方案摘要:牛传染性胸膜肺炎(Contagious Bovine Pleuropneumonia,CBPP)是由丝状支原体丝状亚种(Mycoplasma mycoides subsp.Mycoides,Mmm)引起的一种牛属动物传染病,又称牛肺疫。以肺小叶间淋巴管浆液-渗出性纤维素性炎和浆液纤维素性胸膜炎为特征。健康牛与感染牛直接接触后吸入感染牛的“飞沫”是本病的主要传染途径,其中感染牛的“飞沫”是传播媒介,本病也可通过感染牛的精液和胚胎造成垂直传播。本方案使用了日本进口产品,Pipetty电动移液器,利用其体积小,精度高的优势,有效减少使用者的手部疲劳的同时大幅度提升了检测效率。
方案详情:
牛传染性胸膜炎PCR 实验,以牛支原体为检测对象,核心是特异性扩增其 16S rRNA 保守基因。通过专属引物(仅与该基因序列互补结合),在 PCR 仪中经 30-40 次循环:94-95℃变性使 DNA 解旋,55-65℃退火让引物结合模板,72℃时 Taq 酶催化合成新链,实现靶基因指数级复制。扩增后经琼脂糖凝胶电泳,若出现预期大小条带为阳性(含病原),反之则为阴性,实现定性检测。
二、
实验准备
1、设配和材料
① Pipetty电动移液器MSIC01-03-250及配套吸头;
② PCR仪;
③ 高速台式冷冻离心机;
④ 瞬时离心机;
⑤ 涡旋混匀器。
2、试剂和材料
① 商品化基因组 DNA 提取试剂盒(商品化试剂);
② 引物;
③ 八连管或96孔板;
④ XPCR 反应预混合液(含 Tag 酶和染料);
⑤ 阳性对照:pUC-TM 质粒;
⑥ 阴性对照:无核酸酶水;
⑦ DNA 分子质量标准;
⑧ 1%琼脂糖凝胶。
三、实验步骤
1、使用商品化的基因组 DNA 提取试剂盒提取鼻拭子、血液、组织和体液样品的基因组 DNA,操作步骤参照试剂盒说明书。
2、标记96孔板,设置阴性对照和阳性对照,按表1反应体系将各试剂按需要的孔数加到EP管内,使用Pipetty的自动混匀模式,对试剂进行充分混合。使用Pipetty电动移液器,设置连续分液,将预混后的试剂,移取至96孔板中。取样品 DNA模板,按每孔/2μL,连续加入到96孔板内,短暂离心后,进行 PCR 扩增。
3、扩增程序为 95 ℃预变性 3min;94℃45s,57℃45s,72℃1min,35 个循环;72 ℃延伸 10min。以1%琼脂糖凝胶对扩增产物进行电泳检测。
四、结果判定
1、阴性对照不能扩增出任何条带,且阳性对照扩增出 300 bp 左右片段,则 PCR结果判定为有效。如阳性对照不能扩增出目的大小片段,或阴性对照扩增出目的片段,则 PCR 反应无效。
2、待检样品扩增出大小为 300bp 左右的一条特异性扩增条带,且与阳性对照条带分子质量大小相符,则待检样品判定为 Mmm 核酸阳性。
3、待检样品无特异性扩增条带,则判定为Mmm 核酸阴性。