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如何精准定量核酸浓度

2025-03-21     来源:本站     点击次数:417

一、紫外分光光度法(Nanodrop
原理:核酸的碱基(嘌呤、嘧啶)在260 nm波长处有最大紫外吸收峰,通过吸光值(A260)结合摩尔吸光系数计算浓度。DNA的换算系数为50 μg/mL,RNA为40 μg/mL。
特点
  • 操作简便,1分钟内完成检测。
  • 无法区分DNA/RNA、降解核酸及杂质,需结合A260/A280(>1.8为DNA纯品,>2.0为RNA纯品)评估纯度。
  • 灵敏度较低(≥2 ng/μL),易受游离核苷酸干扰。
二、荧光染料法(如达远辰光荧光计)
原理:特异性荧光染料(与目标核酸结合后发出荧光,通过荧光强度定量。例如,达远辰光荧光计搭配赛默飞Qubit dsDNA HS染料检测范围为0.2–100 ng/μL。
特点
  • 灵敏度高(pg级),特异性强,可区分DNA/RNA。
  • 耗材成本相较于紫外分光法较高。
  • 适用于低浓度/珍贵样本(如NGS文库)。
三、实时荧光定量PCRqPCR
原理:通过荧光染料或探针实时监测PCR扩增过程,Ct值与起始模板浓度呈线性关系,结合标准曲线定量。
特点
  • 特异性高,依赖引物/探针设计,可检测拷贝数。
  • 操作复杂,耗时较长,需标准品确保扩增效率一致。
  • 适用于基因表达分析、病原体检测等。
四、传统化学法
  1. 定磷法
    • 原理:核酸中的磷在酸性条件下与钼酸铵反应生成钼蓝,在650 nm处测吸光值,换算浓度。DNA/RNA含磷量分别为9.2%和9.5%。
    • 特点:灵敏度较高(1–10 μg),但易受蛋白质干扰。
  2. 定糖法
    • 原理:核酸戊糖经酸解生成醛类,与成色剂(如苔黑酚)反应显色,670 nm或595 nm测吸光值。
    • 特点:操作简单,但特异性差,仅适用于粗略估算。
五、其他方法
  1. 毛细管电泳法
    • 原理:基于荧光染料结合核酸,通过迁移时间和峰面积定量,可评估核酸完整性(如RNA降解程度)。
    • 特点:灵敏度高(25 ng/μL),但单样成本较高。
  2. 数字PCRdPCR
    • 原理:将样本分割成微滴独立扩增,统计阳性微滴数实现绝对定量,不受扩增效率影响。
    • 特点:适用于稀有突变检测、病毒载量测定等。
选型建议
  • 常规检测:优先选择紫外分光光度法​(快速便捷)或Qubit荧光法​(高灵敏度)。
  • 复杂样本:如NGS文库,推荐毛细管电泳数字PCR
绝对定量需求:使用qPCR数字PCR
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