
图1. 浆B细胞抗体发现工作流程示意图。
2、硬核数据说话:高亲和力+强多样性,直击研发痛点
效率之外,抗体的质量与多样性是决定研发成败的关键。在针对巨噬细胞新型靶点的实战测试中,Hypercell与AbFinder的组合交出了出色答卷:
利用基于磁珠的CD138+试剂盒 (Stemcell) 从免疫小鼠脾脏中富集浆B细胞,从50万个浆B细胞中,成功筛选出1009种非冗余抗体序列,通过AbFinder分析,选取23个候选抗体进入验证阶段。最终17个抗体(结合率73.91%)确认具备抗原结合能力,且各抗体EC50均低于5nM,其中15个(占比88%)更是达到EC50<1nM的高亲和力水平。更令人惊喜的是,24%的候选抗体展现出出色的阻断功能,为后续药物开发奠定了坚实基础。

图2. Hypercell和AbFinder工作流程的关键数据。
同时,热图分析显示,筛选获得的IgG抗体涵盖90个VH家族和76个VL家族,克隆型多样性通过Levenshtein距离(LD) 来反映 (LD用于衡量克隆型之间的相似性,代表了将一个字符串转换为另一个字符串所需的插入、删除和替换操作的数量)。验证表现突出,完美保持了抗体的天然配对与高多样性,彻底解决了传统技术中 “高通量与高多样性不可兼得” 的痛点。

图3. 热图展示了1009个分选得到的抗体的多样性。左侧图展示了V基因家族的多样性,右侧图展示了克隆型的多样性。该图只展示了克隆型大于2的情况。
最后,从17个已确认的结合抗体中,我们确认有15个抗体具有EC50<1nM的亲和力,100%的EC50<5nM。阻断实验表明其中4个候选抗体具有很好的阻断效果。

图4. AbFinder在保持抗体高多样性的同时帮助用户缩小待测试验证的样本数量。
3、端到端解决方案,赋能创新抗体研发全场景
Hypercell的浆B细胞工作流程结合AbFinder软件为抗体发现提供了整体解决方案,可有效获取高亲和力候选抗体,从而明显节约时间和成本。上海曼博生物作为涛烜科学官方提供商,将这套抗体发现全流程解决方案正式推向市场。如果你正为新型抗体筛选而困扰,渴望突破效率与质量的双重瓶颈,欢迎点击上海曼博生物解锁抗体研发新的可能!