异种器官移植的理想模型，其免疫肽组学研究可以帮助揭示人类疾病中的免疫反应机制。
通过对猪免疫肽组的深入研究，可以更好地理解免疫系统的复杂性和多样性，揭示免疫反应的分子机制。这些基础研究成果不仅对猪的健康养殖有重要意义，也为人类免疫学研究提供了参考。猪的MHC分子被称为猪白细胞抗原（SLA），其结构和功能与人类的HLA（人类白细胞抗原）非常相似。SLA I类基因，主要包括 SLA-1、SLA-2 和 SLA-3，这些基因编码的蛋白质在所有有核细胞表面表达，主要负责呈递内源性抗原肽段给CD8+细胞毒性T淋巴细胞（CTLs），从而启动细胞免疫反应。SLA II类基因，包括 SLA-DR、DQ、DM 和 DO，这些基因编码的蛋白质主要在专职抗原呈递细胞（如树突状细胞、巨噬细胞和B淋巴细胞）表面表达，负责呈递外源性抗原肽段给CD4+辅助性T细胞。
图1. 猪SLA分子（DOI: 10.1146/annurev-animal-020518-115014）
百蓁生物迎来重大升级，其免疫肽的检测范围从人和小鼠的物种进一步拓展至猪的物种，为客户提供从样品处理到抗原发现的完整解决方案。该平台从SLA-I/II抗体开发、样本制备与液质分析方法以及数据解析全流程进行针对性优化，使平台技术能应用于猪源免疫肽深度检测、猪源递呈病原体免疫肽深度检测等研究。
图2. 百蓁生物兼容MHC分型与样本类型
通过对猪的PBMC细胞系进行蛋白提取，之后使用特异性抗体对SLA复合物进行免疫沉淀（WB结果如图3所示），分离出与SLA结合的肽段并进行质谱检测。检测结果显示，鉴定到肽段的长度以 9个氨基酸为主，符合经典的 MHC I型抗原肽长度的分布。
图3. SLA-I WB图(β2m)和鉴定肽段分布
对免疫肽进一步的分型分析，结果显示每个分型中都有较多肽段的支持，结合的肽段的数目占9个氨基酸肽段数目的80%左右（图4），说明富集效果较好。
图4. 肽段与SLA分型结合分析
猪免疫肽组学检测在多个领域具有广泛的应用。在疫苗开发方面，通过鉴定MHC呈递的肽段，可以发现潜在的抗原表位，从而设计出更有效的疫苗。在疾病防控方面，免疫肽组学检测可以帮助研究人员了解猪在感染病原体后的免疫反应机制。通过对感染细胞的免疫肽组进行分析，可以鉴定出病原体特异性的肽段，从而为疾病的早期诊断和治疗提供依据。免疫肽组学检测还为个性化医疗提供了可能。通过对个体猪的免疫肽组进行分析，可以发现与疾病相关的特异性肽段，从而为精准治疗提供指导。
近期，哥伦比亚国立大学Manuel A. Patarroyo研究团队利用质谱技术对沙门氏菌感染猪的免疫肽进行研究（Biology 2024, 13, 832），以寻找与SLA-II类结合的细菌候选抗原肽（如图4所示）。通过免疫肽技术共鉴定出31个独特的沙门氏菌MHC II型的抗原肽（表格1），鉴定出的这些细菌抗原肽可以作为开发针对沙门氏菌感染的新型肽段亚单位疫苗的潜在候选者，对于控制猪沙门氏菌病具有重要意义。
图5. 利用质谱技术对沙门氏菌感染猪的免疫肽进行研究
表格1. 沙门氏菌MHC II细菌抗原肽
新抗原发现完整解决方案
百蓁生物为客户提供从样品处理到新抗原发现的完整解决方案：利用质谱检测的方法进行免疫肽组的解析，再结合特有的AI算法发现新抗原，并对免疫原性进行预测，为下游的细胞学靶点验证提供更精准的新抗原候选列表。DeepImmu®️技术平台首创的基于DeepNovo®️的数据分析流程，特别对于传统基因组、转录组、核糖体组等测序结果以外的non-canonical免疫多肽具有准确的分析能力，而这些non-canonical免疫多肽更是肿瘤复发以及肿瘤特异的抗原的来源。
多 鉴定深度超越30000+免疫多肽，突破10mg组织样品极限（5000+多肽）
快 最快四周实现从样本处理到新抗原验证的完整解决方案（含细胞水平验证）
好 实验重现性好，免疫肽富集有效性高，谱图质量好，全流程质控
准 AI赋能的新抗原免疫原性预测，驱动高效的验证平台，筛选新抗原更准确
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