AAV血清型多种多样，不同血清型转染的组织类型、细胞类型和感染效率各不相同。其中，多种AAV血清型可不同程度地诱导目的基因在肺部的表达，比如AAV2、AAV5、AAV6及AAV9等。其中，AAV6由于可以有效地介导基因在气道和肺泡II型细胞的表达，而气道和肺泡II型细胞通常是肺部疾病基因治疗的靶细胞群体，因此被认为是用于肺部基因转移的一种理想AAV血清型。
下图所列为AAV2、AAV5、AAV6及AAV9四种血清型对肺部的感染情况：

研究表明，针对肺部感染rAAV在血清型上的选择根据动物模型的不同而存在差异，主要体现在小鼠及较低等灵长类动物与高等灵长类动物之间。在小鼠及一些较低等的灵长类动物中，AAV5及AAV6是感染肺部的理想选择；针对高等灵长类动物，AAV1对肺部的感染效率更高；在肺癌的研究中，我们通常推荐AAV2血清型。
种类AAV血清型推荐小鼠与低等灵长类动物肺部AAV5/AAV6高等灵长类动物肺部AAV1肺癌AAV2
2020年牛津大学Helena Meyer-Berg等研究者通过建立肺芽样器官( lung bud organoids，LBOs)模型——一种由人胚胎干细胞(hESCs)生成的人肺实质模型，用于筛选病毒载体转导，进而确定适合于人肺实质转导的血清型。研究证实在所用的八种AAV血清型中，rAAV2和rAAV6以及rAAV6变体（rAAV6.2和rAAV6.2FF），对人肺实质亲和性较强。