利用DAVID进行GO/KEGG功能富集分析的详细操作步骤

之前在《一文了解GO/KEGG功能富集分析》里，我们已经聊过 GO 和 KEGG 的核心概念，还给大家推荐了 DAVID 这个实用工具～

今天就带大家一步步解锁 GO/KEGG 功能富集分析的详细操作，跟着步骤走，小白也能快速上手！

核心流程：提交基因列表 → 选定基因类型 → 确认并提交具体操作如下：

提交后等待几秒，若弹出提示「Please note that multiple species have been detected in your gene list.」，说明基因列表中检测到多个物种 —— 点击「确定」后，在「List」中选中目标物种（此处以「Homo sapiens」为例），再点击下方「Select Species」就能继续啦～

Step3：查看核心分析结果

操作完成后，就能看到完整分析结果页啦！红框里的折叠栏，分别对应 GO（包含 BP、CC、MF 三大类 —— 忘了它们的含义？可以回头看看《3 分钟了解 GO/KEGG 功能富集分析》补补课～）和 KEGG 的分析结果，一目了然～

Step4：提取关键结果并下载

做完分析，下一步就是提取目标结果、准备可视化啦！具体操作看这里：

结果页中，「Gene_Ontology (3 selected)」折叠栏下，蓝框标注的「GOTERM_BP_FAT」「GOTERM_CC_FAT」「GOTERM_MF_FAT」，就是我们需要的 GO 功能富集结果；
「Pathways (3 selected)」折叠栏里，蓝框的「KEGG_PATHWAY」就是 KEGG 的核心结果；
想查看每个类别（BP/CC/MF/KEGG）的详细数据？点击对应栏目后的「Chart」按钮（绿框所示）就行～

点击「Chart」后，会显示包含多列数据的详细结果表，核心关注这几列：

关键列：Term（GO/KEGG 功能术语）、P-Value（统计显著性）；
辅助列：Count（富集的基因数量）、%（富集基因占比）。

想下载结果？点击红框中的「Download File」，会弹出一个纯文本格式的结果页（看似杂乱但数据完整），直接下载或导入作图软件，就能进行后续分析啦～

Step5：结果导出与可视化

各位科研小伙伴看文献时，肯定见过不少功能富集分析的图吧？柱状图、高级气泡图是不是很常见？还有人在用 Excel、PPT 慢慢作图吗？

下面这种高颜值、高专业度的图，是不是正是你想要的？

乐备实是国内专注于提供高质量蛋白检测以及组学分析服务的实验服务专家，自2018年成立以来，乐备实不断寻求突破，公司的服务技术平台已扩展到单细胞测序、空间多组学、流式检测、超敏电化学发光、Luminex多因子检测、抗体芯片、PCR Array、ELISA、Elispot、PLA蛋白互作、多色免疫组化、DSP空间多组学等30多个，建立起了一套涵盖基因、蛋白、细胞以及组织水平实验的完整检测体系。