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PipeJet 微量分液助力 PhagoScreener 噬菌体筛选技术研发

2026-06-07     来源:微信公众号     点击次数:79

在抗生素过度使用的当下,多重耐药病原菌数量不断攀升,严重威胁人类健康。噬菌体疗法用于细菌耐药性检测,具有高度特异性,成为极具潜力的治疗选择。然而,传统的噬菌体筛选方法,如在双层琼脂平板上进行细菌培养和噬菌体添加以引发细菌裂解,不仅操作繁琐、工作量大,而且难以实现并行化和自动化,严重限制了筛选效率。在此背景下,开发一种高效、快速且能实现高通量筛选的方法至关重要,这不仅能加速噬菌体疗法的临床应用,还可能为耐药菌感染的治疗带来新的突破。


本次介绍的文章是《PhagoScreener: A novel phagogram platform based on a capillary-wave microbioreactor》,来自德国布伦瑞克工业大学生物化学工程研究所的研究团队,于2024年发表在《New BIOTECHNOLOGY》杂志。该团队建立了一套新的基于毛细管波微生物反应器(capillary-wave microbioreactor ,cwMBR)的噬菌体筛选技术,有望加速噬菌体研究的临床应用。

实验步骤

01菌株与噬菌体准备
大肠杆菌K12 MG1655在复合培养基中摇瓶过夜培养作为预培养物。噬菌体MM02和EASG3分别用噬菌体缓冲液复苏后进行直接的噬斑测定,以确定噬菌体滴度,并制备初级、次级裂解液备用。

02cwMBR平台搭建
cwMBR芯片由飞秒激光直接结合选择性湿法蚀刻光敏玻璃制成,继而置于 3D打印的平台支架中。支架由方形聚氯乙烯板和电子激励器组成。将整体平台放入连接恒温器和超声波加湿器的培养箱内,通过垂直振荡混合液滴以产生特定波型的毛细管波,以微涡流的形式引起对流,通过相关软件、声卡和放大器驱动,蓝色LED用作吸光度测量的光源。

图 1. cwMBR 平台:3D打印的cwMBR支架、cwMBR芯片及其他组件,支架底座最多可包含9个入口,每个入口容纳1个cwMBR 芯片。入口将cwMBR和光纤固定在适当的位置,以便传感器读取;盖子和湿润的海绵可维持环境湿润;蓝色LED用作吸光度测量的光源。

03样品处理
使用德国Biofluidix公司开发的可集成PipeJet压电式纳升级微量分液模块进行移液/分液,来评估吸光度传感器系统对微生物培养液浓度测量的可靠性。先向cwMBR芯片中移液3.5 μL氯化钠溶液,再以500nL的增量逐步添加浓缩的大肠杆菌培养物(OD≈16)直至总体积达7μL,测定每步添加后的电路电压,建立电压与细胞浓度的关系。

04噬菌体筛选
分别在cwMBR和96孔板中培养大肠杆菌并对比,同时进行噬菌体筛选实验。将预培养的大肠杆菌稀释后,7μL用PipeJet纳升级微量分液喷头/喷液阀加至cwMBR中,100μL加入96孔板。cwMBR培养时控制温度、湿度和振荡条件,96孔板在酶标仪中培养,设置振荡和不振荡组,定期测量吸光度和细胞计数。噬菌体筛选实验中,大肠杆菌培养至特定光密度后添加不同浓度的噬菌体,设置生长对照,同步培养并测量。

05统计分析
所有实验设置三个重复,采用单因素方差分析判断不同噬菌体、噬菌体感染复数(MOI)或培养系统对最终细胞数量的影响。
 
实验结论
生物传感器芯片性能良好:开发的基于光电阻的吸光度电化学传感器系统成本效益高、可高度并行化,测量结果与细胞浓度在一定范围内呈良好线性关系(R²=95.0%),适用于噬菌体筛选及其他细胞相关应用(图2)。

 图 2 . 基于Arduino的吸光度传感器系统在不同光密度(λ=600nm,范围为0至 8.32)和细胞数量(范围为 0 至 4.23×10⁹ mL⁻¹)下相对于OD=0的电压变化此图展示了毛细管波微生物反应器(cwMBR)芯片中的数据情况。
 
cwMBR培养优势显著:cwMBR与振荡的96孔板培养效果相似且优于非振荡的96孔板。cwMBR中大肠杆菌生长良好,细胞密度和生长速率较高。其亲水性玻璃可减少噬菌体吸附,且芯片可重复使用,具有高度并行化和自动化特点。
 
适用于不同噬菌体筛选:cwMBR适用于不同噬菌体如MM02和 EASG3的筛选,可区分其裂解动力学差异,同时及时在线裂解测量可加速噬菌体筛选过程,未来有望用于高通量筛选和个性化医疗。
 
综上所述,cwMBR为噬菌体筛选提供了一种经济、高效的替代方案。结合德国BioFluidix公司的微量/超微量PipeJet压电式纳升级分液系统,cwMBR的并行化能力有效提升,可快速筛选大量噬菌体库以及噬菌体 - 噬菌体、噬菌体-抗生素组合,为个性化医疗中的噬菌体疗法乃至其他应用(如抗生素敏感性测试)提供有力支持。
 
更多信息请参考原文:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1871678424005363
Biofluidix成立于2005年,位于德国,技术源自德国弗莱堡大学微量系统工程学院。
 
* 专注非接触式的精准纳升和皮升的超微量点样和分液;
* 点样喷头可第三方自动化整合; 
* 提供微量分液、芯片点样设备与定制化服务
 
 
用于微孔板微量移液、微流控快检芯片、生物传感器芯片、电化学芯片、光电芯片以及微阵列生物芯片,包括:核酸芯片,基因芯片,蛋白芯片,多肽芯片、多糖芯片、小分子化合物芯片、细胞芯片。
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