方案摘要:猪繁殖与呼吸综合征,是由病毒(PRRSV)感染猪引起的一种高度传染性疫病,临床表现为母猪繁殖系统障碍,断奶仔猪消瘦、生长迟缓以及死亡率增加。该病能引起猪体温升高、呼吸困难,导致猪耳朵发绀,又称蓝耳病,为提升猪蓝耳病毒 实时RT-PCR 检测效率与准确性,Pipetty 电动移液器凭借核心优势适配全流程需求,配合温度补偿,可减少手部温度导致的移液波动,保障试剂添加精准,降低假阴性风险,为猪蓝耳病防控提供可靠支撑。
方案详情:
一、实验原理
实时RT-PCR 检测猪蓝耳病(PRRS),核心是针对猪蓝耳病病毒(PRRSV,RNA 病毒)的实时 RT-PCR 技术:先通过逆转录将病毒 RNA 转为可扩增的 cDNA,再经 PCR 循环(变性、退火、延伸)使病毒靶序列指数级增长;过程中利用荧光物质(如 TaqMan 探针)实时监测,荧光信号随靶序列增加同步增强;最终以荧光达阈值的循环数(Ct 值)判断 —Ct 值越小病毒量越高,结合阴 / 阳性对照,实现对病毒的特异定量检测。
二、
实验准备
1、设配和材料
① Pipetty电动移液器MSIC01-03-250、MSIC01-02-1000及配套吸头;
② 荧光PCR 仪;
③ 高速台式冷冻离心机(4 ℃,离心速度 12 000 r/min 以上);
④ 混匀器;
⑤ 冰箱(2℃~8 ℃、-20 ℃和-70 ℃);
2、试剂和材料
① 商品化的 RNA 提取裂解液;
② 三氯甲烷;
③ 异丙醇(-20 ℃预冷);
④ DEPC 水;
⑤ 75%乙醇;
⑥ dNTPS(含 dATP、dTTP、dCTP、dGTP,各 10 mmol/L);
⑦ RT-PCR 反转录系统:AMV或 M-MLV反转录酶、Taq酶;
⑧ PRRSV-1 实时 RT-PCR 引物与探针序列
引物与探针序列根据 GenBank 中欧洲株 ORF6/ORF7 保守区域序列设计,引物的序列为:
上游引物 P1:5'-CAGATGCAGAYTGTGTTGCCT-3';
下游引物 P2:5'-TGGAGDCCTGCAGCACTTTC-3';
探针序列 P3:5'-(FAM)ATACATTCTGGCCCCTGCCCAYCACGT(TAMRA)-3';
⑨ PRRSV-2 实时 RT-PCR 引物与探针序列
引物与探针序列根据 GenBank 内美洲株 ORF7/3'UTR 保守区域序列设计,引物的序列为:
上游引物 P1:5'-GCACTGATTGACAYTGTGCC-3';
下游引物 P2:5'-CGCATGGTTCTCGCCAAT-3';
探针序列 P3:5'-(FAM)AGTCACCTATTCAATTAGGGCGACCG(TAMRA)-3'。
三、实验步骤
1、样本总 RNA 的提取
a) 取灭菌的 1.5 mL离心管,基于样本数量进行编号。每管加入 600 μL 细胞裂解液,使用Pipetty电动移液器,设置连续分液功能,然后分别加入被检样本、阴性对照、阳性对照、空白对照(无核酸酶水)各 200μL,每加完一个试剂换用一个吸头,再各加入 200 μL 三氯甲烷,在混匀器上振荡混匀5 s。于4 ℃经 12 000 r/min 离心 15 min。
b) 取相同数量灭菌的 1.5 mL离心管,加入 500μL异丙醇。吸取各管中的上清液(至少 500 μL)转移至相应的管中,并颠倒混匀。
c) 于4 ℃经 12 000 r/min 离心 15 min,小心倒去上清液,倒置于吸水纸上吸干液体,然后加入600 μL 75%乙醇进行洗涤。
d) 于4 ℃、12 000 r/min 离心 10 min,小心倒去上清液,倒置于吸水纸上吸干液体。
e) 64 000 r/min 离心 10 s,将管壁上的残余液体甩至管底部,用微量移液器吸干液体,室温干燥3 min。
f) 使用Pipetty连续分液模式,加入 11 μL DEPC水,混匀模式,自动混匀,以溶解管壁上的 RNA,2 000 r/min 离心5s,置于冰上备用。提取的 RNA 应在 2h内进行 RT-PCR 扩增,否则应置于-70 ℃冰箱保存。
2、分别使用引物和探针,检测 PRRSV-1 和 PRRSV-2。实时 RT-PCR 反应体系见表 3。设置混匀模式,将各种试剂充分混匀,2 000 r/min 离心 2 min。将 15 μL 实时 RT-PCR 反应混合液加入 PCR 反应管,然后加入 10 μL样本 RNA 模板,密封反应管,500 r/min 离心30s。将所有检测样本的PCR 管放入荧光 PCR 仪中。每次进行实时 RT-PCR 检测均应设阳性对照、阴性对照及空白对照。
3、反转录,42 ℃(AMV)或 50 ℃(M-MLV)30 min;预变性,92 ℃ 3 min;预扩增,92 ℃ 变性 10 s,45 ℃ 退火 30 s,72 ℃ 延伸 1 min,5 个循环;扩增,92 ℃变性 10 s,60 ℃ 退火延伸 30 s,40 个循环。在扩增阶段每次循环的 60 ℃ 退火延伸时收集荧光信号。
四、结果判定
1、试验成立条件:阳性对照的 Ct 值应<28 且出现特异性扩增曲线,阴性对照应无 Ct 值或Ct 值≥40 且无特异性扩增曲线,试验结果有效,否则,应重新进行试验。
2、被检样本 Ct 值≤30 且出现特异性扩增曲线,判为阳性;当无 Ct 值或 Ct值≥40,判为阴性;当30