多细胞生物的生命活动依靠线粒体进行供能。除合成三磷酸腺苷(ATP)外,线粒体还参与信号传导、氧化还原稳态维持以及细胞程序性死亡等数十种细胞生理过程。已有大量研究证实,不同组织甚至同一细胞内部的线粒体均存在显著差异。例如小鼠的肝脏线粒体富集次生代谢与外源物解毒相关通路,而脑组织线粒体主要参与蛋白分选、三羧酸(TCA)循环及线粒体分裂过程。
植物典型的源组织叶肉,执行光合作用和光能转化。日间叶肉细胞的线粒体消耗过剩的NADPH、参与光呼吸辅助叶绿体代谢;夜间,成为ATP的主要供给场所。而植物叶片表皮的保卫细胞,依靠 ATP 驱动质子泵维持并快速调整膨压,控制叶片二氧化碳摄入与水分散失。尽管两种细胞位置相邻、协同供给植株碳素,但日间代谢分工截然不同。二者线粒体功能分化的分子机制尚不清楚,现有细胞特异性线粒体分离技术多依赖流式分选、组织预分离等技术,操作繁琐、回收率低,目前缺少简便通用、可实现单细胞线粒体固定观测的富集手段,亟需开发新型分离工具。
文章题目为“Mitochondrial Cell-Type-Specific Profiling: Differential Function of Mesophyll and Guard Cells is Reflected by Their Mitochondrial Proteome”于2025年9月发表在Physiologia Plantarum杂志,作者来自于德国不莱梅大学生物分子相互作用中心。
本研究利用细胞特异性线粒体快速分离技术(mRACE) 分别从拟南芥根培养物、幼苗、整叶以及叶肉、保卫细胞中分离线粒体并开展蛋白组研究。结果证实,叶肉与保卫细胞线粒体在代谢、翻译调控、RNA 编辑等多个层面存在分子组成差异;选取关键基因进行体内启动子报告实验,结果与蛋白组数据相互印证,证明 mRACE 是发掘不同细胞线粒体差异组分的可靠技术。
研究方法
01 样本
拟南芥Col-0野生型,分别培育整株幼苗、离体根培养物以及成熟叶片。
02 mRACE 技术(细胞特异性线粒体快速分离技术)
构建双转基因系统:MTF融合蛋白(线粒体外膜OM64靶向序列+ GFP+生物素标记位点BLRP)与BirA生物素连接酶共表达,BirA 可对 MTF 的 BLRP 位点生物素修饰,依靠生物素 - 链霉亲和素互作捕获标记线粒体。mRACE分三种分离方案:分别是磁珠富集、PolyAn链霉亲和素修饰玻片固定以及分级过滤结合玻片固定。
1) 磁珠法:冰上KPBS缓冲液匀浆→粗过滤→两步差速离心富集线粒体沉淀→链霉亲和素磁珠孵育结合→多梯度体积缓冲液磁珠洗涤,SDT 缓冲液煮沸洗脱蛋白;
2) PolyAn链霉亲和素修饰玻片固定:幼苗匀浆过滤离心获取线粒体悬液→滴加至PolyAn链霉亲和素玻片4℃孵育结合→KPBS多次摇洗去除游离杂质→玻片直接上机荧光成像;
3) 两级滤网快速过滤法:30μm+5μm滤网分级过滤裂解液,差速梯度离心后线粒体离心固载于普通盖玻片,用于活性测定。
PolyAn链霉亲和素玻片特异性固定纯化线粒体:玻片表面共价交联链霉亲和素后,仅生物素修饰的MTF标记线粒体可特异性结合,未标记细胞器、细胞碎片、杂蛋白可被洗涤去除,实现单一细胞来源线粒体得原位富集。
03 单细胞 / 单线粒体原位观测平台
线粒体固定在链霉亲和素玻片表面,无需洗脱收集,可直接置于倒置荧光显微镜下原位成像,实现单线粒体形态、荧光定位观察(图1H)。
04 活体生理活性检测
在链霉亲和素玻片上直接添加呼吸底物(琥珀酸、ATP)与抑制剂(鱼藤酮),依托cpYFP荧光探针原位测定单个线粒体呼吸与 pH 动态变化,验证分离线粒体d的生理完整性。
