• 三维构象：天然 VP2 蛋白是 IBDV 衣壳的主要组成部分，以同源二聚体或三聚体形式组装成病毒衣壳表面的突起结构，其空间构象依赖于多个二硫键（如 Cys229 与 Cys247、Cys317 与 Cys329）的稳定作用。
• 功能区域： 
  • 高变区（HR）：位于氨基酸残基 214-284 区域，包含多个抗原决定簇（如 222、242、253、256 位氨基酸），是病毒与中和抗体结合的关键位点，也是毒株变异的热点区域。
  • 保守区：如 N 端（1-100 位氨基酸）和 C 端（300-411 位氨基酸），参与病毒衣壳组装及宿主细胞受体结合（如与衰变加速因子 DAF 结合）。

• 构象模拟：通过杆状病毒表达系统等真核表达体系生产的重组 VP2 蛋白，可形成类似天然病毒的构象依赖性抗原表位；而原核表达（如大肠杆菌）的 VP2 蛋白常以包涵体形式存在，需复性处理以恢复空间结构。

• 天然 VP2 蛋白：由 426 个氨基酸组成，理论分子量约为 47 kDa，但由于糖基化修饰（如 N 端第 21、24 位天冬酰胺的糖基化），天然 VP2 蛋白的实际分子量在 55-60 kDa 之间。
• 重组 VP2 蛋白：分子量因表达系统而异： 
  • 真核表达（杆状病毒）：糖基化修饰较完整，分子量接近天然蛋白（55-60 kDa）。
  • 原核表达（大肠杆菌）：无糖基化修饰，分子量约为 47 kDa，需通过质谱或 SDS-PAGE 验证。

• 中和表位核心：重组 VP2 蛋白包含 IBDV 的主要中和抗原表位（如 194-214、249-295 位氨基酸区域），可诱导宿主产生高效中和抗体，保护法氏囊免受病毒攻击。
• 构象依赖性：其抗原活性高度依赖空间构象，线性表位（如 200-210 位氨基酸）与构象表位（如 250-260 位氨基酸形成的环区）共同决定抗体结合效率。

• 真核表达：杆状病毒系统表达的重组 VP2 蛋白可溶性高，可分泌至培养基中，稳定性较好（4℃可保存数周）。
• 原核表达：大肠杆菌表达的 VP2 蛋白易形成包涵体，需通过变性剂（如 8M 尿素）溶解后复性，可溶性及活性较低，需优化表达条件（如低温诱导、分子伴侣共表达）。

• VP2 高变区氨基酸突变（如 256 位 Asn→Ile、222 位 Ser→Asn）可导致抗原性改变，是 IBDV 突破疫苗免疫的主要机制。

根据重组 VP2 蛋白的表达系统与存在形式，常用纯化方法如下：

• 表达形式：分泌型表达于昆虫细胞培养基中，或存在于细胞裂解液中。
• 纯化流程： 
  • 澄清：离心或过滤去除细胞碎片，收集上清液。
  • 亲和层析：利用重组 VP2 蛋白 C 端融合的标签（如 His-tag、GST-tag）进行镍柱（Ni-NTA）或谷胱甘肽琼脂糖亲和纯化，特异性结合目标蛋白。
  • 离子交换层析：进一步去除杂蛋白，优化纯度（纯度可达 95% 以上）。
  • 浓缩与复性：通过超滤离心浓缩蛋白，若存在少量聚集物，可通过透析复性处理。

• 表达形式：多以包涵体形式存在于细菌沉淀中。
• 纯化流程： 
  • 破菌：超声或高压均质破碎细菌，离心收集包涵体。
  • 溶解：用 8M 尿素或 6M 盐酸胍溶解包涵体，加入还原剂（如 DTT）破坏错误折叠的二硫键。
  • 亲和纯化：His-tag 标记的 VP2 蛋白通过 Ni-NTA 柱纯化，洗脱液含高浓度咪唑。
  • 复性：梯度透析去除变性剂，同时加入氧化还原对（如 GSH/GSSG）促进二硫键正确折叠，复性后通过凝胶过滤层析（如 Superdex 系列）去除聚集体。

• SDS-PAGE 与 Western blot：检测分子量及纯度，重组 VP2 蛋白在凝胶中呈现单一清晰条带（真核表达约 55 kDa，原核表达约 47 kDa）。
• ELISA 与中和试验：验证抗原活性，重组 VP2 蛋白需能特异性结合 IBDV 阳性血清，并诱导中和抗体产生。

重组 VP2 蛋白的结构与分子量直接影响其抗原活性，而纯化方式的选择需结合表达系统特性（真核 / 原核）与应用场景（诊断 / 疫苗）。真核表达系统（如杆状病毒）因糖基化修饰完整、可溶性高，成为疫苗用重组 VP2 蛋白的首选；原核表达则需通过复杂复性工艺恢复活性，更适合科研或低成本诊断抗原制备。纯化后的重组 VP2 蛋白需通过多维度验证，确保其结构完整性与免疫原性，为 IBD 防控提供有效工具。