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Pipetty电动移液器在猪水疱病RT-PCR实验中的应用
2026-03-20 来源:广州程淇生物 点击次数:18
方案摘要:
本方案旨在明确Pipetty电动移液器在猪水疱病(SVD)RT-PCR检测实验中的具体应用,规范实验操作流程,包括核酸提取、RT-PCR反应体系配制、扩增产物检测等关键步骤。相较于传统手动移液器,Pipetty电动移液器具备突出的连续分液优势,可实现单次吸液、多次精准分液,有效避免手动反复吸液导致的体积误差,同时降低长时间操作带来的手部疲劳,大幅提升移液效率;其精准的体积控制的能力,能有效规避手动移液器因人为按压力度不均、操作手法差异造成的移液偏差,进一步提高实验重复性和检测准确性,为猪水疱病的快速、精准诊断提供标准化操作依据。
方案详情:
一、实验原理
猪水疱病(SVD)是由猪水疱病病毒(SVDV)引起的一种急性、接触性传染病,其核酸为单股正链RNA。本实验采用RT-PCR(逆转录-聚合酶链反应)技术,首先通过逆转录酶将SVDV的RNA逆转录为cDNA,再以cDNA为模板,利用特异性引物扩增SVDV的特异性基因片段(目标片段大小154bp)。
二、
实验准备
1、设配和材料
① Pipetty电动移液器MSIC01-03-20、MSIC01-03-250、MSIC01-03-1000;
② PCR仪;
③ 台式高速冷冻离心机;
④ 稳压稳流电泳仪;
⑤ 水平电泳槽;
⑥ 凝胶成像仪(或紫外透射仪);
⑦ 核酸提取仪;
⑧ 无核酸酶的离心管与吸头;
⑨ PCR扩增管;
⑩ 1.5mL离心管。
2、试剂和材料
① 引物:上游引物为 5-TTCAGAATGATTGCATATGGGG-3',
下游引物为5'-TCACGTTT-GTCCAGGTTACY-3';
② 核酸提取试剂;
③ 酚-氯仿法试剂;
④ 无核酸酶水;
⑤ RT-PCR反应试剂:一步法RT-PCR反应缓冲液、RT-PCR 酶混合液(含反转录酶、Tag酶和RNase抑制剂等);
⑥ 电泳缓冲液;
⑦ 琼脂糖;
⑧ 电泳加样缓冲液;
⑨ DNA分子质量标准。
三、实验步骤
1、选用酚-氯仿法、RNA提取试剂盒、自动化核酸提取仪等方式进行核酸提取。采用酚-氯仿法提取核酸按下列步骤:
a)用Pipetty电动移液器取待检样本、阴性对照、阳性对照各300μL,分别置于1.5mL无核酸酶离心管中,每管加入300μL变性液异硫氰酸胍或Trizol试剂,反复轻轻混匀,冰浴5min;
b)每管加入60μL 2mol/L乙酸钠(pH4.0),轻轻混匀;
C)每管加入800μL苯酚-三氯甲烷-异戊醇混合液,轻轻颠倒混匀,冰浴5min;
D)8000r/min离心10min,将上清液转入另一洁净离心管;
e)加800μL异丙醇,混匀,室温放置15min;
f) 4℃,12000 r/min,离心10 min,倒掉上清液,尽量倒干液体,留下RNA沉淀;
g)加1000μL75%(体积分数)乙醇颠倒洗涤沉淀,4℃,10 000r/min,离心5min。倒干液体,室温干燥5 min~10 min;
h)使用Pipetty连续分液模式,每管加10μL无核酸酶水,用于溶解RNA。总RNA提取液可立即用于RT-PCR扩增,也可置于-70℃冰箱储存备用。
2、为每个样品准备RT-PCR混合物,推荐为待检的批量样品整批准备扩增预混合体系为宜,并按照样本数n+2+1准备反应体系。
3、RT-PCR检测扩增预混合体系为:
---------12.5μL 2×一步法RT-PCR反应缓冲液;
---------1μL RT-PCR 酶混合液;
---------0.5μL上游引物10μmol/L;
---------0.5μL下游引物10μmol/L;
---------6.5μL无核酸酶水。
在已分装有RT-PCR预混合体系的PCR扩增管中,分别加入4μL已提取的总RNA,盖紧管盖,振荡混匀后,瞬时离心。
4、将PCR扩增管放入PCR仪中,按照设定程序进行RT-PCR扩增:50 ℃ 30 min;95 ℃5 min;然后94℃ 20 s,60℃ 20 s,72℃ 20 s,共40个循环;最后72℃ 10 min。反应结束后,扩增产物置于4℃保存。
5、扩增产物电泳检测:制备2%琼脂糖凝胶,对RT-PCR扩增产物进行电泳,同时加DNA分子质量标准。电压80 V~100 V或电流40mA~50mA,电泳20min~30min。电泳结束后,将琼脂糖凝胶置于凝胶成像仪(或紫外透射仪)观察。
6、试验成立条件:阳性对照应出现154bp大小的特异性扩增条带,阴性对照无扩增条带。
四、结果判定
符合实验成立条件,待检样品扩增出特异性条带,且与阳性对照条带分子质量大小相符,则该待检样品判定为SVDV核酸阳性。待检样品无扩增条带,判为SVDV核酸阴性。在需要时,可取RT-PCR扩增产物进行序列测定,测序结果与SVDV特异性片段序列进行比对。
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