引言
靶向蛋白质降解是一种新策略,旨在出于治疗目的,从细胞中选择性地消除特定蛋白质。虽然最初这项研究主要关注 PROTAC 分子,但如今,新的靶向降解方法正在涌现。其中之一就是降解 TAG (dTAG) 技术。
dTAG是一种创新的靶标验证方法。像PROTACs一样,该方法使用一种异双功能小分子,建立目标蛋白与E3泛素连接酶之间的三元复合物。然而,dTAG技术的独特之处在于,通过CRISPR/Cas9将双功能降解剂的一部分结合位点人工引入到目标蛋白中,这使得dTAG成为进行靶标验证研究、探讨剂量依赖效应的理想工具。
本文所述的dTAG蛋白降解分析使用了双荧光素酶报告系统来测量靶蛋白降解。为此,使用萤火虫荧光素酶作为基准标记物,该标记物不应受到dTAG降解的影响。第二种荧光素酶是纳米荧光素酶(Nanoluciferase),以碎片化的非活性形式(HiBiT)与靶蛋白融合。dTAG降解剂能够通过引入的dTAG结合基序,将靶蛋白与E3泛素连接酶结合,从而形成三元复合物(见图1)。这会导致靶蛋白及其融合的HiBiT片段的泛素化并随之降解。为了测量纳米荧光素酶的荧光发射,在降解后加入LgBiT。这个小的纳米荧光素酶片段可以完成未降解的HiBiT片段,进而形成活性纳米荧光素酶,产生荧光信号。纳米荧光素酶与萤火虫荧光素酶的发射比值则成为dTAG降解剂效能的指示,比例越低,目标降解程度越高。
所有测试的dTAG降解剂均以浓度依赖的方式引起了纳米荧光素酶发射量的下降(即HiBiT降解)。然而,不同的dTAG分子在HiBiT降解的程度上有所不同。dTAG-13(绿色曲线)引起约50%的降解和纳米荧光素酶发射量的减少,而dTAG-v1(蓝色曲线)则表现为最强的降解剂,几乎完全降解了HiBiT。
在第二个实验中,进一步评估了dTAG-v1降解剂的数据稳定性(见图3)。在此实验中,评估了1到10 µM浓度范围的dTAG-v1,并进行了32次重复实验,结果与DMSO对照组进行了比较。
如图 3 所示,与 DMSO 对照相比,所有三种浓度的 dTAG-v1 均导致 HiBiT 融合蛋白降解。信号与空白比值显示,纳米荧光蛋白化学发光信号随浓度降低而降低,而 Z 因子为 0.84 至 0.87,表明数据稳定性良好。
结论
使用 dTAG 蛋白质降解检测,测试的 dTAG 分子可成功用于诱导 HiBiT 融合蛋白质复合物的靶向降解。由于其高灵敏度、快速读取时间和缩小规模的兼容性,PHERAstar FSX 非常适合此应用,与 iSTAR 板一起使用,性能与类似的酶标仪相当。
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