小角度X射线散射(SAXS)
SAXS是指当X射线透过样品时,在靠近原光束2°~5°的小角度范围内发生的散射现象。X射线穿过样品时,在不均一材料电子密度起伏的作用下,会发生散射并形成特定的散射图案,根据所得图案可反推样品微观结构。在进行mRNA-LNP表征时,SAXS常与Cryo-EM结合使用,正如图3所示,结合SAXS检测所得曲线与Cryo-EM拍摄所得图像,即可帮助研究者推断/验证诸多信息,如LNP的多层状结构,各种脂质的排布,纯化前后脂质排布的变化及不同脂质浓度、不同NP比对脂质排布的影响。
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图3.LNP的SAXS表征
多激光圆柱照明共聚焦光谱(CICS)
此方法旨在从单粒子水平上定量解析LNP的有效载荷,通过对LNP不同组分荧光标签的一致性分析和单mRNA荧光的定量解析(图4),区分未封装的mRNA、空载的LNPs和负载mRNA的LNPs。以DLin-MC3基准配方来讲,不同条件下,LNP自组装的空载率为40%~80%,非空载的LNP大多含有2~3个mRNA分子。CICS为揭示LNP动力学控制提供了观测条件,也为mRNA-LNP构效关系的研究给予了新的帮助。
图4. LNP的CICS表征
单粒子分析器(SPP)
SPP采用市售共聚焦显微镜,基于溶液中数千个扩散粒子的荧光波动进行分析(图5a)。简而言之,荧光标记的粒子在衍射受限的观察体中扩散,其发射的荧光在多通道中被连续检测,使用自定义的免费Python脚本可识别多通道的荧光强度波动(图5b),基于多通道中每个单峰的强度,可以构建信号密度图(图5c)和每个通道的直方图(图5d)。
在包封分析中,SPP通过测量mRNA和脂质染料的共现信号(图5f),可以对单个LNP中mRNA的含量进行定量分析,以得到完整LNP的占比(图5g),以及单个LNP的mRNA包封量(图5h)。
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图5.LNP的SPP表征
创建自组装动力学,完善表征手段是揭示mRNA-LNP构效关系的必要方式,文中提到的表征方法,对mRNA-LNP的研究起到了很大的帮助作用,相信随着科技的发展和相关理论的完善,此领域的研究将会取得更大的进展。