欢迎回到《Binding Assays - More Than One Way to Achieve your Goals》系列。
在上一篇中,我们介绍了Binding Assay的基础概念、竞争结合实验以及吸光检测方法。本篇将进一步聚焦几种更高灵敏度的检测技术,包括:
这些技术正在越来越多地应用于药物研发、生物标志物分析以及复杂分子相互作用研究中。
基于荧光的Binding Assay
自然界中,能够在可见光波段产生荧光的化合物其实并不多。因此,在Binding Assay中,如果对配体或靶标生物分子进行荧光标记,通常能够显著提升实验灵敏度,相较于传统吸光法(Absorbance)具有明显优势。
一般来说,荧光检测能够实现:
此外,对于小分子、多肽以及蛋白而言,荧光标记通常也较容易实现,且已有大量成熟、低成本的标记试剂可供使用。
不过,荧光检测并非没有挑战。其中一个典型问题是:
荧光淬灭(Fluorescence Quenching)
当荧光标记的配体与细胞受体或大型生物分子结合后,可能会发生荧光信号减弱的现象。
造成荧光淬灭的原因包括:
这些因素都会影响荧光强度与实际配体浓度之间的对应关系。最终导致:
荧光偏振结合分析
虽然基于荧光的结合分析通常比吸光度检测更灵敏,但依然可能受到背景噪声的影响。特别是在细胞裂解液中检测生物标志物时,样品中的大量杂质往往会带来干扰,因此通常仍需要进行纯化步骤。
为降低这种非特异性背景信号,研究人员开发了多种光学检测技术。这类方法并非直接检测荧光团本身,而是通过调控检测方式来消除背景噪声,荧光偏振(Fluorescence Polarization,FP)便是其中之一。
荧光偏振的原理基于平面偏振光对荧光分子的激发。当荧光团被光激发后,在发射更长波长光之前,会存在一个短暂延迟,即“荧光寿命(fluorescence lifetime)”。
对于分子量较小(<20,000 Da)且标记了荧光素(fluorescein)的小分子而言,在荧光寿命期间,它们能够在缓冲液中快速旋转多次。因此,当大量这类分子同时被偏振光激发时,由于它们在发光时的取向彼此随机,最终发射出的光将呈现非偏振状态。
这一特性可以应用于结合分析。当小分子标记物以非共价方式结合到更大的蛋白质上,并且复合物总分子量超过30,000 Da时,在荧光寿命期间,该复合物几乎不会发生明显旋转(因为大分子在溶液中受到更大的阻力)。因此,如果用偏振光激发该复合物,其发射光依然会保持偏振状态(图1)。
这一特性已被广泛应用于结合分析。其优势在于:
不过,该方法也存在一定限制,即被标记的结合组分分子量需要低于30,000 Da(以荧光素为例),且越小越理想。否则,无论其是否与另一蛋白结合,都会发射偏振光,从而影响实验判断。
图1:利用荧光偏振监测生物分子-配体相互作用的实验原理。
在应用方面,一篇关于利用荧光偏振竞争实验测定降钙素和 AMYR 激动剂 AM833 驻留时间(Residence Time)的应用说明展示了:荧光偏振可用于测定配体-受体相互作用的结合与解离速率。
另一篇题为《利用荧光偏振评估青霉素与 PBP5 相互作用以研究抗生素耐药性的分子基础》的应用说明中,则利用荧光标记的青霉素衍生物,监测青霉素与不同变体青霉素结合蛋白5(PBP5)的相互作用。PBP5负责细菌细胞壁的交联形成。
此外,《利用荧光偏振测量重构生物钟系统》的应用说明则展示了另一类基于荧光偏振的检测案例:通过连续5天监测调控昼夜节律的 KaiA、KaiB 与 KaiC 蛋白之间的相互作用,研究生物钟节律变化。
时间分辨荧光(TRF)结合分析
另一种能够显著降低背景噪声的技术是时间分辨荧光(Time-Resolved Fluorescence,TRF)。其核心思路是利用不同荧光物质之间荧光寿命的差异,分离目标荧光信号。
大多数荧光团的荧光寿命都短于10 ns,而镧系元素如铕(europium)、铽(terbium)、镝(dysprosium)和钐(samarium)的荧光寿命则非常长,可达1 µs至1 ms。
在典型TRF结合分析中,通常会使用镧系元素对其中一个结合组分进行标记,并在其最大激发波长(347 nm)下进行激发。随后,在检测信号之前引入一段时间延迟(通常约400 µs)。
这段延迟时间可以使样品中杂质产生的短寿命背景荧光先行衰减,仅保留镧系元素的长寿命荧光信号用于检测。因此,相较于普通荧光结合分析,TRF具有更高的灵敏度,同时也减少了对样品纯化步骤的依赖。
TRF已被广泛应用于ELISA实验。例如,由 PerkinElmer(现为 Revvity)开发的 DELFIA TRF 检测系统,便采用铕标记进行检测。目前,市场上也已有大量针对不同生物标志物的配对抗体可供选择。
基于 FRET 的结合分析
FRET(荧光共振能量转移)是指激发能量在两个荧光团之间以非辐射方式进行转移。通常,直接被光激发的荧光团称为“供体(donor)”,而通过FRET被激发的荧光团称为“受体(acceptor)”。
只有当两个荧光团之间距离小于10 nm时,FRET才会发生。此外,供体的发射光谱还必须与受体的激发光谱存在重叠。
FRET已被广泛应用于结合分析(图2)。在实验中,两个结合组分(例如蛋白质或DNA)分别被不同荧光团标记。当二者形成非共价相互作用后,激发供体荧光团即可通过FRET使受体荧光团同时发光。
从某种意义上来说,FRET类似于一种“荧光级联”或“多米诺效应”:一个荧光团激发另一个荧光团,后者在未被直接激发的情况下释放荧光。
受体荧光团发出的FRET信号对所研究的结合相互作用具有高度特异性。因此,FRET分析通常比普通荧光分析更加灵敏,也大幅减少了实验中的纯化需求。许多实验甚至可以直接在细胞裂解液中完成。
不过,相比荧光偏振法,FRET的主要缺点在于需要对两个结合组分都进行标记,这会增加实验建立的复杂度与成本。
但与此同时,FRET结合分析并不受荧光偏振法中分子量限制的影响。
图2:FRET结合分析原理示意图。
应用说明《利用基于FRET的蛋白复合物测量结合Job Plot确定化学计量比》展示了:如何通过基于FRET的方法,在微孔板读板机上成功实现蛋白-蛋白相互作用化学计量比的分析。
在本系列文章的下一章节中,我们将进一步介绍更先进的检测模式,例如 TR-FRET 与 BRET。期待与您再次见面。
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