• 三维构象：天然 N 蛋白是 IBV 核衣壳的主要组成蛋白，以同源二聚体形式包裹病毒基因组 RNA，形成螺旋状核衣壳结构。其结构分为： 
  • N 端结构域（NTD，1-130 位氨基酸）：富含精氨酸（R）和甘氨酸（G），形成带正电荷的 RNA 结合区，通过静电作用与病毒基因组 RNA 结合。
  • 中心疏水区（131-230 位氨基酸）：包含 α- 螺旋和 β- 折叠交替的结构，参与二聚体形成及核衣壳组装。
  • C 端结构域（CTD，231-411 位氨基酸）：高度保守，含多个抗原表位，通过与病毒包膜蛋白（M 蛋白）相互作用，介导核衣壳与病毒包膜的结合。

• 线性抗原表位丰富：重组 N 蛋白的抗原表位多为线性表位（如 30-45、150-165、350-365 位氨基酸），构象依赖性较低，因此原核表达系统即可有效呈现抗原活性。

• 天然 N 蛋白：由 411-422 个氨基酸组成（不同毒株略有差异），理论分子量约为 46-48 kDa，无糖基化修饰，实际分子量与理论值接近。
• 重组 N 蛋白：不同表达系统中分子量一致，约 46-48 kDa，可通过 SDS-PAGE 验证（条带位置清晰，无显著修饰导致的分子量偏移）。

• 群特异性抗原：N 蛋白是 IBV 最保守的结构蛋白，其抗原表位在不同血清型（如 M41、H120、QX 型）中高度保守，可用于 IBV 通用型诊断（如 ELISA、胶体金检测）。
• 免疫反应靶点：感染后宿主产生的抗 N 蛋白抗体虽无中和病毒作用，但可作为 IBV 感染的血清学标志物（如 IgM/IgG 检测）。

• 高稳定性：N 蛋白富含 α- 螺旋和 β- 折叠，结构紧凑，耐蛋白酶降解，4℃可稳定保存数月，-20℃可长期保存。
• 可溶性优势：在原核系统中易可溶性表达（尤其在大肠杆菌 BL21 菌株中），极少形成包涵体，无需复杂复性工艺。

• RNA 结合能力：NTD 区域的 RGG 基序（精氨酸 - 甘氨酸 - 甘氨酸重复序列）可特异性结合病毒基因组 RNA 的 5’端非翻译区（UTR），参与病毒复制和转录。

根据重组 N 蛋白的表达形式（可溶性 / 包涵体），常用纯化方法如下：

• 表达形式：可溶性表达于细菌裂解液上清中，或少量以包涵体形式存在。
• 纯化流程： 
  • 破菌：超声或溶菌酶处理破碎细菌，4℃离心收集上清液（可溶性蛋白）或沉淀（包涵体）。
  • 亲和层析（首选）： 
    • 若蛋白融合 His-tag，通过 Ni-NTA 柱纯化：平衡液（20 mM Tris-HCl, 500 mM NaCl, pH 7.4）冲洗，200-500 mM 咪唑洗脱目标蛋白，纯度可达 90% 以上。
    • 若融合 GST-tag，用谷胱甘肽琼脂糖树脂纯化，还原型谷胱甘肽洗脱。
  • 离子交换层析（精纯）：利用 N 蛋白的电荷特性（等电点 pI 约 9.0，带正电荷），通过阳离子交换柱（如 SP Sepharose）进一步去除杂蛋白，优化纯度至 95% 以上。
  • 浓缩与脱盐：超滤离心（10 kDa 截留分子量）浓缩蛋白，PBS 缓冲液透析脱盐，-80℃冻存前可添加 5% 甘油防止冻融变性。

• 纯化流程： 
  • 分泌型表达：酵母（如毕赤酵母）或昆虫细胞培养上清液经离心澄清后，直接通过亲和层析纯化（流程同原核），无需破菌步骤。
  • 细胞内表达：杆状病毒感染昆虫细胞后，裂解细胞收集蛋白，纯化步骤与原核类似，但需注意真核细胞杂蛋白的去除（如通过疏水层析辅助纯化）。

• 若 N 蛋白以包涵体形式表达，需用 8M 尿素溶解，Ni-NTA 柱纯化后，通过梯度透析（尿素浓度从 8M→0M）复性，同时加入 10% 甘油促进蛋白正确折叠，复性效率可达 60%-70%。

• SDS-PAGE：重组 N 蛋白在 46-48 kDa 处呈现单一清晰条带，纯度≥90%（考马斯亮蓝染色）。
• Western blot：可与 IBV 阳性血清发生特异性反应，证实抗原表位正确性。
• ELISA：包被重组 N 蛋白后，可高效捕获 IBV 感染血清中的抗体，OD 值（450 nm）≥2.0（阴性对照 OD≤0.1）。

IBV 的 N 蛋白因其结构保守、抗原性稳定及可溶性表达优势，成为 IBV 检测与科研的理想靶点。原核表达系统（大肠杆菌）因低成本、高表达量成为首选，配合 Ni-NTA 亲和层析即可获得高纯度蛋白；真核系统（如酵母、杆状病毒）则用于特殊需求（如分泌表达、结构研究）。纯化后的 N 蛋白可广泛应用于 IBV 的血清学诊断（如抗体检测试剂盒）、疫苗佐剂研究及病毒复制机制解析，为 IB 防控提供关键工具。