方案摘要:本方案依托RT-PCR检测技术,开展犬瘟病毒(CDV)核酸检测实验,全程采用Pipetty系列电动移液器完成试剂分装、样本加样、溶液转移等精准移液操作。通过Trizol法提取样本总RNA,经反转录、PCR扩增及琼脂糖凝胶电泳检测,结合阴阳性对照结果判定样本中犬瘟病毒核酸携带情况。Pipetty电动移液器可有效提升实验移液精度与重复性,降低人为操作误差,保障犬瘟病毒RT-PCR检测结果的准确性与可靠性,适用于犬瘟病毒的临床快速检测与样本筛查。
方案详情:
一、实验原理
犬瘟病毒(CDV)为RNA病毒,本实验基于反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)原理,先通过Trizol试剂提取待检样本中的病毒总RNA,再以RNA为模板,在反转录酶作用下合成cDNA,随后以cDNA为模板进行特异性PCR扩增。利用特异性引物扩增犬瘟病毒目的基因片段,通过琼脂糖凝胶电泳分离扩增产物,根据特异性核酸条带的有无及片段大小,判定样本是否携带犬瘟病毒。
二、实验准备
1、设配和材料
除微生物实验室常规灭菌及培养设备外,其他设备和材料如下:
① Pipetty电动移液器MSIC01-03-20,MSIC01-03-250,MSIC01-03-1000;
② 冰箱(4℃、-20℃、-70℃);
③ PCR仪;
④ 高速冷冻离心机(4℃、离心速度12000r/min以上);
⑤ 稳压稳流电泳仪和水平电泳槽;
⑥ 凝胶成像系统;
⑦ 无 RNA 酶离心管与带滤芯吸头。
2、主要试剂
① Trizol试剂:RNA 提取试剂,2℃~8℃保存,也可用商品化 RNA 提取试剂盒;
② 三氯甲烷;
③ 异丙醇;
④ DEPC水(0.1%);
⑤ 75%(体积分数)乙醇;
⑥ RT-PCR相关试剂;
⑦ 10×RT-PCRBuffer;
⑧ RTEnzymeMix;
⑨ 5×TBE电泳缓冲液。
三、实验步骤
1、取1.5mL无 RNA 酶离心管,按照样本数量编号,使用Pipetty电动移液器,每管加入750μL Trizol试剂后,再使用连续分液模式,分别加入处理好的待检样品上清液、CDV 阴性对照及 CDV 阳性对照 250μL,混匀模式,充分吹打20次~30次,4℃ 12000r/min离心10min。
2、使用Pipetty,取500μL上清液至新的1.5mL无 RNA 酶离心管中,连续分液模式,每管加入150μL三氯甲烷,于混匀器上混匀15s,4℃ 12000r/min离心15min。
3、取上清液至新的1.5 mL 无 RNA 酶离心管中,每管加入500μL 异丙醇,颠倒数次混合均匀,冰上静置10min,4℃ 12000r/min离心10min。
4、小心弃掉上清液,倒置在干净的吸水纸上晾干水分,沉淀用1mLDEPC水配制的75%(体积分数)乙醇清洗;4℃ 8000r/min离心10min。
5、小心弃掉上清液,倒置在干净的吸水纸上室温自然干燥10min,加入20μLDEPC 水溶解RNA 沉淀。
6、置于冰上备用,并于2h内进行 RT-PCR扩增,超过2h应置于-70℃冰箱中保存。
7、可使用等效的商品化试剂盒进行 RNA 提取。
8、使用Pipetty电动移液器,预先配置好RT-PCR反应体系,再使用连续分液模式,批量转移至96孔板或PCR管中。
9、将 PCR 管置 PCR 仪上按如下程序扩增:42℃ 反转录 30 min;94℃ 预变性 2 min;94℃变性30s,55 ℃退火30s,72℃延伸40s,进行35个循环;最后72℃延伸3min。
10、用 TBE电泳缓冲液配制1.5%的琼脂糖凝胶平板,将凝胶平板放入水平电泳槽中,使电泳缓冲液刚好没过胶面,将10μLPCR 产物和2μL 加样缓冲液(6×)混匀后缓慢加入样品孔中。电泳时应设立DNA 标准分子量对照。在120V、90 mA 条件下电泳约30 min,电泳结束后,用凝胶成像系统观察结果。
四、结果判定
1、 CDV 阳性对照样品扩增出大小为455bp的核酸片段,且阴性对照样品无扩增条带,则阴、阳性对照成立;否则试验结果无效,电泳图如下。
2、 在阴、阳性对照成立条件下,若待检样品扩增出大小为455bp的核酸片段,判为 CDV核酸阳性;若待检样品无扩增条带或扩增条带大小不为455bp,判为 CDV 核酸阴性。