区别于磁珠悬浮富集,PolyAn链霉亲和素玻片固定便于多轮洗涤,杂质去除效率更高,适配微量样本(如:幼苗少量组织来源线粒体)的分离与后续显微功能分析。
图1 利用mRACE技术分离与分析特定细胞、组织来源的线粒体
(A) 依托嵌合蛋白MTF实现功能:MTF由OM64线粒体靶向序列、绿色荧光蛋白GFP与生物素受体位点构成;在生物素连接酶BirA存在条件下,该受体位点可被生物素标记。
(B~E) mRACE标记线粒体可跨不同界生物适用。分别在拟南芥 (B)、人胚肾细胞系 (C)、大鼠胰岛β细胞系INS‑1E (D,DAPI 染细胞核,图示5个细胞中仅1个过表达 MTF,TOM20蛋白在全部细胞稳定表达)、秀丽隐杆线虫 (E) 中过表达MTF,通过GFP 与线粒体探针MitoTracker Red CMXRos或线粒体外膜标记蛋白TOM20共染,证实MTF定位于线粒体。
(F) F1:利用磁珠结合+磁力吸附捕获生物素标记线粒体;F2:使用链霉亲和素修饰玻片,依靠亲和作用固定标记线粒体;F3:先后经30μm、5μm两级滤器快速分选荧光标记线粒体,再通过离心将线粒体固载于玻片。
(G) 采用F1方案,从携带p35S::MTF、p35S::BirA的拟南芥根中分离磁珠结合型线粒体;左:明场、中:荧光场、右:叠加图。
(H) F2方案下固载在链霉亲和素玻片上的生物素化线粒体富集效果:左为双基因表达实验组,右为仅含p35S::MTF的空白对照。
(I) F3 分级过滤获得MTF标记线粒体,经离心固定在玻片上的富集结果。
(J) F3 制备并固载于玻片的单个cpYFP标记线粒体活性检测。左图:分别用10mM琥珀酸+0.25mM ATP+20μM 鱼藤酮激活处理 (绿色)、基础培养液空白处理 (米色) 后,单个线粒体荧光强度定量;右图:6个线粒体经两种处理后的cpYFP荧光动态曲线。
标尺:B/C/E=2μm;D=10μm;G=1μm;H/I=10μm;J=0.2μm
研究结论
mRACE 通用性优异:MTF 可在植物、哺乳动物、线虫等真核生物中精准标记线粒体外膜;经磁珠或PolyAn 链霉亲和素修饰玻片富集的线粒体结构完整、具备呼吸生理活性,分级过滤方案可 10 min 快速富集线粒体。
mRACE 高效富集微量特异细胞线粒体:保卫细胞数量远低于叶肉细胞,仍能富集其高纯度的线粒体蛋白;根、幼苗、叶片线粒体蛋白组既有共有蛋白,也存在组织特有功能蛋白。
该研究开发的mRACE全新细胞特异性线粒体分离技术,以及PolyAn链霉亲和素玻片填补了单线粒体原位分离观测的技术空白,弥补传统线粒体批量提取无法区分细胞来源的缺陷,可广泛用于动植物、线虫等多模式生物线粒体异质性研究。同时,mRACE为作物抗逆、光合改良相关线粒体功能研究提供工具;线粒体细胞特异性编辑与代谢数据,为解析植物气孔发育、高光效育种、逆境能量调控提供新靶点。
原文链接:https://doi.org/10.1111/ppl.70579
德国PolyAn是一家纳米科技公司,专注于采用表面分子工程(Molecular Surface Engineering,MSE)进行表面修饰,包括修饰载玻片与修饰微孔板。
如:环氧基载玻片、氨基载玻片、醛基载玻片、马来酰亚胺基载玻片、N - 羟基琥珀酰亚胺基载玻片、羧基载玻片、苯基二异硫氰酸酯基载玻片、叠氮基载玻片、巯基载玻片、链霉亲和素修饰载玻片、中性亲和素修饰载玻片,用于生物样品分子固定以及ELISA实验。
PolyAn也提供单分散PMMA(poly methyl methacrylate)荧光微球(微珠),可用于多重微球分析,流式细胞仪校准和荧光成像系统校准。
环亚生物科技(APG BIO)作为德国PolyAn公司中国区代理,为客户提供各种表面修饰的载玻片、盖玻片、微孔板以及荧光微球。