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荧光偏振技术研究青霉素与PBP5相互作用,解析抗生素耐药分子机制

2025-09-09     来源:本站     点击次数:45

随着抗生素耐药问题日益严峻,深入研究其分子基础显得尤为重要。本研究聚焦于青霉素与青霉素结合蛋白(PBP5)的结合机制,采用荧光偏振技术,探索不同PBP5变异体的结合行为,揭示抗性差异的关键所在。

青霉素与β-内酰胺类抗生素的作用机制

苄青霉素最早发现于 20 世纪 20 年代,此后又有数千种新的青霉素衍生物被发现。青霉素属于β-内酰胺类抗生素²,该类抗生素是目前临床上最常用的一类。新的β-内酰胺类药物不断被开发出来,以扩展其对更多细菌种类的作用范围,或用于对抗耐药机制¹。

β-内酰胺类抗生素通过与细菌细胞壁中的青霉素结合蛋白(PBPs)结合并作用于其功能,从而发挥杀菌作用²。PBPs是一类在细菌细胞壁肽聚糖交联最后步骤中发挥关键作用的酶¹。β-内酰胺类药物通过抑制该交联过程,破坏细菌细胞壁的构建。

细菌细胞壁对于维持细胞结构、调控渗透压以及保护微生物具有重要作用。一旦这一过程被干扰,细菌将无法维持其结构完整性³。


PBP酶变异与抗药性的关系

每种细菌都有自己特定的 PBP 酶,每种菌株可能含有3至8种不同的PBP¹。对β-内酰胺类抗生素的耐药性正日益严重,其主要机制是由细菌产生的β-内酰胺酶介导。β-内酰胺酶可水解β-内酰胺环,使抗生素失活¹。因此,研究不同变异类型的PBPs,以了解其分子机制及其与β-内酰胺的结合行为至关重要。

肠球菌 (Enterococcus faecium )是一种可引发严重感染的细菌,且表现出高度的β-内酰胺耐药性。已有从临床分离出的、表现耐药性的PBP5变异体被鉴定⁴。有趣的是,这些突变并未改变PBP5的蛋白质结构²。本研究中,我们使用荧光偏振技术(fluorescence polarization, FP),测定青霉素与这些临床来源耐药性PBP5变异体的结合亲和力。


BOCILLIN FL 是一种荧光标记的青霉素衍生物(BODIPY标记的青霉素V)。如图1所示,当PBP5与BOCILLIN FL结合时,FP信号随时间增加,表明发生了结合事件。

图 1:BOCILLIN FL 荧光偏振动力学实验

野生型及变异型PBP5蛋白按照Hunashal等人²先前的方法,从分离的肠球菌(Enterococcus faecium)变异株中表达并纯化。

BOCILLIN FL购自Thermo Fisher Scientific,并从1 mM的DMSO储备液中新鲜配制,实验中最终使用浓度为30 nM。实验用的缓冲液为:100 mM磷酸钠(pH 7.0)、0.01% Triton X-100,并加入黑色384孔板(聚苯乙//烯,Corning)中,每孔加5 µL。

实验通过向每孔加入15 µL PBP5蛋白(最终浓度3.6 µM)开始,并用热封膜(ThermalSeal,EXCEL Scientific)封板。阴性对照孔中不加PBP5,仅含缓冲液。

随后,在 37°C 温度下使用 CLARIOstarPlus测量荧光偏振,滤光片设置为荧光素。闪烁 100 次,目标 mP 值为 10mP。总共收集了 100 个测量点,每轮循环时间为 40 秒。

与 BOCILLIN 的相互作用

图 2 显示了野生型 PBP5(WT,即 PBP5 T485)随着时间的推移与 BOCILLIN 的结合情况,通过 FP 值的增加(绿色曲线)可观察到。正如预期,催化不活跃的 PBP5 S422A 变体没有与 BOCILLIN 结合(蓝色曲线),因为 β-内酰胺类药物严格要求与活性位点丝氨酸结合。

其中一个临床上最具耐药性的PBP5变体T485A,其与BOCILLIN的结合速率显著降低(红色曲线),接近S422A的无结合状态。相比之下,耐药性最弱的PBP5变体T485M,则表现出较高的结合速率(橙色曲线)。
 

图 2:WT、S422A、T485A 和 T485M PBP5 变体随时间变化的 BOCILLIN 荧光偏振曲线。

结论

荧光偏振实验结果表明,β-内酰胺类抗生素通过PBP5活性位点中的S422残基特异性结合。不同的临床来源PBP5变体展示出显著不同的荧光偏振信号变化,与其临床耐药性水平密切相关。CLARIOstar Plus设备在监测这些变体结合行为差异方面表现出高度灵敏性,为结合动力学研究提供了强有力支持。该设备的温控功能确保了动力学实验中温度的稳定性和一致性。

References
  1. Bush, K., Bradford, P. β-Lactams and β-Lactamase Inhibitors: An Overview. Cold Spring Harb Perspect Med.(2016) Volume 6 (8)  www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK9957/#
  2. Hunashal, Y. et al. Molecular basis of β-lactam antibiotic resistance of ESKAPE bacterium E. faecium Penicillin Binding Protein. Nat. Commun. (2023) 14: 4268
  3. Yip, D., Gerriets, V., Penicillin. StatPearls Publishing. (2023)
  4. Rice L.B., Bellais S., Carias L. L., Hutton-Thomas R., Bonomo R. A., Caspers P., Page M. G. P., Gutmann L. Impact of specific pbp5 mutations on expression of
 
转载自:BMG LABTECH
 
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