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Pipetty电动移液器在猪口蹄疫定型PCR实验中的应用

2026-05-18     来源:广州程淇生物     点击次数:51

方案摘要:本方案聚焦猪口蹄疫病毒(FMDV)定型PCR检测全流程,深度融合Pipetty电动移液器精准移液、微量分液、程序记忆等核心特性,针对多重PCR实验中微量试剂移取、体系精准配制、96孔板批量加样等关键操作环节,达成匀速稳定的吸排液与精准控量分液,高效完成样本、引物、酶、缓冲液等试剂的批量加样操作。有效规避因手动移液器按压力度不均、吸排速度差异、手部抖动等人为因素引发的微量体积误差,减轻实验人员长时间操作所致的手部疲劳,解决因手动操作手法差异导致的实验重复性不佳等问题。提高PCR反应体系配制的一致性与加样均一性,保障实验结果的稳定性与重复性,为猪口蹄疫病毒血清型快速鉴别、病原精准筛查、流行病学监测提供高效、标准化、可追溯的实验操作支持,助力实验室提高检测效率、降低实验误差、规范操作流程。
 
 
方案详情:
一、实验原理
猪口蹄疫病毒(FMDV)为单股正链 RNA 病毒,分 7 血清型,定型 PCR 核心是 RT-PCR + 型特异性引物靶向 VP1 基因。先提取样本 RNA,经逆转录酶合成 cDNA;再用针对 O、A、Asia-Ⅰ 等不同型 VP1 高变区的特异性引物,经变性 - 退火 - 延伸循环扩增;扩增产物经电泳或荧光检测,仅对应型引物出现条带 / 荧光信号,从而精准判定血清型,实现快速分型诊断。
 
二、实验准备
1、器材
① Pipetty电动移液器MSIC01-03-20、MSIC01-03-250、MSIC01-03-1000及吸头;
② PCR扩增仪;
③ 台式低温高速离心机;
④ 稳压稳流电泳仪和水平电泳槽;
⑤ 凝胶成像仪(或紫外透射仪);
⑥ PCR扩增管。
 
 
2、试剂
① 下列为下游引物和分别检测FMDV7个血清型的上游引物:
a) 下游引I物(通用):5'-AGCTTGTACCAGGGTTTGGC-3'
b) 上游引物(O型):5'-GCTGCCYACYTCYTTCAA-3'
c) 上游引I物(A 型):5'-GTCATTGACCTYATGCAVACYCAC-3'
d) 上游引物(C 型):5'-GTTTCTGCACTTGACAACACA-3'
e) 上游引I物(Asia 1 型):5'-GACACCACHCARRACCGCCG-3'
f) 上游引I物(SAT 1 型):5' -AGGATTGCHAGYGAGACVCACAT-3'
g) 上引物(SAT2型):5'-GGCGTYGARAAACARYTBTG-3'
h) 上引I物(SAT3 型):5' - TTCGGDAGAYTGTTGTGTG-3'
其中Y,R,H,V,D为简并碱基,Y对应C/T,R对应A/G,H对应A/T/C,V对应G/A/C,D对应A/T/G。
② 总RNA提取试剂;
③ RT-PCR试剂盒;
④ 电泳试剂等。
 
      
 
三、实验步骤
1、核酸提取
a) 使用Pipetty电动移液器取待检样品、阴性对照、阳性对照各300ul分别置于1.5 mL离心管中,每管加入300ul 变SAC性液,反复混匀,冰水浴5min。
b) 设置连续分液模式,每管分别加入60ul 2mol/L乙酸钠(pH4.0),一键混匀。
c) 每管加800ul苯酚-三氯甲烷-异戊醇(25:24:1)混合液,冰水浴5min。
d)8000r/min离心10min。将上清液转入另一洁净离心管。
e) 加800ul异丙醇,混匀,室温放置15min。
f) 4℃,12000 r/min,离心10min,小心的倒掉上清液。尽量倒干液体,留下RNA沉淀。
g) 加1000ul 75%乙醇颠倒洗涤沉淀,4℃,10 000r/min,离心5 min,小心倒干液体,室温干5 min~10 min
h) 连续分液模式,每管加10ul无核酸酶水,用于溶解RNA。总RNA提取液可立即用于PCR扩增,也可-70℃冰箱保存备用。
 
2、 RT-PCR反应体系配制,采用25ul反应体系,使用Pipetty电动移液器配置扩增体系如下:
10×一步RNAPCR缓冲液                  2.5ul
MgCl2(25 mmol/L)                        2ul
dNTP( 10 mmol/L)                        2.5ul
RNase 酶抑制剂(40U/ul)                  0.5ul
AMV(5 U/ul)                             0.5ul
AMV-Optimized                           0.5ul
Taq (5 U/ul)下游通用引物(50 pmol/ul)    0.5ul
上游型特异性引物混合(各50pmol/ul)      0.5ul
总RNA水溶液                            12.5ul
  1. 将PCR扩增管盖紧管盖,放入扩增仪中按照设定程序扩增:50℃反转录30min,94 ℃ 预变性4 min;然后94 ℃变性50 s,58 ℃~60 ℃退火40 s,72 ℃延伸40 s,共进行30次循环:最后72℃延伸8 min。
  2. 扩增产物电泳检测
a) 1.5%琼脂糖凝胶板的制备:称取1.5 g琼脂糖,加入100 mL 1×TAE缓冲液中。加热融化后加5ul (10mg/mL)溴乙锭,混匀后倒入放置在水平台面上的凝胶盘中,胶板厚5mm左右。依据样品数选用适宜的梳子。待凝胶冷却凝固后拔出梳子(胶中形成加样孔),放入电泳槽中,加1×TAE缓冲液淹没胶面。
b) 使用Pipetty电动移液器,取6ul~8ul PCR扩增产物和2ul加样缓冲液混匀后加入一个加样孔。每次电泳同时设标准DNA Marker、阴性对照、阳性对照。
 
c) 电泳:电压 80 V~100 V或电流 40 mA~50 mA,电泳 30 min~40 min。
 
四、试验成立条件
电泳结束后,取出凝胶板置于凝胶成像仪(或紫外透射仪)上观察。阳性对照扩增产物电泳结果应分别为O型400 bp,A型730 bp,C型600 bp,Asia 1型300 bp,SAT1型430 bp,SAT2型260 bp,SAT3型380bp,阴性对照应无扩增条带。
五、结果判定
符合试验成立的条件。样品扩增产物的DNA条带与某型阳性对照条带分子量大小一致,则该待检样品为某型FMDV。如被检样品无扩增条带,则该样品为FMDV核酸阴性。
 
 
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