方案摘要:本方案旨在建立基于Pipetty电动移液器的牛羊副流感(BPIV3/CPIV3病毒核酸精准检测流程。通过Pipetty电动移液器的高精度移液与连续分液功能,实现样本核酸提取、RT-PCR反应体系配制、产物移取等全流程标准化操作,规避手动移液误差。流程核心为:样本预处理后提取病毒RNA,经反转录获得cDNA,精准配制PCR反应体系并设置阴阳性对照,上机扩增后通过琼脂糖凝胶电泳观察结果。该方案借助Pipetty电动移液器的温度补偿、轻便操作等优势,提升检测效率与结果可靠性,适配养殖场、检测机构等批量牛羊样本的副流感病毒快速筛查。
方案详情:
牛羊副流感病毒(BPIV3、CPIV3)为单股负链RNA病毒,本实验基于逆转录-聚合酶链反应技术,利用特异性引物对病毒RNA进行靶向检测。首先通过病毒RNA提取试剂盒裂解样本、释放病毒RNA,在反转录酶作用下将RNA逆转录为互补DNA(cDNA);随后以cDNA为模板,在PCR预混液提供的酶、dNTPs等条件下,通过引物特异性结合病毒靶基因序列,经PCR仪升温变性、降温退火、恒温延伸的循环反应,实现靶基因片段的大量扩增。最终通过琼脂糖凝胶电泳对扩增产物进行分离,依据特异性条带的有无及大小判定样本是否感染BPIV3或CPIV3,阴性对照无条带、阳性对照出现特异条带则试验成立,样本出现预期条带即为病毒核酸阳性。
二、
实验准备
1、仪器设配
除微生物实验室常规灭菌及培养设备外,其他设备和材料如下:
① Pipetty Pro 电动移液器MSIC01-03-20、MSIC01-03-250、MSIC01-03-1000;
② PCR 仪;
③ 电泳仪和水平电泳槽;
④ 凝胶成像仪或紫外透射仪;
⑤ 台式离心机;
⑥ 高速台式冷冻离心机;
⑦ 冰箱(2C~8℃、-20℃、-70℃等不同规格);
⑧ 生物安全柜。
2、试剂和材料
① 引物;
② BPIV3阳性对照;
③ CPIV3阳性对照;
④ 病毒RNA提取试剂盒;
⑤ 反转录试剂盒;
⑥ PCR预混液或一步法RT-PCR预混液;
⑦ 离心管(0.5mL、1.5mL、2mL、10mL、50mL等不同规格);
⑧ PCR反应管。
三、实验步骤
1、样本经预处理后取上清,采用Pipetty电动移液器精准移取样本至提取管,配合病毒RNA提取试剂盒完成核酸提取。
2、用反转录试剂盒将提取的核酸进行反转录,获得的cDNA置于-20℃冰箱中保存备用。若使用一步法RT-PCR预混液可省略此步骤。
3、将PCR反应各试剂于冰上融化后,借助Pipetty电动移液器的高精度连续分液功能,配制RT-PCR反应体系,将cDNA模板分别加入相应PCR反应管中,同时设阳性对照和阴性对照(去离子水),对PCR反应管进行编号。盖紧管盖后,500r/min离心30s。
上游引物(10 μmol/L) 0.5μL
下游引物(10 μmol/L) 0.5μL
2×PCR Mix 12.5μL
无核酶水 9.5μL
cDNA模板 2.0μL
总体积 25.0μL
4、将加样后的PCR反应管放入PCR仪中,按照表D.2中BPIV3或CPIV3的RT-PCR反应程序进行。若采用一步法RT-PCR预混液,可按照说明书操作。

5、 用Pipetty取PCR产物5uL~10uL,在1%~1.2%琼脂糖凝胶中进行电泳,使用凝胶成像系统或紫外透射仪观察结果。
四、结果判定
1、阴性对照无扩增条带,阳性对照出现符合大小的特异扩增条带,判为试验成立。
2、样品出现预期大小的扩增片段时,判定为病毒核酸检测阳性。样品未出现预期大小的扩增片段,判定病毒核酸检测阴性。BPIV3和CPIV3阳性结果对照图分别见图E.l和图E.2。