DNA Marker(DNA标记物)是一种用于核酸电泳的分子量标准工具,通过已知长度的DNA片段帮助研究人员估计样品DNA的大小、浓度及电泳迁移特性。以下是其核心信息:
一、定义与作用
- 基本定义
DNA Marker由特定分子量的双链DNA片段组成(如100bp、500bp、1kb等),混合含染料的上样缓冲液,用于电泳中作为分子量参照。
- 广义:包括可遗传的DNA序列或蛋白质标记。
- 狭义:特指反映基因组差异的特异性DNA片段。
- 核心作用
- 分子量估算:通过对比Marker条带与样品条带的位置,粗略判断目标DNA的大小。
- 浓度检测:利用Marker中高浓度条带(如750bp)的亮度,辅助估算样品浓度。
- 电泳条件优化:根据目标片段大小选择凝胶浓度(如大片段用低浓度琼脂糖,小片段用高浓度)。
二、类型与规格
- 常见类型
- 预染Marker:含RedView、SYBR Green等染料,可直接电泳观察。
- 非预染Marker:需后续染色,灵敏度更高。
- 梯度Marker:覆盖广泛分子量范围(如1000bp、2000bp),适合多目标分析。
- 规格示例
- 1000bp:含50bp、100bp至1000bp的条带,适用于常规PCR产物分析。
- 12000bp:覆盖12000bp以上大分子DNA,用于质粒完整性检测。
三、选择标准
- 目标片段匹配
- 选择Marker中与目标片段大小相邻的密集条带,以提高估算精度。
- 例如:检测500bp片段时,优先选择含400bp、600bp条带的Marker。
- 凝胶浓度适配
- 大片段(>1kb):使用0.8%-1.0%琼脂糖+1xTAE缓冲液。
- 小片段(<500bp):使用1.5%-2.0%琼脂糖+0.5xTBE缓冲液。
- 染料类型
- RedView:低毒性,可直接紫外观察,适合常规实验。
- SYBR Green I:灵敏度高,但稳定性较差,需避免长时间电泳。
四、应用场景
- 分子生物学实验
- PCR产物分析、质粒构建验证。
- 基因组DNA提取质量检测。
- 医学与临床检测
- 病原体核酸检测(如新冠病毒)中评估扩增效率。
- 遗传病筛查中检测基因突变。
- 工业与科研
- 基因组作图、物种亲缘关系分析。
- 肿瘤标志物检测中的基因表达分析。
五、使用注意事项
- 保存条件
- 常规Marker(含Loading Buffer):室温可稳定3个月,长期保存需-20℃。
- 预染Marker:避免反复冻融,建议分装后使用。
- 常见问题解决
- 条带模糊:检查DNA降解或电泳电压过高。
- 迁移异常:确认样品是否含高盐或蛋白污染,调整电泳条件。
- Marker丢失:缩短电泳时间(如溴酚蓝迁移至凝胶2/3处停止)。
六、市场代表产品
- 达原辰光DNA Marker:覆盖50bp-12000bp,条带清晰,适合各种应用。
- 诺唯赞DL2000:覆盖100bp-2000bp,适合常规PCR