文章标题：Integrating bioinformatics and experimental validation to reveal a novel VRK score as a prognostic and therapeutic biomarker in hepatocellular carcinoma
发表期刊：Frontiers in Immunology
合作客户：重庆医科大学附属第二医院龚建平、蔡东团队
维真助力：慢病毒
实验细胞：MHCC97H
病毒产品：Lv-shVRK2
研究背景
VRK家族基因在肿瘤的发生发展中起着多功能的作用，但VRK家族基因在肝细胞癌（HCC）中的作用还有待进一步研究，而且VRK相关模型的临床应用前景尚不明确。在本研究中作者系统地研究了VRK家族基因在HCC和不同亚组中的表达和预后，建立了一个新的预后标志VRK评分，并发现VRK评分是预测肝癌预后和疗效的可靠指标，VRK2是肝癌治疗的潜在靶点。

部分结果展示
1. VRK评分用于突变、TMB和药物敏感性分析
作者发现VRK家族基因在大多数肿瘤组织中呈高表达，且VRK家族基因在肝癌组织中的表达与TNM分期和TP53突变密切相关。然后作者基于单样本基因集富集分析（ssGSEA）算法建立了VRK评分，并发现VRK评分能用于HCC患者预后分析，是HCC患者对免疫检查点阻断反应的潜在预测因子。此外肿瘤突变负荷（TMB）反映了肿瘤的基因突变水平和预后，作者发现高TMB的患者具有较差的总体存活率，高TMB与高VRK评分的组合与HCC患者中最差的结果相关。作者还评估了VRK评分中免疫检查点抑制剂以外的其他治疗药物的敏感性，发现VRK评分低的患者更可能对索拉非尼、吉西他滨、紫杉醇和顺铂敏感。这些发现表明VRK评分可作为HCC患者全身治疗反应的稳健预测生物标志物。

2. VRK2基因敲低抑制肝癌细胞增殖和转移
由于VRK2在三个HCC肿瘤组织中高度表达，作者进一步研究了VRK2在HCC中的作用。使用siRNA敲低了VRK2表达，发现VRK2敲低抑制了MHCC97H和HCCLM3细胞的增殖、迁移和侵袭能力。蛋白质印迹结果证实VRK2敲低降低了AKT1和RPS6的磷酸化水平。这些结果表明VRK2敲低抑制了体外HCC增殖和转移，并降低了AKT1和RPS6的磷酸化水平。接下来，作者研究了VRK2敲低对体内HCC的影响。异种移植肿瘤模型证实VRK2敲低抑制体内肿瘤生长，伴随着肿瘤重量和体积的减少，Ki-67染色揭示VRK2敲低降低肿瘤增殖，这些发现表明VRK 2敲低在体外和体内抑制HCC进展。

实验结论
本研究系统地研究了VRK家族基因在HCC中的表达和预后，建立了一个新的预后标志VRK评分，并成功预测了HCC患者的药物治疗疗效，证实VRK2敲低在体外和体内抑制HCC增殖。表明VRK评分是预测肝癌预后和药物疗效的可靠指标，VRK2是肝癌治疗的潜在靶点。